PCAT6 (prostate cancer associated transcript 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT6
locus group:
non-coding RNA
location:
1q32.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
ncRNA-a2|PCAN-R1|KDM5BAS1|onco-lncRNA-96
alias name:
prostate cancer-associated noncodi…
entrez id:
100506696
ensembl gene id:
ENSG00000228288
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_046325
hgnc_id:
HGNC:43714
approved reserved:
2012-02-02

基因染色体位置

基因染色体位置

1q32.1
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2275891       rs2275892       rs2275893       rs2275894       rs2275895       rs4245713       rs6699000       rs12140749       rs74654674       rs76449900       rs77556400       rs111633511       rs114077339       rs116729297       rs117271214       rs137955287       rs138633428      

基因表达

基因表达

PCAT6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCCATCCAACTCCCAGAC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
CAAATATTTGTGGAGCGTGTG
59
GTCCATCCAACTCCCAGAC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
AATATTTGTGGAGCGTGTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
AGATGAGCTGAGATGGACTG
59
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
AGATGAGCTGAGATGGACTG
59
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
ATGAGCTGAGATGGACTGC
60
CATCCAACTCCCAGACCTC
60
ATATTTGTGGAGCGTGTGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT6基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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