NR2C1 (nuclear receptor subfamily 2 group C member 1)

symbol:
NR2C1
locus group:
protein-coding gene
location:
12q22
gene_family:
Nuclear hormone receptors
alias symbol:
TR2-11
alias name:
None
entrez id:
7181
ensembl gene id:
ENSG00000120798
ucsc gene id:
uc001tdm.6
refseq accession:
NM_003297
hgnc_id:
HGNC:7971
approved reserved:
1998-05-15
12q22
基因染色体位置图

NR2C1(也称为TR4)属于核受体亚家族2的C组成员,是核受体超家族的一部分。这个基因家族的特点是编码的蛋白质能够与DNA结合并调控基因表达,通常作为配体依赖的转录因子发挥作用。NR2C1主要在睾丸、卵巢、前列腺和中枢神经系统中表达,参与多种生物学过程,包括生殖系统发育、能量代谢和神经功能。它的表达产物通过与特定DNA序列结合来调控下游靶基因的转录,影响细胞增殖、分化和凋亡。NR2C1的突变可能导致其功能异常,与多种疾病相关,如前列腺癌、卵巢癌和代谢紊乱。例如,在某些癌症中,NR2C1的异常表达可能促进肿瘤细胞的生长和侵袭。此外,NR2C1在神经退行性疾病如阿尔茨海默病中也显示出潜在作用,可能通过影响神经元存活和突触可塑性来参与疾病进程。如果NR2C1过表达,可能增强其对靶基因的调控作用,导致细胞增殖异常或代谢失调,进而促进肿瘤发生或代谢疾病。相反,降低NR2C1表达可能影响生殖系统功能或神经保护机制,增加疾病风险。NR2C1与其他核受体家族成员(如NR2C2)在功能上有部分重叠,但各自具有独特的调控靶点和生物学效应。该基因家族的共性包括含有保守的DNA结合域和配体结合域,能够响应激素或脂溶性信号分子,从而协调复杂的生理和病理过程。研究NR2C1的功能和调控机制有助于理解其在疾病中的作用,并为开发相关治疗策略提供潜在靶点。

This gene encodes a nuclear hormone receptor characterized by a highly conserved DNA binding domain (DBD), a variable hinge region, and a carboxy-terminal ligand binding domain (LBD) that is typical for all members of the steroid/thyroid hormone receptor superfamily. This protein also belongs to a large family of ligand-inducible transcription factors that regulate gene expression by binding to specific DNA sequences within promoters of target genes. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described, but the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码核激素受体特征在于是典型的类固醇/甲状腺的所有成员一个高度保守的DNA结合结构域(DBD),可变铰链区,和一个羧基末端配体结合域(LBD)激素受体超家族。这种蛋白也属于一个大家族,它通过靶基因的启动子内结合特定的DNA序列调节基因表达的配体 - 诱导的转录因子。多个可变剪接转录物变体已有描述,但其中的一些变体的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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NR2C1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs35582       rs35583       rs35584       rs41146       rs43202       rs166066       rs183656       rs193789       rs249141       rs249142       rs249143       rs249144       rs249145       rs249146       rs249147       rs249169       rs249170      

NR2C1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATAATTCTTCCAACTCGGGCA
60
CATGATCTACTGAAGATTATGGGAC
59
CGGTAGATCATGGCAACCA
59
CTAGACATACCTCTCCCATCTG
59
TGTCAATACTGCAGCTGTC
58
CTACGAAGGTCCTTTCGGA
59
ATGACACCTACAGGTTATCCAG
59
ACAATTCTTCAGTGATGGTAGC
58
GATTCACATGTAGCTTTCAGGA
59
TAGGCTTGGATGATCTGGAC
59
TGTTTCAAGCTCACCATGC
59
AAGAACAGCAGTCTGGAGG
59
ATCTATATCCGAAAGGACCTTCG
59
CCTGTTGACCTTGTACTTTCAC
59
GAAAGTACAAGGTCAACAGGAC
59
ATCAGCACAGCTGACTCAG
59
CTGAATGTGCACTACATTGG
57
TTTCTTCTTTCCTAGAGCCTG
58
AAACTCTGCATTGATGGATACG
59
CTGGACTGAAGAGTACTATTGC
58
      尚未收录相关数据

NR2C1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NR2C1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003700
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0043401
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
A0A087WUK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
H0YIV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0043401
H0YIV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0000978
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0001078
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
P13056 (UniProtKB)
TAS
GO:0003707
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0004872
P13056 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P13056 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
P13056 (UniProtKB)
TAS
GO:0006367
P13056 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0016605
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0042803
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0042826
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0043401
P13056 (UniProtKB)
IEA
GO:0048386
P13056 (UniProtKB)
IEA

可能调控 NR2C1基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometriosis 0.12 1 0 CTD_human
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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