PCDHA10 (protocadherin alpha 10)

symbol:
PCDHA10
locus group:
other
location:
5q31.3
gene_family:
Clustered protocadherins
alias symbol:
CNR8|CRNR8|CNRN8|PCDH-ALPHA10
alias name:
KIAA0345-like 4|ortholog to mouse …
entrez id:
56139
ensembl gene id:
ENSG00000250120
ucsc gene id:
uc003lhx.4
refseq accession:
NM_018901
hgnc_id:
HGNC:8664
approved reserved:
2000-06-28
5q31.3
基因染色体位置图

PCDHA10是原钙粘蛋白α(protocadherin alpha)基因家族的一员,属于PCDHα基因簇的一部分。原钙粘蛋白家族是一类跨膜蛋白,主要参与细胞间粘附和信号传导,尤其在神经系统中发挥重要作用,调控神经元连接、突触形成和神经回路组装。PCDHA10编码的蛋白具有典型的钙粘蛋白结构域,通过钙离子依赖性机制介导同源或异源细胞间相互作用。该基因在发育中的大脑中高度表达,对神经元的自我回避(self-avoidance)和树突特化至关重要。PCDHA10的突变可能导致其蛋白功能异常,影响神经元间的识别与连接,与神经发育障碍如自闭症谱系障碍(ASD)和精神分裂症等疾病相关。研究表明,PCDHA10的单核苷酸多态性(SNPs)可能增加某些精神疾病的易感性。当PCDHA10过表达时,可能干扰正常的神经元网络形成,导致突触功能异常或过度连接;而表达降低则可能损害神经元的自我识别能力,引起神经回路紊乱。PCDHA10与其他PCDHα家族成员(如PCDHA1-PCDHA12)具有高度相似的基因组结构和功能特征,它们通过可变剪接产生多样性,共同调控神经系统的发育和功能。该基因家族的特点是具有多个可变外显子,每个外显子编码不同的细胞外结构域,从而产生大量异构体,为神经元提供独特的表面识别码。PCDHA10的功能障碍可能影响其他家族成员或下游信号分子的活性,进而扰乱神经发育过程。研究还发现PCDHA10在某些癌症中异常表达,可能参与肿瘤细胞的迁移和侵袭。

This gene is a member of the protocadherin alpha gene cluster, one of three related gene clusters tandemly linked on chromosome five that demonstrate an unusual genomic organization similar to that of B-cell and T-cell receptor gene clusters. The alpha gene cluster is composed of 15 cadherin superfamily genes related to the mouse CNR genes and consists of 13 highly similar and 2 more distantly related coding sequences. The tandem array of 15 N-terminal exons, or variable exons, are followed by downstream C-terminal exons, or constant exons, which are shared by all genes in the cluster. The large, uninterrupted N-terminal exons each encode six cadherin ectodomains while the C-terminal exons encode the cytoplasmic domain. These neural cadherin-like cell adhesion proteins are integral plasma membrane proteins that most likely play a critical role in the establishment and function of specific cell-cell connections in the brain. Alternative splicing has been observed and additional variants have been suggested but their full-length nature has yet to be determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是protocadherinα基因簇的一个成员,的三个相关的基因簇的五个染色体串联连接,展示类似于B细胞和T细胞受体基因簇的一个不寻常的基因组组织之一。阿尔法基因簇是由相关的小鼠的CNR基因15钙粘蛋白家族的基因和由13个高度相似和2更远亲编码序列。 15 N-末端外显子,或外显子可变的串联阵列,后跟下游C末端外显子,或外显子恒定,这是由该集群中的所有基因的共享。大的,不间断的N-末端的每个外显子编码6钙粘蛋白胞外结构域,而C末端的外显子编码的胞质域。这些神经钙粘蛋白样细胞粘附蛋白是一体的质膜蛋白,最有可能发挥在大脑细胞特异性细胞连接的建立和功能起关键作用。选择性剪接已经观察到的和额外的变体已经提出,但它们的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PCDHA10基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs14615       rs31749       rs31871       rs31872       rs31873       rs31874       rs56002       rs56003       rs59479       rs151988       rs155358       rs155359       rs155360       rs155361       rs155362       rs155363       rs155364      

PCDHA10基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTCGTGAAGGAGAACAACC
59
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
AATGGTAGATGTGGACGGG
59
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
GACCACTCTAGGAAGCCAC
60
CTCCTCTAGGTGCACAGAG
59
ATTTAGCTCTTTGGTCCCAC
58
TCCCGTCCTTTCGTTTATCC
60
CATTTAGCTCTTTGGTCCCAC
59
CCCGTCCTTTCGTTTATCC
58
CACTCTAGGAAGCCACGAC
60
CTCCTCTAGGTGCACAGAG
59
GGGAAGATCAGTCTATTGGAGG
60
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
TCGTGAAGGAGAACAACCC
60
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
GGAAGATCAGTCTATTGGAGGG
60
CTCTAGGTGCACAGAGCTG
60
TCATTTAGCTCTTTGGTCCC
58
CCGTCCTTTCGTTTATCCA
58
      尚未收录相关数据

PCDHA10基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCDHA10基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9Y5I2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q9Y5I2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q9Y5I2 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q9Y5I2 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q9Y5I2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
Q9Y5I2 (UniProtKB)
TAS

可能调控 PCDHA10基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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电话: 0531-88819269

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