PCAT29 (prostate cancer associated transcript 29)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT29
locus group:
non-coding RNA
location:
15q23
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
104472713
ensembl gene id:
None
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_126437
hgnc_id:
HGNC:50895
approved reserved:
2014-07-14

基因染色体位置

基因染色体位置

15q23
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene is thought to produce a functional long non-coding RNA. This transcript was identified in prostate cancer cells and may suppress tumor formation. [provided by RefSeq, Feb 2015]

该基因被认为是产生功能性长的非编码RNA。此转录物在前列腺癌细胞中鉴定，并且可以抑制肿瘤的形成。 [由RefSeq的，2015年2月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT29基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs750627       rs750628       rs890290       rs892417       rs892418       rs892419       rs1077109       rs1115635       rs1316731       rs1365168       rs1365169       rs1365170       rs1365171       rs1426072       rs1426073       rs1426074       rs1426077      

基因表达

基因表达

PCAT29基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGCATGTGACTTGATTTGG
57
TAGAGACTGAAATCGGAAAGTG
58
AGACAGAGGAATACCAGGAG
58
CTACAGGCAAAGCACTCTC
58
TGTTGAATTCAGGCATCGG
59
TTGATGGCATTCGGAAAGTG
59
GAAGAAGAGGAGTTTGGATGC
59
CATTCAGAAGGTATTTCCTGAGC
60
GCATGTGACTTGATTTGGTC
58
TAGAGACTGAAATCGGAAAGTG
58
TGTTGAATTCAGGCATCGG
59
TGATGGCATTCGGAAAGTG
59
GACAGAGGAATACCAGGAGAG
59
CTACAGGCAAAGCACTCTC
58
AAGAAGAGGAGTTTGGATGCT
60
CATTCAGAAGGTATTTCCTGAGC
60
GGCATGTGACTTGATTTGGT
59
CTCAGCTTGATGGCATTCG
59
GAAGAAGAGGAGTTTGGATGC
59
ATTCAGAAGGTATTTCCTGAGC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT29基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT29基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT29基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Prostatic Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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