ONECUT1 (one cut homeobox 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ONECUT1
locus group:
protein-coding gene
location:
15q21.3
gene_family:
CUT class homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
HNF-6
alias name:
None
entrez id:
3175
ensembl gene id:
ENSG00000169856
ucsc gene id:
uc002aci.3
refseq accession:
NM_004498
hgnc_id:
HGNC:8138
approved reserved:
2000-02-11

基因染色体位置

基因染色体位置

15q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ONECUT1（也称为HNF6或OC1）是一个编码转录因子的基因，属于ONECUT基因家族。这个家族的特征是包含一个高度保守的DNA结合域，称为ONECUT结构域，能够识别并结合特定的DNA序列来调控下游基因的表达。ONECUT家族成员在胚胎发育、细胞分化和代谢调控中发挥重要作用，尤其在肝脏、胰腺和神经系统的发育过程中表现突出。ONECUT1主要在肝脏、胰腺、胆管和中枢神经系统中表达，其编码的蛋白质通过调控多个靶基因的转录来影响器官的形成和功能。在肝脏中，ONECUT1参与调控肝细胞的分化和胆管的发育，对维持肝脏的正常结构和功能至关重要。在胰腺中，它影响内分泌细胞（如胰岛β细胞）和外分泌细胞的发育，对胰岛素的产生和血糖调控有重要作用。ONECUT1的突变或功能异常可能导致多种疾病。例如，ONECUT1突变与糖尿病有关，因为它影响胰岛β细胞的功能和胰岛素分泌。此外，ONECUT1的异常表达还与肝脏疾病（如胆管发育异常和肝癌）以及神经系统疾病（如神经发育障碍）相关。ONECUT1过表达可能促进细胞增殖并抑制分化，在某些情况下可能增加癌症风险，尤其是在肝脏和胰腺中。相反，ONECUT1表达降低可能导致发育缺陷，如肝脏或胰腺功能不全，影响代谢平衡或激素分泌。ONECUT1还与其他基因或信号通路相互作用，例如与HNF1β和HNF4α等肝脏特异性转录因子协同调控下游基因的表达。在ONECUT家族中，ONECUT2和ONECUT3是另外两个成员，它们与ONECUT1具有相似的结构和功能，但在表达模式和具体调控的靶基因上可能存在差异。总的来说，ONECUT1是一个关键的发育调控基因，对多个器官的形成和功能至关重要，其异常表达或突变可能导致代谢性疾病、发育缺陷或癌症。

This gene encodes a member of the Cut homeobox family of transcription factors. Expression of the encoded protein is enriched in the liver, where it stimulates transcription of liver-expressed genes, and antagonizes glucocorticoid-stimulated gene transcription. This gene may influence a variety of cellular processes including glucose metabolism, cell cycle regulation, and it may also be associated with cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2012]

该基因编码的剪切同源框转录因子家族的成员。富集在肝脏，在那里它刺激肝脏表达基因的转录所编码的蛋白质的表达，并拮抗糖皮质激素刺激的基因转录。该基因可能会影响多种细胞过程，包括葡萄糖代谢，细胞周期调控的，它也可以与癌症相关。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2012年12月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ONECUT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1899751       rs2075613       rs2440315       rs2440316       rs2440317       rs2456523       rs2456524       rs34850380       rs35131041       rs35138937       rs35174846       rs61735385       rs61735386       rs61735387       rs62023491       rs74805019       rs76268400      

基因表达

基因表达

ONECUT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTATGAGCTGAGCGGGAG
59
TCCCATGTTCTTGTTCTTTCC
59
ATTCGAGTATTGATGGAGTCAC
58
CCCATGTTCTTGTTCTTTCC
57
GATAGGCAGAGAAGAAAGCTG
59
TAGCACAAGAGCCTCAAGG
59
GGAGCAAACTCAAATCCGG
59
CCCATGTTCTTGTTCTTTCCT
59
GAGCAAACTCAAATCCGGC
60
TCCCATGTTCTTGTTCTTTCC
59
TAGGCAGAGAAGAAAGCTGAG
60
TAGCACAAGAGCCTCAAGG
59
TTCGAGTATTGATGGAGTCAC
58
CCCATGTTCTTGTTCTTTCCT
59
AATTATGAGCTGAGCGGGA
59
CCCATGTTCTTGTTCTTTCCT
59
GAGCAAACTCAAATCCGGC
60
CCCATGTTCTTGTTCTTTCCT
59
TTCGAGTATTGATGGAGTCAC
58
CCCATGTTCTTGTTCTTTCC
57

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
ONECUT1
MITF
Unknown
11478782
ONECUT1
PROC
Activation
9553065

基因本体信息

ONECUT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ONECUT1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001077
Q9UBC0 (UniProtKB)
ISS
GO:0001077
Q9UBC0 (UniProtKB)
IBA
GO:0001889
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0001952
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0002064
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q9UBC0 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q9UBC0 (UniProtKB)
IBA
GO:0006006
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9UBC0 (UniProtKB)
NAS
GO:0006366
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007219
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007492
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q9UBC0 (UniProtKB)
IBA
GO:0030183
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030335
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030512
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0031018
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0042384
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0045165
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q9UBC0 (UniProtKB)
ISS
GO:0048536
Q9UBC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048731
Q9UBC0 (UniProtKB)
IBA
GO:0003677
U3KQR8 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ONECUT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Pancreatic Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Liver carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Liver neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of liver 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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