PCDHA7 (protocadherin alpha 7)

symbol:
PCDHA7
locus group:
other
location:
5q31.3
gene_family:
Clustered protocadherins
alias symbol:
CNR4|CRNR4
alias name:
KIAA0345-like 7|ortholog to mouse …
entrez id:
56141
ensembl gene id:
ENSG00000204963
ucsc gene id:
uc003lhq.2
refseq accession:
NM_018910
hgnc_id:
HGNC:8673
approved reserved:
2000-06-28
5q31.3
基因染色体位置图

PCDHA7(Protocadherin Alpha 7)属于原钙粘蛋白α基因家族(PCDHα家族),该家族是钙粘蛋白超家族的重要成员,主要参与细胞间粘附和信号传导。PCDHα家族基因的共同特点是编码跨膜蛋白,其胞外结构域含有多个钙离子结合位点,介导同源或异源相互作用,而胞内结构域则与细胞骨架或信号分子结合,调控神经元连接、突触形成和神经回路发育。PCDHA7在神经系统中高度表达,尤其在神经元中发挥关键作用,通过特异性识别机制促进神经元自我回避(self-avoidance)和靶向突触形成,确保神经网络的精确组装。其突变可能导致神经元迁移异常、突触功能紊乱,与自闭症谱系障碍(ASD)、精神分裂症等神经发育疾病相关。若PCDHA7过表达,可能破坏神经元间的选择性粘附平衡,导致突触过度修剪或异常连接;而表达降低则可能引发神经突触减少或错误导向,影响认知和行为功能。此外,PCDHA7的表观遗传失调(如启动子甲基化)在癌症中也有报道,可能通过改变细胞粘附特性促进肿瘤转移。该基因的调控异常还可能影响家族其他成员(如PCDHA1-PCDHA12)的协同表达,因其在染色体上成簇排列且共享调控元件。研究PCDHA7有助于理解神经发育疾病机制和潜在治疗靶点。

This gene is a member of the protocadherin alpha gene cluster, one of three related gene clusters tandemly linked on chromosome five that demonstrate an unusual genomic organization similar to that of B-cell and T-cell receptor gene clusters. The alpha gene cluster is composed of 15 cadherin superfamily genes related to the mouse CNR genes and consists of 13 highly similar and 2 more distantly related coding sequences. The tandem array of 15 N-terminal exons, or variable exons, are followed by downstream C-terminal exons, or constant exons, which are shared by all genes in the cluster. The large, uninterrupted N-terminal exons each encode six cadherin ectodomains while the C-terminal exons encode the cytoplasmic domain. These neural cadherin-like cell adhesion proteins are integral plasma membrane proteins that most likely play a critical role in the establishment and function of specific cell-cell connections in the brain. Alternative splicing has been observed and additional variants have been suggested but their full-length nature has yet to be determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是protocadherinα基因簇的一个成员,的三个相关的基因簇的五个染色体串联连接,展示类似于B细胞和T细胞受体基因簇的一个不寻常的基因组组织之一。阿尔法基因簇是由相关的小鼠的CNR基因15钙粘蛋白家族的基因和由13个高度相似和2更远亲编码序列。 15 N-末端外显子,或外显子可变的串联阵列,后跟下游C末端外显子,或外显子恒定,这是由该集群中的所有基因的共享。大的,不间断的N-末端的每个外显子编码6钙粘蛋白胞外结构域,而C末端的外显子编码的胞质域。这些神经钙粘蛋白样细胞粘附蛋白是一体的质膜蛋白,最有可能发挥在大脑细胞特异性细胞连接的建立和功能起关键作用。选择性剪接已经观察到的和额外的变体已经提出,但它们的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PCDHA7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs14615       rs31749       rs31871       rs31872       rs31873       rs31874       rs56002       rs56003       rs59479       rs151988       rs155358       rs155359       rs155360       rs155361       rs155362       rs155363       rs155364      

PCDHA7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTCTACAGACAATCCACGA
59
CTCCTCTAGGTGCACAGAG
59
ATTTATTGCTCACGGCCAC
59
AGTAATTGAACGGTGCCAG
58
TCTACAGACAATCCACGACAG
60
CTCCTCTAGGTGCACAGAG
59
CAGTTCTTGTGGAAGTTGTGG
60
AGGGAAGTGAGAGTCAACTG
59
CTACAGACAATCCACGACAG
58
CTCCTCTAGGTGCACAGAG
59
CAGTTCTTGTGGAAGTTGTG
57
AGGGAAGTGAGAGTCAACTG
59
      尚未收录相关数据

PCDHA7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCDHA7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9UN72 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q9UN72 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q9UN72 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q9UN72 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
Q9UN72 (UniProtKB)
TAS

可能调控 PCDHA7基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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