PAX3 (paired box 3)

symbol:
PAX3
locus group:
protein-coding gene
location:
2q36.1
gene_family:
PRD class homeoboxes and pseudogenes|Paired boxes
alias symbol:
HUP2|PAX-3
alias name:
None
entrez id:
5077
ensembl gene id:
ENSG00000135903
ucsc gene id:
uc002vmv.3
refseq accession:
NM_000438
hgnc_id:
HGNC:8617
approved reserved:
1992-01-14
2q36.1
基因染色体位置图

PAX3(Paired Box 3)基因属于PAX基因家族,该家族由9个成员(PAX1-PAX9)组成,其共同特点是编码含有保守的配对盒(paired box)结构域的转录因子,这些转录因子在胚胎发育过程中调控细胞分化、组织形成和器官发生。PAX3基因位于人类2号染色体(2q36.1),编码的蛋白质包含DNA结合结构域(配对盒和同源结构域),能够结合特定DNA序列并调控下游靶基因的表达。PAX3在神经嵴细胞、骨骼肌前体细胞和中枢神经系统的发育中起关键作用,参与黑色素细胞、周围神经系统和肌肉组织的形成。PAX3突变可导致Waardenburg综合征(1型和3型),表现为听力损失、色素异常和神经嵴衍生组织的发育缺陷。此外,PAX3基因易位(如与FOXO1融合形成PAX3-FOXO1融合基因)与儿童横纹肌肉瘤(一种软组织肉瘤)的发生密切相关。PAX3过表达可能促进细胞增殖、迁移和侵袭,与肿瘤转移相关;而PAX3表达降低则可能导致神经嵴细胞迁移障碍或肌肉发育异常。PAX3还与其他基因如MITF(小眼畸形相关转录因子)相互作用,共同调控黑色素细胞的分化和存活。PAX基因家族的成员通常参与早期发育过程,并在多种组织中发挥调控作用,其突变或表达异常常导致先天性畸形或癌症。

This gene is a member of the paired box (PAX) family of transcription factors. Members of the PAX family typically contain a paired box domain and a paired-type homeodomain. These genes play critical roles during fetal development. Mutations in paired box gene 3 are associated with Waardenburg syndrome, craniofacial-deafness-hand syndrome, and alveolar rhabdomyosarcoma. The translocation t(2;13)(q35;q14), which represents a fusion between PAX3 and the forkhead gene, is a frequent finding in alveolar rhabdomyosarcoma. Alternative splicing results in transcripts encoding isoforms with different C-termini. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是配对盒(PAX)家族的转录因子的成员。在PAX家族的成员通常包含一个配对盒域和配对型同源。这些基因胚胎发育过程中发挥关键作用。在配对盒基因的突变3与瓦登伯革氏症候群,颅面耳聋手综合征,和肺泡横纹肌肉瘤有关。该易位t(2; 13)(Q35; Q14),它代表PAX3和叉头基因之间的融合,是在肺泡横纹肌肉瘤经常发现。选择性剪接的结果与编码不同的C末端亚型成绩单。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

PAX3基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
PAX3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs751576       rs751577       rs3770210       rs3835977       rs6436310       rs6717451       rs6754024       rs7557746       rs7583923       rs10193524       rs10210219       rs11397969       rs12623857       rs12694578       rs13405641       rs16863657       rs28945085      

PAX3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACATCTATTCCACAAGCTGTG
58
TTGGTGTACAGTGCTTGGA
59
ATGTTCAGCTGGGAAATCC
58
GCTGATGGAACTCACTGAC
58
CTATTCCACAAGCTGTGTCAG
59
TGCTTTGGTGTACAGTGCT
60
ATGTTCAGCTGGGAAATCC
58
CTGATGGAACTCACTGACG
58
CATCTATTCCACAAGCTGTGTC
60
TTTGGTGTACAGTGCTTGGA
60
CATGTTCAGCTGGGAAATCC
59
TGATGGAACTCACTGACGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
PAX3
BCL2L1
Activation
PAX3
CXCR4
Activation
PAX3
DPYSL2
Unknown
PAX3
MET
Unknown
PAX3
MITF
Activation
PAX3
MITF
Repression
PAX3
MITF
Unknown
PAX3
SHH
Unknown
POU3F2
PAX3
Unknown
STAT3
PAX3
Repression

PAX3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAX3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003700
P23760 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P23760 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P23760 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
P23760 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
P23760 (UniProtKB)
TAS
GO:0006366
P23760 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
P23760 (UniProtKB)
TAS
GO:0007399
P23760 (UniProtKB)
IEA
GO:0007517
P23760 (UniProtKB)
IEA
GO:0007605
P23760 (UniProtKB)
TAS
GO:0009887
P23760 (UniProtKB)
TAS
GO:0014029
P23760 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P23760 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
P23760 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
P23760 (UniProtKB)
IDA
GO:0071837
P23760 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PAX3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Craniofacial deafness hand syndrome 0.480542884 3 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
Waardenburg Syndrome Type 1 0.448957582 38 5 BeFree_CLINVAR_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Alveolar rhabdomyosarcoma 0.357770146 102 0 BeFree_CTD_human_LHGDN_MGD_ORPHANET
Klein's Syndrome 0.241085767 6 1 BeFree_ORPHANET_UNIPROT
Waardenburg Syndrome 0.137392143 46 1 BeFree_CTD_human_LHGDN
Neural Tube Defects 0.12272435 3 0 CTD_human_LHGDN
Sarcoma 0.122171535 8 0 BeFree_CTD_human
Spina Bifida 0.121900093 10 0 BeFree_CTD_human
Congenital Hand Deformities 0.12 1 0 CTD_human
Congenital neurologic anomalies 0.12 1 0 CTD_human

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。