P2RX5-TAX1BP3 (P2RX5-TAX1BP3 readthrough (NMD candidate))

symbol:
P2RX5-TAX1BP3
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other
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17p13.2
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NR_037928
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HGNC:49191
approved reserved:
2013-09-25
17p13.2
基因染色体位置图

P2RX5-TAX1BP3是一个融合基因,由P2RX5(嘌呤能受体P2X配体门控离子通道5)和TAX1BP3(Tax1结合蛋白3)基因的部分序列融合而成。P2RX5属于P2X受体家族,该家族是一类由ATP激活的非选择性阳离子通道,参与多种生理过程如神经传递、炎症反应和免疫调节。P2RX5主要在免疫细胞中表达,尤其在T细胞和B细胞中,其功能涉及免疫细胞的激活和分化。TAX1BP3则是一种多功能蛋白,参与细胞凋亡、炎症反应和信号转导的调控,并与病毒感染(如HTLV-1)相关。P2RX5-TAX1BP3融合基因的形成可能导致其功能异常,影响免疫细胞的正常功能。研究表明,该融合基因在某些淋巴瘤(如弥漫性大B细胞淋巴瘤)中可能发挥促癌作用,可能通过干扰细胞凋亡或激活异常信号通路促进肿瘤发生。P2RX5-TAX1BP3的过表达可能增强细胞增殖和存活能力,而降低表达可能抑制肿瘤生长。P2RX5属于P2X受体基因家族,该家族成员均为三聚体离子通道,被细胞外ATP激活后允许Na+、K+和Ca2+跨膜流动,参与多种生理和病理过程。TAX1BP3属于TAX1BP家族,该家族蛋白通常参与病毒与宿主细胞的相互作用及免疫调节。P2RX5-TAX1BP3融合基因的发现为相关肿瘤的诊断和治疗提供了潜在靶点,但其具体机制仍需进一步研究。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring P2RX5 (purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 5) and TAX1BP3 (Tax1 binding protein 3) genes on chromosome 17. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is thus unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Mar 2011]

此轨迹表示天然存在的相邻P2RX5(嘌呤受体P2X,配体门控离子通道,5)和TAX1BP3(Tax1结合蛋白3)基因之间通读转录17号染色??体上的读通过转录物是一候选为无义介导的mRNA降解(NMD),并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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P2RX5-TAX1BP3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7093       rs161397       rs1044804       rs1044809       rs1044811       rs1044824       rs1128098       rs1128109       rs8069855       rs11541133       rs11541134       rs34098439       rs72835828       rs74485511       rs77196744       rs80249487       rs141342020      

P2RX5-TAX1BP3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGAACAAGAAGGTGGGC
59
ATCAGGAACACCCATACGAC
60
CAAGAACAAGAAGGTGGGC
59
ATCAGGAACACCCATACGA
58
CCAAGAACAAGAAGGTGGG
58
TCAGGAACACCCATACGAC
59
      尚未收录相关数据

P2RX5-TAX1BP3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

P2RX5-TAX1BP3基因的本体(GO)信息:

可能调控 P2RX5-TAX1BP3基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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