NLRC5 (NLR family CARD domain containing 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NLRC5
locus group:
protein-coding gene
location:
16q13
gene_family:
NLR family
alias symbol:
NOD27|CLR16.1|FLJ21709
alias name:
nucleotide-binding oligomerization…
entrez id:
84166
ensembl gene id:
ENSG00000140853
ucsc gene id:
uc021tit.2
refseq accession:
NM_032206
hgnc_id:
HGNC:29933
approved reserved:
2006-12-08

基因染色体位置

基因染色体位置

16q13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NLRC5是NOD样受体（NLR）家族的重要成员，属于NLR基因家族。NLR家族是一类模式识别受体，主要参与先天免疫反应，识别病原体相关分子模式（PAMPs）和损伤相关分子模式（DAMPs），并通过激活炎症小体或信号通路来调控免疫应答。NLRC5在结构上与其他NLR家族成员相似，具有中央的NACHT结构域和C端的LRR（富含亮氨酸重复序列）结构域，但其N端缺乏典型的PYD或CARD结构域，而是具有独特的酸性结构域。NLRC5的主要功能是作为MHC I类分子转录的调控因子，通过结合MHC I类基因的启动子区域，促进其转录表达，从而在抗原呈递和适应性免疫应答中发挥关键作用。此外，NLRC5还参与调控炎症反应和抗病毒免疫，能够抑制NF-κB信号通路，减少炎症因子的产生。NLRC5的突变或表达异常可能导致免疫系统功能紊乱，与自身免疫性疾病（如类风湿性关节炎和系统性红斑狼疮）以及某些病毒感染（如HIV和HCV）的易感性增加有关。NLRC5过表达可能增强MHC I类分子的表达，提高抗原呈递效率，但过度激活可能导致自身免疫反应；而NLRC5表达降低则可能削弱MHC I类分子的表达，影响T细胞介导的免疫应答，增加病毒感染和肿瘤发生的风险。NLRC5与其他NLR家族成员（如NLRP3和NLRC4）在功能上存在交叉和协同作用，共同调控免疫和炎症反应。NLR家族的共性在于它们均含有保守的NACHT结构域和LRR结构域，能够感知细胞内危险信号并启动免疫应答，但不同成员在具体功能和调控机制上有所差异。NLRC5的独特之处在于其专注于MHC I类分子的调控，而非炎症小体的组装。

This gene encodes a member of the caspase recruitment domain-containing NLR family. This gene plays a role in cytokine response and antiviral immunity through its inhibition of NF-kappa-B activation and negative regulation of type I interferon signaling pathways. [provided by RefSeq, Oct 2011]

该基因编码胱天蛋白酶募集结构域的NLR家族的一个成员。该基因在细胞因子反应和抗病毒免疫作用，通过其抑制NF-κ-B的激活和I型干扰素信号通路的负调控。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对NLRC5基因的介绍     Wikipedia数据库中对NLRC5基因的介绍

基因序列

基因序列

NLRC5基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NLRC5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs27191       rs27192       rs27193       rs27194       rs27195       rs27199       rs27392       rs27726       rs27902       rs37481       rs41383       rs42221       rs43216       rs149627       rs150348       rs150366       rs152221      

基因表达

基因表达

NLRC5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAATCAGATCACAGCTTTGG
58
TATTCCAGAGGCGGATGAC
59
AACATCCTAGAGCACAGGG
59
TGCTCTTAAAGCTGAGATTCTC
58
AGCCTCAGATAAGACAGCTG
59
AAGAGTCAGAAGACCATCGC
60
CTGAATCTCAGCTCCACCA
59
TTCTTGGCCAACTCTAGCT
59
GGGCTGTTGCAGATATAACTG
59
CCTATTGGATTCAAGGCCCA
60
CTCCACCTCGACTTCTCAG
59
TTCAAGGACTGCAGAGCTC
60
TGTTCAGCCTCAGAGACTC
59
TTCTTAAATCCCAAAGCACAGG
59
TGTTCAGCCTCAGAGACTC
59
TTCTTAAATCCCAAAGCACAGG
59
TCTTTGCCAGACTTCCCAG
60
GACACTCACTGAGGCAGAG
60
CTGTCCTGGAATCTCCTCG
59
TTCTTCTCCAGGTCCACTC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NLRC5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NLRC5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000979
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q86WI3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WI3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WI3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WI3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q86WI3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q86WI3 (UniProtKB)
TAS
GO:0032088
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0032480
Q86WI3 (UniProtKB)
TAS
GO:0043549
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0045087
Q86WI3 (UniProtKB)
IMP
GO:0045345
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0051607
Q86WI3 (UniProtKB)
IEP
GO:0060335
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0060335
Q86WI3 (UniProtKB)
IMP
GO:0060339
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA
GO:0060340
Q86WI3 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NLRC5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 0 GAD
Coronary heart disease 0.002367032 1 1 GAD
Respiratory Syncytial Virus Infections 0.000271442 1 0 BeFree
Bacterial Infections 0.000271442 1 0 BeFree
Respiratory syncytial virus (RSV) infection in conditions classified elsewhere and of unspecified site 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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