PAPSS2 (3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2)

symbol:
PAPSS2
locus group:
protein-coding gene
location:
10q23.2-q23.31
gene_family:
alias symbol:
ATPSK2
alias name:
PAPS synthase 2|adenosine 5'-phosp…
entrez id:
9060
ensembl gene id:
ENSG00000198682
ucsc gene id:
uc001kex.4
refseq accession:
NM_001015880
hgnc_id:
HGNC:8604
approved reserved:
1999-01-29
10q23.2-q23.31
基因染色体位置图

PAPSS2(3'-磷酸腺苷-5'-磷酰硫酸合成酶2)是一种关键的代谢酶,属于PAPSS基因家族,该家族还包括PAPSS1。PAPSS基因家族的共性在于它们都参与硫酸化反应,催化无机硫酸盐与ATP结合形成3'-磷酸腺苷-5'-磷酰硫酸(PAPS),这是体内硫酸化反应的通用硫酸供体。PAPSS2主要在肝脏、软骨和肾脏中高表达,其表达产物对多种生物分子的硫酸化修饰至关重要,包括糖胺聚糖(如硫酸软骨素和硫酸肝素)、类固醇激素和某些药物代谢产物。PAPSS2的功能异常会导致硫酸化底物不足,影响细胞外基质的组装、信号传导和解毒过程。PAPSS2突变与多种疾病相关,最典型的是导致骨骼发育异常的常染色体隐性遗传病——brachyolmia(短躯干侏儒症),表现为身材矮小、椎体扁平和其他骨骼畸形。此外,PAPSS2功能缺陷还与早发性骨关节炎、激素代谢紊乱和某些癌症的发展有关。PAPSS2过表达可能增强硫酸化反应,改变细胞外基质组成,影响肿瘤微环境,促进某些癌症的侵袭和转移;而PAPSS2表达降低则会导致硫酸化底物不足,影响软骨发育和骨骼生长,并可能改变药物代谢效率。研究表明PAPSS2与Wnt/β-catenin和TGF-β信号通路存在相互作用,其表达水平变化可能影响这些通路的活动。由于PAPSS2在硫酸代谢中的核心作用,它也成为某些代谢性疾病和癌症治疗的潜在靶点。

Sulfation is a common modification of endogenous (lipids, proteins, and carbohydrates) and exogenous (xenobiotics and drugs) compounds. In mammals, the sulfate source is 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS), created from ATP and inorganic sulfate. Two different tissue isoforms encoded by different genes synthesize PAPS. This gene encodes one of the two PAPS synthetases. Defects in this gene cause the Pakistani type of spondyloepimetaphyseal dysplasia. Two alternatively spliced transcript variants that encode different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

硫酸化是内生的(脂类,蛋白质和碳水化合物)和外源性(异生素和药物)的化合物的一个共同的变形例。在哺乳动物中,硫酸盐源是3‘-phosphoadenosine -5‘-磷酸硫酸(PAPS),从ATP和无机硫酸盐创建。由不同的基因编码的两种不同亚型的组织合成PAPS。该基因编码在两个PAPS合成酶之一。这种基因缺陷导致巴基斯坦类型spondyloepimetaphyseal发育不良。两个编码不同同种型的可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

PAPSS2基因的碱基序列:[NCBI]
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PAPSS2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1555433       rs1555434       rs2145818       rs2145819       rs2180968       rs2180969       rs2255682       rs2255683       rs2255684       rs2281803       rs2302402       rs2755425       rs2755426       rs2762526       rs2762527       rs4494234       rs4532940      

PAPSS2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATCATTCCATTCCGAGTGG
58
AACTCATTGTGCCTTGCTG
59
GATGATTGTACTGGTTACTGAATGG
60
GATTTCTGCTGGTTCTCTATGTG
59
CTTCTGTAGGGTCTCGGAG
58
ATTTCTGCTGGTTCTCCTG
57
CTCAGATGATTGTACTGGTTACTG
59
CTGCTGGTTCTCTATGTGTC
58
AAATGAATGCTGATGCGGT
58
GAGTGTCCTGCATCAACAG
58
TCTTCTGTAGGGTCTCGGA
59
TTTCTGCTGGTTCTCCTGG
59
AAACCAATTTGTCCACAGTGAG
59
TAGTATAGGGTACAATGTTCTGCTC
60
CTCAGATGATTGTACTGGTTACTG
59
TGCTGGTTCTCTATGTGTCC
59
CTTCTGTAGGGTCTCGGAG
58
TTTCTGCTGGTTCTCCTGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SP2
PAPSS2
Unknown

PAPSS2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PAPSS2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000103
O95340 (UniProtKB)
IBA
GO:0000103
O95340 (UniProtKB)
IEA
GO:0001501
O95340 (UniProtKB)
TAS
GO:0004020
O95340 (UniProtKB)
IBA
GO:0004020
O95340 (UniProtKB)
TAS
GO:0004781
O95340 (UniProtKB)
ISS
GO:0004781
O95340 (UniProtKB)
TAS
GO:0005524
O95340 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
O95340 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O95340 (UniProtKB)
TAS
GO:0007596
O95340 (UniProtKB)
IEA
GO:0016310
O95340 (UniProtKB)
IEA
GO:0016779
O95340 (UniProtKB)
ISS
GO:0050428
O95340 (UniProtKB)
IBA
GO:0050428
O95340 (UniProtKB)
TAS
GO:0060348
O95340 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PAPSS2基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Spondyloepimetaphyseal Dysplasia, Pakistani Type 0.560271442 3 10 BeFree_CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Spondyloepiphyseal dysplasia tarda, Toledo type 0.12 0 0 ORPHANET
Brachyolmia, recessive Hobaek type 0.12 0 0 ORPHANET
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Dwarfism 0.000271442 1 0 BeFree
Shortened trunk 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Anovulation 0.000271442 1 0 BeFree
Skeletal dysplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Chondrodysplasia 0.000271442 1 0 BeFree

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