OLFM4 (olfactomedin 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
OLFM4
locus group:
protein-coding gene
location:
13q14.3
gene_family:
alias symbol:
OlfD|GW112|GC1
alias name:
None
entrez id:
10562
ensembl gene id:
ENSG00000102837
ucsc gene id:
uc001vhl.4
refseq accession:
NM_006418
hgnc_id:
HGNC:17190
approved reserved:
2004-06-25

基因染色体位置

基因染色体位置

13q14.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene was originally cloned from human myeloblasts and found to be selectively expressed in inflammed colonic epithelium. This gene encodes a member of the olfactomedin family. The encoded protein is an antiapoptotic factor that promotes tumor growth and is an extracellular matrix glycoprotein that facilitates cell adhesion. [provided by RefSeq, Mar 2011]

这个基因最初是从人的原粒细胞克隆，并发现，在发炎的结肠上皮被选择性地表达。该基因编码的olfactomedin家族的一个成员。所编码的蛋白质是促进肿瘤的生长，是一种细胞外基质糖蛋白，促进细胞粘附的抗凋亡因子。 [由RefSeq的，2011年3月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

OLFM4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs12552       rs1343611       rs1419221       rs1419223       rs1891945       rs1936388       rs2185959       rs2185960       rs2185961       rs2275840       rs2298229       rs2298230       rs2298231       rs2298232       rs2298233       rs2298234       rs2298235      

基因表达

基因表达

OLFM4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACTTTCCAAAGTGAGGGA
58
GTCAATTCGGACAGTTAGGT
58
TGGTCATACAGCTGAAGGAG
59
GAGTCATATTTCTTATCTCCACCTC
59
CTTTCCAAAGTGAGGGAATATGTC
60
GATGTCAATTCGGACAGTTAGG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
OLFM4
Unknown
18764868
RELA
OLFM4
Unknown
18764868

基因本体信息

OLFM4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OLFM4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003824
Q6UX06 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q6UX06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6UX06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6UX06 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0005615
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q6UX06 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
Q6UX06 (UniProtKB)
IEA
GO:0042581
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0042803
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0045296
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0048471
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0051260
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:1900026
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0010939
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0030141
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0042582
Q6UX06 (UniProtKB)
IDA
GO:0042981
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:0050764
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP
GO:2000389
Q6UX06 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 OLFM4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.122367032 2 2 GAD_GWASCAT
Endometriosis 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Stomach Carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Obesity 0.002638474 2 1 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of stomach 0.002442977 9 0 BeFree
Insulin Resistance 0.002367032 1 1 GAD
Heart Diseases 0.002367032 1 1 GAD
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 1 GAD
Neoplasm Metastasis 0.001357209 5 0 BeFree
Carcinogenesis 0.001085767 4 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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