PBX2 (PBX homeobox 2)

symbol:
PBX2
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.32
gene_family:
TALE class homeboxes and pseudogenes
alias symbol:
G17|HOX12|PBX2MHC
alias name:
None
entrez id:
5089
ensembl gene id:
ENSG00000204304
ucsc gene id:
uc003oav.2
refseq accession:
NM_002586
hgnc_id:
HGNC:8633
approved reserved:
1994-12-13
6p21.32
基因染色体位置图

PBX2(Pre-B-cell leukemia homeobox 2)属于PBX基因家族,该家族是一类同源盒(homeobox)基因,编码转录因子,在胚胎发育、细胞分化和器官形成中起关键作用。PBX家族成员(包括PBX1、PBX2、PBX3和PBX4)的共同特点是含有高度保守的同源结构域(homeodomain),能够与其他转录因子(如HOX蛋白)形成复合物,调控下游靶基因的表达,从而影响细胞命运和组织发育。PBX2主要在神经系统、造血系统和多种器官中表达,其编码的蛋白质通过与DNA结合或与其他蛋白相互作用,参与调控细胞增殖、分化和凋亡。PBX2在胚胎发育中尤为重要,特别是在中枢神经系统和造血干细胞的发育过程中发挥重要作用。PBX2的突变或表达异常可能导致其功能丧失或获得异常功能,进而影响正常发育或导致疾病。例如,PBX2的某些突变可能与白血病等血液系统恶性肿瘤的发生有关,因为PBX家族成员在造血干细胞的自我更新和分化中起调控作用。此外,PBX2的表达失调还可能与其他癌症(如乳腺癌和前列腺癌)的进展相关,因为它可以影响癌细胞的增殖和转移能力。如果PBX2过表达,可能会促进细胞增殖并抑制凋亡,从而增加肿瘤发生的风险;而降低PBX2表达则可能导致发育缺陷或造血功能障碍,因为其正常功能被削弱。PBX2还与其他基因(如HOX基因)协同作用,调控发育过程中的基因表达网络,因此其表达水平的改变可能影响整个基因调控网络的平衡。总之,PBX2是一个重要的转录调控因子,在发育和疾病中具有多重功能,其表达或活性的异常可能导致严重的病理后果。

This gene encodes a ubiquitously expressed member of the TALE/PBX homeobox family. It was identified by its similarity to a homeobox gene which is involved in t(1;19) translocation in acute pre-B-cell leukemias. This protein is a transcriptional activator which binds to the TLX1 promoter. The gene is located within the major histocompatibility complex (MHC) on chromosome 6. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的TALE / PBX homeob的广泛表达的成员牛家人。它是确定的其相似的其涉及t中的同源基因(1; 19)在急性前B细胞白血病易位。这种蛋白质是转录活化剂,其结合到TLX1启动子。该基因位于[由RefSeq的,2008年7月提供]染色体6.主要组织相容性复合体(MHC)内

PBX2基因的碱基序列:[NCBI]
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PBX2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs995       rs995       rs995       rs995       rs995       rs995       rs995       rs996       rs996       rs996       rs996       rs996       rs996       rs996       rs997       rs997       rs997      

PBX2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACCCATATCCTAGTGAGGAG
57
CAAACCAGTTGGAGACCTG
58
GAAACACGCCCTAAACTGC
60
CTGCCAGAAGCATGTTGTC
60
CATCTATGCTGTCAAGACCG
59
TGTCTCCAGATCCTGAGAG
58
AAATGAGGGCAAATGGCAG
59
CAGAGTGAACACTCCCTGG
60
ACCCATATCCTAGTGAGGAG
57
CAAACCAGTTGGAGACCTG
58
ACCCATATCCTAGTGAGGAG
57
CAAACCAGTTGGAGACCTG
58
TAACCCATATCCTAGTGAGGAG
58
AACCAGTTGGAGACCTGAG
59
TAACCCATATCCTAGTGAGGAG
58
AACCAGTTGGAGACCTGAG
59
TAACCCATATCCTAGTGAGGAG
58
AACCAGTTGGAGACCTGAG
59
GGAAACACGCCCTAAACTG
59
AGAAGCATGTTGTCCAAGC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
PBX2
EMX2
Activation
PBX2
FMO3
Unknown
PBX2
MEIS1
Unknown
PBX2
PF4
Activation
PBX2
UGT2B17
Unknown
PBX2
VCP
Unknown

PBX2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PBX2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003682
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P40425 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P40425 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P40425 (UniProtKB)
IDA
GO:0005667
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0008134
P40425 (UniProtKB)
IPI
GO:0009954
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0030326
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P40425 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
P40425 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PBX2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Asthma 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Dermatitis, Atopic 0.12 2 1 GWASCAT
Teratocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 0 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 0 GAD
Ulcerative Colitis 0.002367032 1 0 GAD
Spontaneous abortion 0.002367032 1 0 GAD
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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