PCAT19 (prostate cancer associated transcript 19)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT19
locus group:
non-coding RNA
location:
19q13.2
gene_family:
alias symbol:
LINC01190
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
100505495
ensembl gene id:
ENSG00000267107
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_040109
hgnc_id:
HGNC:49593
approved reserved:
2014-01-20

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT19基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs758643       rs887391       rs887392       rs1005643       rs1962625       rs1962626       rs1987757       rs2005832       rs2079809       rs2079810       rs2079811       rs2098106       rs2098107       rs2109233       rs2191139       rs2316974       rs4802119      

基因表达

基因表达

PCAT19基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCAGAACAGGGAGGAAGAG
59
AGCTCAGGAGAACAGTGTC
59
TCAGAACAGGATGGCAGAG
59
TCCATGAAACAGATGACTGGA
59
GGAGTGAGGTCTCATGTCTG
60
ATCTAGCTAGGCCTGTTCTG
59
TGTTTCATGGAATTCACCAGTC
59
TATCTCCAATGGTTCCTTCCTG
60
ACTCTGTTAGAAGAAGCATCAG
58
CAATGGTTCAGGGAGAAAGG
59
CCAATGACATCCAATGGAGG
59
TCCTGGTGGTTGTTTAATCAC
59
CAGAACAGGGAACCATTGG
59
CCAAGAAGATTCTTATCAGCTCC
59
AGAACAGGATGGAGTCTTGC
60
CCTTCAAAGAGTAATGAGTATCTCC
59
CAATGACATCCAATGGAGGA
58
TCCTGGTGGTTGTTTAATCAC
59
TGGAGTGAGGTCTCATGTC
58
TCTAGCTAGGCCTGTTCTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT19基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT19基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT19基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.12 1 1 GWASCAT

基因相关服务

基因相关服务

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