PARD3B (par-3 family cell polarity regulator beta)

symbol:
PARD3B
locus group:
protein-coding gene
location:
2q33.3
gene_family:
alias symbol:
Par3L|PAR3beta
alias name:
None
entrez id:
117583
ensembl gene id:
ENSG00000116117
ucsc gene id:
uc002var.2
refseq accession:
NM_057177
hgnc_id:
HGNC:14446
approved reserved:
2001-01-26
2q33.3
基因染色体位置图

PARD3B(Partitioning Defective 3 Homolog B)属于PAR(Partitioning Defective)基因家族,该家族成员主要参与细胞极性(cell polarity)的建立与维持,对细胞分裂、迁移及组织发育至关重要。PARD3B编码的蛋白质是极性复合体(polarity complex)的核心组分,通过与PARD6和PKC家族成员结合形成复合物,调控细胞顶端-基底极性(apical-basal polarity),影响上皮细胞屏障功能、神经元轴突导向及器官形态发生。其作用位点集中在细胞膜或细胞连接处(如紧密连接tight junction),尤其在神经组织、肾脏和视网膜中高表达。突变可能导致极性紊乱,与多种疾病相关,例如:生殖系统异常(如不孕症)、神经发育障碍(如自闭症谱系障碍)及癌症(如乳腺癌转移)。若PARD3B过表达,可能破坏正常极性信号,促进肿瘤细胞侵袭;而表达降低则可能导致上皮屏障功能障碍或神经突触异常。PAR基因家族的共性在于均含有PDZ(一种蛋白质相互作用结构域)和CARD(半胱天冬酶募集结构域)等保守结构域,通过调控细胞骨架重排和膜运输维持极性。目前研究还发现PARD3B与Wnt/β-catenin通路存在交叉对话,其异常表达可能间接影响其他极性基因(如PARD3、SCRIB)的功能。中文术语“分选缺陷”是对“Partitioning Defective”的直译,但更准确的表述应为“细胞极性调控”。

None

PARD3B基因的碱基序列:[NCBI]
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PARD3B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2080601       rs2098461       rs2193448       rs10205296       rs11691772       rs11693425       rs72930286       rs73059050       rs74776732       rs75589045       rs76045553       rs76616251       rs76689095       rs76784039       rs77256211       rs78172638       rs79242378      

PARD3B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCAATTGTGGACTGTTTCTC
58
CTTGGAGATTAACACTGGGA
57
GTATGACCTACTCTGGGTGC
60
TGGGTAAGGATGCGTACTG
59
GAAGGGTCCTGGTTACTGG
59
ACACAGCAATCAGCTTGTC
59
GAAGGGTCCTGGTTACTGG
59
AACACAGCAATCAGCTTGTC
60
GGGAGAAGGCATGATATCTC
57
GATATCCTGCAATTCCACCA
58
GAAGGGTCCTGGTTACTGG
59
AACACAGCAATCAGCTTGTC
60
GAATATACAGATGGAGGAATCCTG
59
ACACAGCAATCAGCTTGTC
59
GCAATGAGAGCTTTAGAGCA
58
TCTTATCAGACAGACCGTCAG
59
ATTTGAAAGCCTCGAAGAGC
59
TATCAGACAGACCGTCCGA
60
ATTTGAAAGCCTCGAAGAGC
59
TATCAGACAGACCGTCCGA
60
      尚未收录相关数据

PARD3B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PARD3B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005923
Q8TEW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
Q8TEW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0012505
Q8TEW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q8TEW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0051301
Q8TEW8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PARD3B基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Autistic Disorder 0.12 1 1 GWASCAT
Acquired Immunodeficiency Syndrome 0.12 1 1 GWASCAT
Narcolepsy 0.002367032 1 0 GAD
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.002367032 1 0 GAD
Drug-Induced Liver Injury 0.002367032 1 0 GAD
Osteoarthritis, Knee 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Osteoarthritis of distal interphalangeal joint 0.000271442 1 0 BeFree
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree
Osteoarthritis of the hand 0.000271442 1 0 BeFree

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