ODF1 (outer dense fiber of sperm tails 1)

symbol:
ODF1
locus group:
protein-coding gene
location:
8q22.3
gene_family:
Small heat shock proteins
alias symbol:
ODFPG|ODF27|RT7|HSPB10|CT133
alias name:
cancer/testis antigen 133
entrez id:
4956
ensembl gene id:
ENSG00000155087
ucsc gene id:
uc003ykt.3
refseq accession:
NM_024410
hgnc_id:
HGNC:8113
approved reserved:
1994-10-25
8q22.3
基因染色体位置图

ODF1(Outer Dense Fiber Protein 1)是一种主要存在于精子尾部外致密纤维中的结构蛋白,对精子的运动和形态维持至关重要。外致密纤维是精子鞭毛的重要组成部分,为精子提供机械支持和弹性,帮助精子实现高效的运动能力。ODF1通过与其他纤维蛋白(如ODF2)相互作用,形成稳定的纤维结构,确保精子尾部在游动过程中的刚性和柔韧性平衡。该基因的突变可能导致精子形态异常或运动功能障碍,进而引发男性不育。研究表明,ODF1表达异常与弱精症、畸形精子症等生殖疾病密切相关。若ODF1过表达,可能干扰精子纤维结构的正常组装,影响精子功能;而表达降低则会导致外致密纤维发育不全,使精子丧失运动能力。ODF1属于外致密纤维蛋白家族(ODF family),该家族成员均具有高度保守的卷曲螺旋结构域,能够形成稳定的蛋白相互作用网络,共同维持精子尾部的结构与功能。此外,ODF1在睾丸组织中特异性高表达,其表达水平可作为男性生殖健康的潜在生物标志物。

The outer dense fibers are cytoskeletal structures that surround the axoneme in the middle piece and principal piece of the sperm tail. The fibers function in maintaining the elastic structure and recoil of the sperm tail as well as in protecting the tail from shear forces during epididymal transport and ejaculation. Defects in the outer dense fibers lead to abnormal sperm morphology and infertility. The human outer dense fibers contains at least 10 major proteins and this gene encodes the main protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

外致密纤维包围在中间片和精子尾部的主段轴丝骨架结构。该纤维的功能在维持精子尾部的弹性结构和反冲以及在附睾运输和射精期间保护从剪切力的尾巴。在外部密集纤维缺陷导致精子形态异常和不育。人体外致密纤维含有至少10个主要的蛋白质和该基因编码的主要蛋白质。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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ODF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs892504       rs892505       rs892506       rs892507       rs919952       rs2117331       rs2117333       rs2164065       rs2436900       rs2436901       rs2436902       rs2436903       rs2511704       rs2511705       rs2511735       rs2511736       rs2511759      

ODF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTGAAGGATGGAAAGCCC
59
AAGGATCATATGGGCTGCA
58
GAGAGCTTGCCAAACTGAG
59
CGCATACATTCACCGATCC
59
AGTTCGAGTGAAGGATGGA
58
AAGGATCATATGGGCTGCA
59
GAGTGAAGGATGGAAAGCC
58
AGGATCATATGGGCTGCAC
59
TACTGTCTGCGACCATCTC
59
CTTCTCAGTTTGGCAAGCT
58
AAGTTCGAGTGAAGGATGGA
59
AGGATCATATGGGCTGCAC
60
AGTGAAGGATGGAAAGCCC
59
AGGATCATATGGGCTGCAC
59
TACTGTCTGCGACCATCTC
59
CTTCTCAGTTTGGCAAGCTC
60
AGTTCGAGTGAAGGATGGA
58
AGGATCATATGGGCTGCAC
60
      尚未收录相关数据

ODF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ODF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q14990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q14990 (UniProtKB)
IDA
GO:0007275
Q14990 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q14990 (UniProtKB)
IEA
GO:0019904
Q14990 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q14990 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ODF1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Diabetes Mellitus 0.000271442 1 0 BeFree
Giant Cell Tumor of Bone 0.000271442 1 0 BeFree
Superficial ulcer 0.000271442 1 0 BeFree
Rheumatoid Arthritis 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetes 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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