PABPC5-AS1 (PABPC5 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PABPC5-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
Xq21.31
gene_family:
alias symbol:
OTTHUMG00000021960
alias name:
None
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102724167
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ENSG00000234161
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uc065aep.1
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hgnc_id:
HGNC:31845
approved reserved:
2006-06-30

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq21.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PABPC5-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体Xq21.1区域，与PABPC5基因的反义链重叠。作为PABPC5的反义转录本，它可能通过顺式或反式调控机制影响PABPC5的表达或功能。PABPC5属于多聚腺苷酸结合蛋白（PABP）家族，该家族成员通常参与mRNA的稳定性、翻译调控和转运，通过与mRNA的poly(A)尾结合发挥作用。PABPC5-AS1的具体生物学功能尚不完全明确，但研究表明lncRNA通常参与染色质重塑、转录调控、剪接调控等过程，可能影响细胞增殖、分化或疾病发展。目前关于PABPC5-AS1突变的研究较少，但lncRNA的异常表达或突变可能导致其靶基因失调，进而影响相关通路。有研究提示PABPC5-AS1可能与某些癌症相关，但其具体作用机制仍需进一步探索。如果PABPC5-AS1过表达，可能通过干扰PABPC5的正常功能影响mRNA代谢，导致翻译异常；而降低表达则可能解除对PABPC5的抑制，增强其活性。PABPC5属于PABP基因家族，该家族成员具有保守的RNA识别基序（RRM）和PABP-C结构域，能够结合poly(A)并与其他翻译起始因子相互作用。由于PABPC5-AS1研究尚处于早期阶段，其详细功能、调控网络及疾病关联需要更多实验验证。

None

无

OMIM数据库中对PABPC5-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PABPC5-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

PABPC5-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PABPC5-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs781670452       rs781301174       rs781599854       rs781043283       rs780932642       rs780932010       rs780742819       rs780637284       rs780480803       rs780457310       rs780443596       rs780265993       rs780241448       rs780172326       rs780058298       rs779989801       rs779977024      

基因表达

基因表达

PABPC5-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PABPC5-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PABPC5-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PABPC5-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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