NLRP5 (NLR family pyrin domain containing 5)

symbol:
NLRP5
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.43
gene_family:
NLR family
alias symbol:
PYPAF8|MATER|PAN11|CLR19.8
alias name:
nucleotide-binding oligomerization…
entrez id:
126206
ensembl gene id:
ENSG00000171487
ucsc gene id:
uc002qmj.4
refseq accession:
NM_153447
hgnc_id:
HGNC:21269
approved reserved:
2003-10-28
19q13.43
基因染色体位置图

NLRP5(NOD-like receptor family pyrin domain containing 5)属于NLRP基因家族,该家族是一类模式识别受体(PRR),主要参与先天免疫应答和炎症反应。NLRP家族成员通常含有三个结构域:N端的PYD(pyrin domain)、中间的NACHT(核苷酸结合寡聚化结构域)和C端的LRR(富含亮氨酸重复序列),这些结构域使其能够识别病原体相关分子模式(PAMP)或损伤相关分子模式(DAMP),并激活炎症小体(inflammasome),进而促进IL-1β和IL-18等促炎细胞因子的释放。NLRP5主要在生殖系统中表达,尤其在卵母细胞和早期胚胎中高度富集,其表达产物被认为在卵母细胞成熟、受精和早期胚胎发育中发挥关键作用。研究表明,NLRP5通过参与母源效应基因(maternal-effect genes)的调控,影响胚胎的基因组激活和细胞分化。NLRP5的突变可能导致女性不孕或早期胚胎发育异常,例如某些复发性流产或胚胎停育病例与NLRP5的功能缺陷相关。此外,NLRP5的表达异常还可能影响其他生殖相关基因的功能,如调节卵母细胞中ZP3(透明带蛋白3)的表达,从而干扰受精过程。NLRP5的过表达可能破坏卵母细胞内的稳态,导致氧化应激或线粒体功能障碍,而表达降低则可能引起胚胎发育迟缓或植入失败。尽管NLRP5在免疫系统中的直接作用尚不明确,但由于其属于NLRP家族,推测它可能在某些炎症性或自身免疫性疾病中扮演潜在角色。目前关于NLRP5的研究仍有限,但其在生殖生物学中的重要性日益受到关注,未来可能成为不孕症治疗或辅助生殖技术的潜在靶点。

The protein encoded by this gene belongs to the NALP protein family. Members of the NALP protein family typically contain a NACHT domain, a NACHT-associated domain (NAD), a C-terminal leucine-rich repeat (LRR) region, and an N-terminal pyrin domain (PYD). Expression of this gene is restricted to the oocyte. A mouse gene that encodes a maternal oocyte protein, similar to this encoded protein, is required for normal early embryogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质属于NALP蛋白家族。所述NALP蛋白家族的成员通常含有NACHT结构域,NACHT-相关联的域(NAD),C-末端富含亮氨酸重复序列(LRR)区域,和一个N-末端pyrin结构域(PYD)。该基因的表达被限制在卵母细胞。编码产妇卵母细胞的蛋白质,类似这样的编码蛋白A小鼠基因,所需的正常早期胚胎发育。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

NLRP5基因的碱基序列:[NCBI]
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NLRP5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs167385       rs167386       rs167387       rs170061       rs184251       rs188629       rs188630       rs191038       rs191039       rs191040       rs216681       rs306425       rs306426       rs306427       rs306428       rs306429       rs306430      

NLRP5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAAGACATTCACCAGAAGATCC
59
GCTTGTGAAATTCCTGGCA
59
ACAGACCAGGGAGTAATGC
59
ACAGTCCTCCAGTATCAGC
59
GACATTCACCAGAAGATCCT
57
CACAGCTTGTGAAATTCCTG
58
ACATTCACCAGAAGATCCTG
57
ATTTGAGTCAGAGATGTCTGG
58
AGACATTCACCAGAAGATCCT
59
TGAGTCAGAGATGTCTGGC
59
GACATTCACCAGAAGATCCT
57
TTTGAGTCAGAGATGTCTGG
57
GACATTCACCAGAAGATCCTG
59
ACAGCTTGTGAAATTCCTGG
59
AAGACATTCACCAGAAGATCCT
59
GAGTCAGAGATGTCTGGCA
59
CAATGGCGTGAAGCTTCTG
60
AGATGACACTTTACCAACTCCA
60
AGACATTCACCAGAAGATCCT
59
AGCTTGTGAAATTCCTGGC
59
      尚未收录相关数据

NLRP5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NLRP5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
A0A087WXM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0001701
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0005730
P59047 (UniProtKB)
ISS
GO:0005739
P59047 (UniProtKB)
ISS
GO:0005829
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0007566
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0009566
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0009887
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0031647
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0034613
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0043234
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0043487
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0043623
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0045179
P59047 (UniProtKB)
IEA
GO:0070997
P59047 (UniProtKB)
IMP

可能调控 NLRP5基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ovarian Failure, Premature 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Infertility 0.00272435 1 0 LHGDN
Hypoparathyroidism 0.00272435 1 0 LHGDN
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Crohn Disease 0.002367032 1 0 GAD
Polyglandular Type I Autoimmune Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Turner Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree

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