NPTX2 (neuronal pentraxin 2)

symbol:
NPTX2
locus group:
protein-coding gene
location:
7q22.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
apexin
entrez id:
4885
ensembl gene id:
ENSG00000106236
ucsc gene id:
uc003upl.3
refseq accession:
NM_002523
hgnc_id:
HGNC:7953
approved reserved:
1995-05-12
7q22.1

NPTX2(Neuronal Pentraxin 2)属于神经元五聚蛋白(Neuronal Pentraxin)基因家族,该家族还包括NPTX1和NPTXR。这一家族的共性在于它们编码的蛋白质具有五聚体结构,能够通过钙依赖性方式结合特定配体,主要在中枢神经系统中表达,参与突触可塑性、神经元发育和神经信号传递等过程。NPTX2编码的蛋白质也被称为神经元活性相关五聚蛋白(NP2),在突触形成和维持中起关键作用,特别是在兴奋性突触中调节AMPA受体的聚集和稳定性,从而影响学习与记忆功能。NPTX2主要在海马、大脑皮层和小脑等脑区高表达,其表达受神经元活动调控。突变或异常表达可能导致突触功能紊乱,与阿尔茨海默病、精神分裂症和自闭症谱系障碍等神经精神疾病相关。NPTX2过表达可能增强突触传递效率,但过度激活可能导致神经兴奋性毒性或异常神经网络连接;而降低表达则可能损害突触可塑性,影响认知功能。此外,NPTX2还参与神经炎症反应,其表达变化可能通过影响神经胶质细胞活性加剧神经退行性病变。该基因与家族成员NPTX1和NPTXR功能部分重叠,但各自在特定脑区和发育阶段发挥独特作用。研究NPTX2有助于理解神经发育障碍和退行性疾病的机制,并为相关治疗提供潜在靶点。

This gene encodes a member of the family of neuronal petraxins, synaptic proteins that are related to C-reactive protein. This protein is involved in excitatory synapse formation. It also plays a role in clustering of alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA)-type glutamate receptors at established synapses, resulting in non-apoptotic cell death of dopaminergic nerve cells. Up-regulation of this gene in Parkinson disease (PD) tissues suggests that the protein may be involved in the pathology of PD. [provided by RefSeq, Feb 2009]

该基因编码的家族的神经元petraxins,与相关的C-反应蛋白的突触蛋白的成员。这种蛋白质是参与兴奋性突触形成。它还在α-氨基-3-羟基-5-甲基-4-异唑丙酸(AMPA)在建立突触型谷氨酸受体,导致多巴胺能神经细胞的非凋亡细胞死亡的聚类的作用。上调该基因在帕金森病(PD)的组织表明,该蛋白可能在PD的病理参与。 [由RefSeq的,2009年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
NPTX2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs386689       rs705315       rs705316       rs705317       rs705318       rs1681248       rs2291273       rs2301130       rs2642895       rs4729460       rs5886078       rs6951066       rs10215177       rs10224909       rs10263071       rs10271128       rs11763387      

NPTX2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGTCCTTTGTTAACTAGTCCTG
59
TTAAAGGCGCTATTGCCAC
59
TCATCAACGACAAGGTTGC
59
CTCTTGTCCAAGGATCAGC
58
TCATCAACGACAAGGTTGC
59
TCTTGTCCAAGGATCAGCA
59
CTCACACTGTGGCAATAGC
59
CCGTATAGGTAGTTTGTGCG
59
AGTCCTTTGTTAACTAGTCCTGG
60
TTAAAGGCGCTATTGCCAC
59
TCATCAACGACAAGGTTGC
59
CTTGTCCAAGGATCAGCAC
59
      尚未收录相关数据

NPTX2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NPTX2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007268
P47972 (UniProtKB)
NAS
GO:0008306
P47972 (UniProtKB)
IEA

可能调控 NPTX2基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Substance Withdrawal Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Pancreatic Neoplasm 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Parkinson Disease 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of pancreas 0.001628651 6 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Neuropathy ataxia and retinis pigmentosa 0.001357209 5 0 BeFree
MILS 0.001357209 5 0 BeFree
RHYNS syndrome 0.001085767 4 0 BeFree
Central Diabetes Insipidus 0.000814326 3 0 BeFree
Leigh Disease 0.000814326 3 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。