PBX2P1 (PBX homeobox 2 pseudogene 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PBX2P1
locus group:
pseudogene
location:
3q24
gene_family:
TALE class homeboxes and pseudogenes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
5088
ensembl gene id:
ENSG00000244171
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NG_002434
hgnc_id:
HGNC:8635
approved reserved:
1990-09-10

基因染色体位置

基因染色体位置

3q24
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PBX2P1是一个假基因，属于PBX基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录转座产生的非功能性DNA序列，缺乏完整的编码能力或调控元件，因此不表达功能性蛋白。PBX基因家族包括PBX1、PBX2、PBX3和PBX4等成员，这些基因编码的蛋白质属于TALE（三氨基酸环扩展）类同源域蛋白，在胚胎发育、细胞分化和器官形成中起关键作用，尤其是作为转录因子与其他蛋白（如HOX蛋白）相互作用调控基因表达。PBX2P1作为PBX2的假基因，可能是在进化过程中通过复制或逆转录转座事件产生的，但由于突变积累（如移码突变、终止密码子提前出现或启动子缺失），它失去了编码功能蛋白的能力。假基因通常不直接影响机体功能，但近年研究发现某些假基因可能通过竞争性结合miRNA或作为lncRNA参与基因表达调控。PBX2P1的过表达或降低表达可能不会直接产生显著影响，但假基因有时可能通过调节其同源功能基因的表达或干扰RNA代谢间接影响细胞过程。PBX基因家族成员的功能异常与多种疾病相关，如白血病（PBX1易位）、先天性畸形（PBX3缺失）等，但PBX2P1作为假基因与疾病的直接关联尚未明确。研究假基因如PBX2P1有助于理解基因组进化、基因调控网络的复杂性以及假基因在疾病中的潜在作用。

None

无

OMIM数据库中对PBX2P1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PBX2P1基因的介绍

基因序列

基因序列

PBX2P1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PBX2P1基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

PBX2P1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCAGATCCGTCACATATACCA
59
GAACTCATTACATGCCTGCT
58
CCAGATCCGTCACATATACC
57
GAACTCATTACATGCCTGCT
58
CCCAGATCCGTCACATATACC
60
AACTCATTACATGCCTGCTC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PBX2P1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PBX2P1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PBX2P1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.000271442 1 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree
Tetralogy of Fallot 0.000271442 1 0 BeFree
Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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