OTUD6B (OTU deubiquitinase 6B)

symbol:
OTUD6B
locus group:
protein-coding gene
location:
8q21.3
gene_family:
OTU domain containing
alias symbol:
CGI-77|DUBA5
alias name:
None
entrez id:
51633
ensembl gene id:
ENSG00000155100
ucsc gene id:
uc003yeu.4
refseq accession:
NM_016023
hgnc_id:
HGNC:24281
approved reserved:
2005-09-28
8q21.3
基因染色体位置图

OTUD6B(OTU domain-containing protein 6B)是一种去泛素化酶,属于OTU(ovarian tumor protease)家族成员,该家族以含有保守的OTU结构域为特征,主要功能是通过水解泛素链调控蛋白质的稳定性、定位和功能。OTUD6B通过去除底物蛋白上的泛素修饰参与多种细胞过程,包括DNA损伤修复、免疫调节和细胞周期调控。该基因在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和睾丸中表达较高。OTUD6B的主要作用位点包括细胞核和细胞质,通过与特定蛋白相互作用调控其稳定性。突变或异常表达可能影响其去泛素化活性,导致蛋白质稳态失衡,进而与神经发育障碍、癌症等疾病相关。例如,OTUD6B突变与智力障碍、自闭症谱系障碍等神经发育疾病有关,可能因其影响神经元发育相关蛋白的稳定性。OTUD6B过表达可能增强对某些底物蛋白的去泛素化作用,延长其半衰期,如促癌蛋白的积累可能促进肿瘤发生;而表达降低可能导致底物蛋白过度降解,破坏正常细胞功能(如DNA修复缺陷)。OTUD6B属于OTU去泛素化酶家族,该家族成员均含OTU结构域,通过特异性识别和切割泛素链类型(如K48、K63链)参与炎症、凋亡等信号通路。OTUD6B还与免疫应答相关,可能通过调控NF-κB等通路影响炎症反应。其功能冗余性可能被家族其他成员(如OTUD5)部分补偿,但特定底物选择性和组织分布差异使其具有独特作用。研究OTUD6B有助于理解泛素化修饰在疾病中的机制,并为靶向治疗提供潜在方向。

This gene encodes a member of the ovarian tumor domain (OTU)-containing subfamily of deubiquitinating enzymes. Deubiquitinating enzymes are primarily involved in removing ubiquitin from proteins targeted for degradation. This protein may function as a negative regulator of the cell cycle in B cells. [provided by RefSeq, Nov 2013]

该基因编码含去泛素酶的亚科卵巢癌域(OTU)的成员。去泛素酶主要参与的针对蛋白质降解的泛素去除。这种蛋白可以以细胞周期的B细胞的负调节物起作用。 [由RefSeq的,2013年11月提供]

OTUD6B基因的碱基序列:[NCBI]
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OTUD6B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1138489       rs3808377       rs3808378       rs4579491       rs5893159       rs6984197       rs10113205       rs11557571       rs28413906       rs28429767       rs61515687       rs62528357       rs73301742       rs73694368       rs73694369       rs76650212       rs77013724      

OTUD6B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAAGAAGGAGTTGCAAGC
58
TTGTCATTCTTGGGAACAGC
58
GTCAGCTTGAGCTAAGAGC
58
CTATAATGGGAGGAGAATCTGC
58
GTCAGCTTGAGCTAAGAGC
58
CTATAATGGGAGGAGAATCTGC
58
GTCAGCTTGAGCTAAGAGC
58
CTATAATGGGAGGAGAATCTGC
58
AAAGAGAAGAAGGAGTTGCA
57
GTCATTCTTGGGAACAGCA
58
GTCAGCTTGAGCTAAGAGC
58
CTATAATGGGAGGAGAATCTGC
58
GTCAGCTTGAGCTAAGAGC
58
CTATAATGGGAGGAGAATCTGC
58
CCATGTGGAAGACTTTCTGC
59
CAGTACTTCTGAAATTCTTCTGGAG
60
GAGAAGGCATCGCAAAGAG
59
ACAGCATTCTTCATGCCCT
60
CCATGTGGAAGACTTTCTGC
59
CAGTACTTCTGAAATTCTTCTGGAG
60
      尚未收录相关数据

OTUD6B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OTUD6B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006508
Q8N6M0 (UniProtKB)
IEA
GO:0036459
Q8N6M0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 OTUD6B基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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