PAX9 (paired box 9)

symbol:
PAX9
locus group:
protein-coding gene
location:
14q13.3
gene_family:
Paired boxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
5083
ensembl gene id:
ENSG00000198807
ucsc gene id:
uc001wty.5
refseq accession:
NM_001372076
hgnc_id:
HGNC:8623
approved reserved:
1993-06-07
14q13.3
基因染色体位置图

PAX9(Paired Box 9)基因属于PAX基因家族,该家族由9个成员(PAX1-PAX9)组成,其共同特点是编码的蛋白质都含有一个高度保守的DNA结合结构域——配对盒(Paired Box),能够调控胚胎发育和组织分化。PAX9主要在胚胎发育过程中表达,特别是在颅面部、牙齿、四肢和内脏器官的形成中起关键作用。PAX9编码的蛋白质是一种转录因子,通过结合特定DNA序列调控下游靶基因的表达,从而影响细胞增殖、分化和凋亡。在牙齿发育中,PAX9对牙胚的形成和形态发生至关重要,其突变可导致先天性缺牙(少牙畸形)或牙齿发育异常。此外,PAX9还参与甲状腺、胸腺和胰腺等器官的发育。PAX9突变可能导致多种发育缺陷,如牙齿发育不全综合征(如少牙畸形)、颅面畸形或内分泌异常。某些研究表明,PAX9的表达异常可能与某些癌症(如甲状腺癌、肺癌)的发生发展相关,但其具体机制尚不完全清楚。如果PAX9过表达,可能促进细胞增殖并抑制凋亡,从而增加肿瘤风险;而降低表达则可能导致发育缺陷,如牙齿缺失或器官发育不全。PAX9与其他基因(如MSX1、BMP4)相互作用,共同调控发育过程。例如,PAX9和MSX1协同作用影响牙齿发育,若其中任一基因功能异常,均可能导致牙齿发育障碍。PAX基因家族的成员在胚胎发育中广泛参与组织器官的形成,其突变常导致先天性畸形或疾病。PAX9作为该家族的重要成员,其功能研究不仅有助于理解发育生物学机制,也对相关遗传性疾病的诊断和治疗具有重要意义。

This gene is a member of the paired box (PAX) family of transcription factors. Members of this gene family typically contain a paired box domain, an octapeptide, and a paired-type homeodomain. These genes play critical roles during fetal development and cancer growth. The specific function of the paired box 9 gene is unknown but it may involve development of stratified squamous epithelia as well as various organs and skeletal elements. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是配对盒(PAX)家族的转录因子的成员。此基因家族成员通常包含配对盒结构域,八肽,以及一个成对型同源异型域。这些基因发挥胎儿的发育和肿瘤生长过程中的关键作用。配对盒9基因的具体功能是未知的,但它可能涉及复层扁平上皮,以及各种器官和骨骼元件的发展。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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PAX9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs752132       rs2073240       rs2073241       rs2073242       rs2073243       rs2073244       rs2073245       rs2073246       rs2073247       rs2236007       rs2295221       rs2295222       rs4904155       rs7142363       rs8011628       rs8011668       rs11373281      

PAX9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGGTTGAAATTCTAGGTGAAGC
60
GCAAACTATCTTCTACCTTGGC
60
ATTCTCCGAGCATCTTCCG
60
TCTCTTTCAGGCTAGCTCC
59
ACGACTCATACAAGCAGCA
59
TAGATGTGGTTGTAGGGCAG
59
CAAGCACCAAATGGTCTCC
59
AGGTCATGTAAGGCGACAC
60
ATTCTCCGAGCATCTTCCG
60
AGACAGAAACTTTCCGCAC
58
ATTCTCCGAGCATCTTCCG
60
TCTCTTTCAGGCTAGCTCC
59
TATTCTCCGAGCATCTTCCG
60
CTCTTTCAGGCTAGCTCCC
60
GGTTGAAATTCTAGGTGAAGC
57
AGCAAACTATCTTCTACCTTGG
58
TATTCTCCGAGCATCTTCCG
60
GACAGAAACTTTCCGCACC
60
TATTCTCCGAGCATCTTCCG
60
CTCTTTCAGGCTAGCTCCC
60
      尚未收录相关数据

PAX9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAX9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000977
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0001228
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P55771 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0006366
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0007492
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0042476
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0042481
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
P55771 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0060325
P55771 (UniProtKB)
IEA
GO:0071363
P55771 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PAX9基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tooth Agenesis, Selective, 3 0.44 1 8 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Developmental absence of tooth 0.126720033 8 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.12 1 1 GWASCAT
Hypodontia 0.015863181 41 2 BeFree_GAD
Cleft Lip 0.005005506 3 0 BeFree_GAD
Cleft Palate 0.004734064 2 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Tooth Loss 0.001357209 5 0 BeFree
Cleft Lip with or without Cleft Palate 0.000542884 2 0 BeFree
Tooth Agenesis, Familial 0.000542884 2 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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