NOP16 (NOP16 nucleolar protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NOP16
locus group:
protein-coding gene
location:
5q35.2
gene_family:
alias symbol:
HSPC111|HSPC185|LOC51491
alias name:
hypothetical protein HSPC111|HBV p…
entrez id:
51491
ensembl gene id:
ENSG00000048162
ucsc gene id:
uc032vuv.2
refseq accession:
NM_016391
hgnc_id:
HGNC:26934
approved reserved:
2008-10-03

基因染色体位置

基因染色体位置

5q35.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NOP16 is transcriptionally regulated by c-Myc (MYC; MIM 190080), upregulated in breast cancer, and overexpression is associated with poor patient survival (Butt et al., 2008).[supplied by OMIM, Jun 2009]

None

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NOP16基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs953251       rs1060588       rs1065206       rs1065212       rs2241578       rs2335416       rs2335417       rs3172920       rs3172921       rs3792913       rs3792914       rs6862522       rs6862846       rs6863122       rs7356779       rs7736666       rs10042045      

基因表达

基因表达

NOP16基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAAATACTCTGTCTCGGGA
59
GCCACTCTGCTTATAGTCCT
59
TGTGCTGAATGACCTGGAG
60
ACATAGTCAATGAGGTCCCG
59
TAAGAGAAAGGTGAAGGCCA
59
TATCTTTGACACGGTTGCC
58
TACAGTGTCAACCGAAAGC
58
ATCGAGGAAGTCTTGCCAC
60
CCGTAAGAGAAAGATCCTTCTG
58
GCCTCTCCTCTATGTCCAC
59
TGTGCTGAATGACCTGGAG
60
ACATAGTCAATGAGGTCCCG
59
CGTAAGAGAAAGGGCTCTG
58
TTCCGTACAAGCTCTTTAGG
57
GGAAATACTCTGTCTCGGGA
59
GCCACTCTGCTTATAGTCCT
59
TGTGCTGAATGACCTGGAG
60
ACATAGTCAATGAGGTCCCG
59
TAAGAGAAAGGTGAAGGCCA
59
CACCATTCAGCACATAGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NOP16基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NOP16基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
D6RIC3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
D6RIC3 (UniProtKB)
IDA
GO:0043231
D6RIC3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IBA
GO:0005730
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IDA
GO:0042273
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IBA
GO:0043231
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q9Y3C1 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NOP16基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Precancerous Conditions 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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