PABPC4基因详情-基因数据库-基因云馆

PABPC4 (poly(A) binding protein cytoplasmic 4)

symbol:: PABPC4
locus group:: protein-coding gene
location:: 1p34.3
gene_family:: RNA binding motif containing
alias symbol:: iPABP|APP-1
alias name:: activated-platelet protein 1|Induc…
entrez id:: 8761
ensembl gene id:: ENSG00000090621
ucsc gene id:: uc001cdm.3
refseq accession:: NM_001135653
hgnc_id:: HGNC:8557
approved reserved:: 1999-12-17

1p34.3

PABPC4（Poly(A) Binding Protein Cytoplasmic 4）属于多聚腺苷酸结合蛋白（PABP）家族，该家族成员共同特点是能够结合mRNA的poly(A)尾巴，参与mRNA的稳定性调控、翻译起始及降解过程。PABPC4主要在细胞质中表达，通过与poly(A)尾结合促进mRNA的环化结构形成，从而增强翻译效率并保护mRNA免受核酸酶降解。该基因在多种组织中广泛表达，尤其在睾丸中表达较高，暗示其可能在生殖细胞发育中发挥作用。PABPC4的突变可能导致mRNA代谢异常，影响蛋白质合成，进而干扰细胞正常功能。研究表明，PABPC4与癌症发生发展相关，例如在某些肿瘤中过表达可能通过增强癌基因mRNA的翻译促进肿瘤生长，而低表达则可能削弱细胞增殖能力。此外，PABPC4还参与病毒感染后的免疫应答调控，其表达水平变化可能影响宿主抗病毒反应。PABPC家族成员（如PABPC1、PABPC3等）均具有保守的RNA结合域，但各成员在组织分布和功能上存在差异，PABPC4因其独特表达模式可能在某些特定生理或病理过程中发挥不可替代的作用。过表达PABPC4可能加剧某些疾病如癌症的进展，而敲低其表达则可能成为潜在治疗策略，但具体机制仍需进一步研究。

Poly(A)-binding proteins (PABPs) bind to the poly(A) tail present at the 3-prime ends of most eukaryotic mRNAs. PABPC4 or IPABP (inducible PABP) was isolated as an activation-induced T-cell mRNA encoding a protein. Activation of T cells increased PABPC4 mRNA levels in T cells approximately 5-fold. PABPC4 contains 4 RNA-binding domains and proline-rich C terminus. PABPC4 is localized primarily to the cytoplasm. It is suggested that PABPC4 might be necessary for regulation of stability of labile mRNA species in activated T cells. PABPC4 was also identified as an antigen, APP1 (activated-platelet protein-1), expressed on thrombin-activated rabbit platelets. PABPC4 may also be involved in the regulation of protein translation in platelets and megakaryocytes or may participate in the binding or stabilization of polyadenylates in platelet dense granules. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008]

保利（A）结合蛋白（PABPs）结合的poly（A）尾巴出现在大多数真核mRNA的3贷结束。 PABPC4或IPABP（可诱导PABP）分离为编码蛋白质的活化诱导的T细胞的mRNA。 T细胞的活化T细胞中增加的PABPC4 mRNA水平约5倍。 PABPC4包含4个RNA结合结构域和富含脯氨酸的C末端。 PABPC4本地化主要细胞质中。因此建议PABPC4可能在活化的T细胞不稳定mRNA种类的稳定性的调节是必要的。 PABPC4也被确定作为抗原，APP1（活化血小板蛋白-1），表示关于凝血酶激活的兔血小板。 PABPC4也可参与蛋白质翻译的血小板和巨核细胞的调节，或者可以参与血小板致密颗粒polyadenylates的结合或稳定。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的，2008年10月提供]

OMIM数据库中对PABPC4基因的介绍 Wikipedia数据库中对PABPC4基因的介绍

PABPC4基因的碱基序列：[NCBI]

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PABPC4基因的碱基突变：仅显示部分snp

rs9820 rs1058524 rs2068473 rs2068663 rs2242500 rs2293476 rs3768320 rs3768321 rs3835698 rs4660836 rs9438926 rs11206343 rs11577939 rs11810943 rs12069472 rs12097285 rs12117267

PABPC4基因在不同组织中的表达： [UniProt]

正向引物序列

正向Tm值

反向引物序列

反向Tm值

评分

CAGTCAGTTTGGTAAGACCC

58

TAACTCACAAAGCCAAAGCC

59

ATGACCGCAAAGTATTTGTGG

60

TGAATTCCTTGGCTTTGGC

59

CAGTCAGTTTGGTAAGACCCT

60

TAACTCACAAAGCCAAAGCC

59

GCCTCCATATTATACACCTAACC

58

ATTCCTTGGAAGCCTTGAG

57

GGAACAGAAGCAGATGCTG

59

CCAGCCAGATTTGAATGCA

59

CTCCAACTGGGTCTGAGTG

60

GCTAAGTTCTGCACAGCTG

59

GGAAGATCACGGGAATGCT

60

CAGCTTCATCCACCTTGGA

60

AACGAATCCTCGGAGAACC

60

GCGAAGCTCCAAATTTCCC

60

CAAAGCCAAGGAATTCACCA

59

CTCTTCCACAGCCAAACTG

59

TGCCTACGTCAACTTCCAG

60

AAAGTTCATGGTGTCCAAAGC

60

尚未收录相关数据

PABPC4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt] [GenomeNet]

质膜
细胞质
细胞外
高尔基体
囊泡
细胞骨架
内质网
细胞核
内体
溶酶体
线粒体

PABPC4基因的本体（GO）信息：

GO库代码

对应的蛋白质

来源代码

GO:0000166

B1ANR0 (UniProtKB)

IEA

GO:0003723

B1ANR0 (UniProtKB)

IEA

GO:0005737

B1ANR0 (UniProtKB)

IDA

GO:0000166

B1ANR1 (UniProtKB)

IEA

GO:0003676

B1ANR1 (UniProtKB)

IEA

GO:0000166

H0Y5F5 (UniProtKB)

IEA

GO:0003723

H0Y5F5 (UniProtKB)

IEA

GO:0005737

H0Y5F5 (UniProtKB)

IEA

GO:0003723

H0Y6X6 (UniProtKB)

IEA

GO:0000166

H0YCC8 (UniProtKB)

IEA

GO:0003676

H0YCC8 (UniProtKB)

IEA

GO:0000166

H0YEQ8 (UniProtKB)

IEA

GO:0003676

H0YEQ8 (UniProtKB)

IEA

GO:0003723

H0YER0 (UniProtKB)

IEA

GO:0000166

H0YEU6 (UniProtKB)

IEA

GO:0003676

H0YEU6 (UniProtKB)

IEA

GO:0000166

Q13310 (UniProtKB)

IEA

GO:0005515

Q13310 (UniProtKB)

IPI

GO:0005634

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0005737

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0005737

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0005737

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0006396

Q13310 (UniProtKB)

TAS

GO:0006401

Q13310 (UniProtKB)

TAS

GO:0006412

Q13310 (UniProtKB)

TAS

GO:0007596

Q13310 (UniProtKB)

TAS

GO:0008143

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0008266

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0010494

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0030529

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0044822

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0044822

Q13310 (UniProtKB)

IDA

GO:0017130

Q13310 (UniProtKB)

IDA

可能调控 PABPC4基因的相关microRNA：

hsa-miR-124 hsa-miR-16 hsa-miR-192 hsa-miR-98 hsa-miR-125b hsa-miR-186 hsa-miR-215 hsa-miR-615-3p

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

序号	作用方式	资源库来源/分值	基因名称	基因名称

KEGG

名称
3013 RNA transport [PATH:hsa03013]
3015 mRNA surveillance pathway [PATH:hsa03015]
3018 RNA degradation [PATH:hsa03018]

疾病名称

关系值

NofPmids

NofSnps

来源

疾病名称	关系值	NofPmids	NofSnps	来源
IGA Glomerulonephritis	0.12	1	0	CTD_human
Down Syndrome	0.000542884	2	0	BeFree
Neurofibrillary degeneration (morphologic abnormality)	0.000542884	2	0	BeFree
Stage III Colorectal Cancer	0.000271442	1	0	BeFree
Colorectal Cancer	0.000271442	1	0	BeFree
Central neuroblastoma	0.000271442	1	0	BeFree
Stage III Colorectal Cancer AJCC v7	0.000271442	1	0	BeFree
Colorectal Neoplasms	0.000271442	1	0	BeFree
Colorectal Carcinoma	0.000271442	1	0	BeFree
Cervix carcinoma	0.000271442	1	0	BeFree

PABPC4 (poly(A) binding protein cytoplasmic 4)

基因基本信息

基因基本信息

基因染色体位置

基因染色体位置

基因简述

基因简述

基因序列

基因序列

基因突变

基因突变

基因表达

基因表达

基因引物

基因引物

转录因子

转录因子

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基因相关microRNA

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