OLFM4 (olfactomedin 4)

symbol:
OLFM4
locus group:
protein-coding gene
location:
13q14.3
gene_family:
alias symbol:
OlfD|GW112|GC1
alias name:
None
entrez id:
10562
ensembl gene id:
ENSG00000102837
ucsc gene id:
uc001vhl.4
refseq accession:
NM_006418
hgnc_id:
HGNC:17190
approved reserved:
2004-06-25
13q14.3
基因染色体位置图

OLFM4(olfactomedin 4,嗅素4)是一种分泌型糖蛋白,属于嗅素(olfactomedin)基因家族成员,该家族的特征是含有一个保守的嗅素结构域(olfactomedin domain),参与细胞黏附、信号传导及先天免疫等过程。OLFM4主要在胃肠道、骨髓及中性粒细胞中表达,其生物学功能包括调节炎症反应、细胞凋亡和抗菌防御。它通过抑制NF-κB信号通路(一种调控炎症和免疫反应的关键通路)减轻过度炎症,同时通过结合细菌脂多糖(LPS)直接中和病原体。OLFM4的突变或表达异常与多种疾病相关:过表达可能促进肿瘤(如胃癌、结直肠癌)的进展,因其抑制凋亡并增强癌细胞存活;而表达降低则与炎症性肠病(IBD)和感染易感性增加有关,因免疫防御功能受损。在基因家族层面,嗅素家族成员(如OLFM1、OLFM2等)均含嗅素结构域,多参与神经发育、细胞黏附及肿瘤调控,但各成员功能存在组织特异性差异。OLFM4过表达可能通过激活Wnt/β-catenin通路(促进细胞增殖的途径)加剧肿瘤生长,而敲低表达会导致中性粒细胞功能缺陷,增加肠道病原体感染风险。此外,OLFM4与H. pylori(幽门螺杆菌)感染相关胃炎的发展密切相关,可能作为生物标志物用于疾病监测。

This gene was originally cloned from human myeloblasts and found to be selectively expressed in inflammed colonic epithelium. This gene encodes a member of the olfactomedin family. The encoded protein is an antiapoptotic factor that promotes tumor growth and is an extracellular matrix glycoprotein that facilitates cell adhesion. [provided by RefSeq, Mar 2011]

这个基因最初是从人的原粒细胞克隆,并发现,在发炎的结肠上皮被选择性地表达。该基因编码的olfactomedin家族的一个成员。所编码的蛋白质是促进肿瘤的生长,是一种细胞外基质糖蛋白,促进细胞粘附的抗凋亡因子。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

OLFM4基因的碱基序列:[NCBI]
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OLFM4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs12552       rs1343611       rs1419221       rs1419223       rs1891945       rs1936388       rs2185959       rs2185960       rs2185961       rs2275840       rs2298229       rs2298230       rs2298231       rs2298232       rs2298233       rs2298234       rs2298235      

OLFM4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACTTTCCAAAGTGAGGGA
58
GTCAATTCGGACAGTTAGGT
58
TGGTCATACAGCTGAAGGAG
59
GAGTCATATTTCTTATCTCCACCTC
59
CTTTCCAAAGTGAGGGAATATGTC
60
GATGTCAATTCGGACAGTTAGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
NFKB1
OLFM4
Unknown
RELA
OLFM4
Unknown

OLFM4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OLFM4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003824
Q6UX06 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q6UX06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6UX06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6UX06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0005615
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q6UX06 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
Q6UX06 (UniProtKB)
IEA
GO:0042581
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0042803
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0045296
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0048471
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0051260
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:1900026
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0010939
Q6UX06 (UniProtKB)
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Q6UX06 (UniProtKB)
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Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
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Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0050764
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:2000389
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP

可能调控 OLFM4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.122367032 2 2 GAD_GWASCAT
Endometriosis 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Stomach Carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Obesity 0.002638474 2 1 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of stomach 0.002442977 9 0 BeFree
Insulin Resistance 0.002367032 1 1 GAD
Heart Diseases 0.002367032 1 1 GAD
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 1 GAD
Neoplasm Metastasis 0.001357209 5 0 BeFree
Carcinogenesis 0.001085767 4 0 BeFree

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