ODF4 (outer dense fiber of sperm tails 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ODF4
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.1
gene_family:
alias symbol:
OPPO1|CT136
alias name:
cancer/testis antigen 136
entrez id:
146852
ensembl gene id:
ENSG00000184650
ucsc gene id:
uc002gle.2
refseq accession:
NM_001319953
hgnc_id:
HGNC:19056
approved reserved:
2002-12-09

基因染色体位置

基因染色体位置

17p13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a protein that is localized in the outer dense fibers of the tails of mature sperm. This protein is thought to have some important role in the sperm tail. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码在成熟精子的尾部外致密纤维本地化的蛋白质。这种蛋白质被认为有在精子尾部一些重要的作用。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ODF4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs918274       rs2008274       rs2302869       rs4791531       rs4792329       rs4792334       rs6503102       rs6503103       rs7213495       rs7213527       rs7218192       rs7219472       rs8067999       rs8069158       rs8069620       rs8070734       rs8074854      

基因表达

基因表达

ODF4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTAGAGAATGGGAAAGTCACC
57
CCTTTCCAACTCGAAGATCC
58
AGAAAGAGACCAACATCAGAG
57
GGAGAAGATGAAGGTGACTG
57
GAGAAAGAGACCAACATCAGAG
58
GAGAAGATGAAGGTGACTGTG
58
TTAGAGAATGGGAAAGTCACCT
58
CCTTTCCAACTCGAAGATCC
58
GGAGAAAGAGACCAACATCAG
58
GAAGATGAAGGTGACTGTGC
59
ACTTAGAGAATGGGAAAGTCAC
57
TTTCCAACTCGAAGATCCAG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ODF4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ODF4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C3TX97 (UniProtKB)
IEA
GO:0001520
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q2M2E3 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ODF4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Experimental Organism Basal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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