PCAT1 (prostate cancer associated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
PCAT-1|PCA1|PiHL
alias name:
p53 inhibiting lncRNA
entrez id:
100750225
ensembl gene id:
ENSG00000253438
ucsc gene id:
uc064qdc.1
refseq accession:
NR_045262
hgnc_id:
HGNC:43022
approved reserved:
2011-10-04

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs710885       rs710886       rs785002       rs785003       rs785004       rs785005       rs785006       rs814165       rs1026411       rs1031585       rs1551513       rs1551514       rs1551515       rs1902432       rs2015595       rs2124597       rs2606181      

基因表达

基因表达

PCAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCAGCCAGATGAAATGCT
57
TGAGGTGATTCTTAGAGTCCT
58
CGCAGATACATAAGACCATGG
59
CTCCGCTGCTTTATAACCC
58
GCAGATACATAAGACCATGGA
57
TCTCCGCTGCTTTATAACC
57
AGCCAGATGAAATGCTATGTG
59
TATGAGGTGATTCTTAGAGTCCTC
59
CGCAGATACATAAGACCATGG
59
TCCGCTGCTTTATAACCCA
59
ATCAGCCAGATGAAATGCT
57
GAGGTGATTCTTAGAGTCCTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.002714419 10 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Anemia 0.000271442 1 0 BeFree
Benign Prostatic Hyperplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Prostatic Intraepithelial Neoplasias 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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