PAXIP1 (PAX interacting protein 1)

symbol:
PAXIP1
locus group:
protein-coding gene
location:
7q36.2
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Trinucleotide repeat containing
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None
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22976
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HGNC:8624
approved reserved:
1999-11-25
7q36.2
基因染色体位置图

PAXIP1(PAX interacting protein 1)是一种重要的核蛋白,主要参与DNA损伤修复、转录调控和染色质重塑等生物学过程。它通过与转录因子PAX(配对盒基因家族成员)相互作用,调节基因表达,尤其在胚胎发育和细胞分化中发挥关键作用。PAXIP1的表达产物含有多个功能域,如BRCT结构域,使其能够与其他修复蛋白(如BRCA1、53BP1)结合,共同参与DNA双链断裂修复。该基因的主要作用位点在细胞核内,特别是在DNA损伤位点附近聚集,帮助维持基因组稳定性。PAXIP1的突变可能导致其功能丧失,进而影响DNA修复效率,增加细胞对辐射或化学诱变剂的敏感性,甚至可能促进肿瘤发生。研究表明,PAXIP1的异常表达与多种癌症(如乳腺癌、卵巢癌)相关,其低表达可能导致基因组不稳定性加剧,而过表达可能干扰正常的DNA修复平衡。PAXIP1属于一个功能多样的基因家族,其成员通常参与DNA修复和转录调控,家族共性包括含有保守的蛋白相互作用域(如BRCT结构域)以及与染色质重塑复合物的关联。此外,PAXIP1还通过调控组蛋白修饰(如H2AK119泛素化)影响基因沉默和染色质状态。如果PAXIP1表达水平异常,可能影响其他修复相关基因(如TP53、ATM)的功能,导致细胞周期检查点失控或凋亡异常。总之,PAXIP1在维持基因组稳定性和细胞稳态中扮演重要角色,其功能异常可能对机体产生广泛影响,尤其是增加癌症风险。

This gene is a member of the paired box (PAX) gene family and encodes a nuclear protein with six BRCT (breast cancer carboxy-terminal) domains. This protein plays a critical role in maintaining genome stability, condensation of chromatin and progression through mitosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是配对盒(PAX)基因家族的成员和编码核蛋白质具有六个BRCT(乳腺癌羧基末端)结构域。这种蛋白在通过有丝分裂维持基因组稳定性,染色质和进展的缩合关键作用。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PAXIP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1718       rs377850       rs395687       rs413354       rs431085       rs517881       rs4960660       rs4960661       rs4960662       rs28412080       rs56330306       rs73171087       rs75599696       rs78085661       rs80198385       rs112345790       rs112651172      

PAXIP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCTGCAGATCTTACAGACTC
60
GCATTTGTATGTCCCTGCTG
60
AGTGGAGATTCCAGAAGAAGG
59
AGTTGCTTATCAGACATCTGC
59
AGGTTATTCAGCTTCTCAAGG
58
AGATGACACCTTTACAACAGG
58
TTAATGGCTTATTTGGCAGGTG
60
CCAGTTGGTTCTTTACAGATGAG
60
AAGCTGCAGATCTTACAGAC
58
ATTTGTATGTCCCTGCTGG
58
TAATGGCTTATTTGGCAGGTG
59
CCAGTTGGTTCTTTACAGATGAG
60
GGTTATTCAGCTTCTCAAGGC
59
AGATGACACCTTTACAACAGGT
60
AGTGGAGATTCCAGAAGAAGG
59
GTTGCTTATCAGACATCTGCT
59
AAGTTCCTGAGGAGATGTTCAG
60
CCTTGAGAAGCTGAATAACCTG
59
AATGGCTTATTTGGCAGGTG
59
CCAGTTGGTTCTTTACAGATGAG
60
      尚未收录相关数据

PAXIP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAXIP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000416
Q6ZW49 (UniProtKB)
ISS
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Q6ZW49 (UniProtKB)
IEA
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IDA
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TAS
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TAS
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IMP
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Q6ZW49 (UniProtKB)
IMP
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ISS
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Q6ZW49 (UniProtKB)
IDA
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Q6ZW49 (UniProtKB)
IEA
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Q6ZW49 (UniProtKB)
IDA
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Q6ZW49 (UniProtKB)
ISS
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Q6ZW49 (UniProtKB)
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ISS
GO:0060261
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IMP
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Q6ZW49 (UniProtKB)
IEA
GO:0060717
Q6ZW49 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PAXIP1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alzheimer's Disease 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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