NEO1 (neogenin 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NEO1
locus group:
protein-coding gene
location:
15q24.1
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
NGN|HsT17534|IGDCC2|NTN1R2
alias name:
immunoglobulin superfamily, DCC su…
entrez id:
4756
ensembl gene id:
ENSG00000067141
ucsc gene id:
uc059ldp.1
refseq accession:
NM_002499
hgnc_id:
HGNC:7754
approved reserved:
1996-10-26

基因染色体位置

基因染色体位置

15q24.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NEO1（Neogenin 1）是一种跨膜受体蛋白，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）中的DCC（Deleted in Colorectal Cancer）基因家族。该家族成员在细胞迁移、轴突导向和组织发育中发挥重要作用，其共同特点是含有多个免疫球蛋白样和纤维连接蛋白III型结构域，能够与配体如Netrin、RGM（Repulsive Guidance Molecule）等结合，调控细胞信号传导。NEO1在胚胎发育中至关重要，参与神经系统的形成、血管生成和骨骼发育，尤其在神经元的轴突导向和突触可塑性中起关键作用。其表达产物通过激活Rho GTPase等下游信号通路，影响细胞骨架重组和细胞运动。NEO1的突变可能导致功能丧失，与先天性畸形（如神经管缺陷）、癌症（如乳腺癌和胶质瘤）及神经退行性疾病相关。例如，某些突变会破坏Netrin-1的结合能力，导致神经元迁移异常或凋亡。过表达NEO1可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移，因其增强细胞迁移能力；而表达降低则可能引发发育缺陷或神经功能障碍。此外，NEO1与DCC家族其他成员（如DCC和UNC5）功能重叠，但具有独特的配体偏好性，例如对RGM的亲和力更高。在疾病中，NEO1的表达水平变化可能影响其他基因（如Netrin通路相关基因）的功能，进而改变细胞黏附或凋亡进程。研究还发现，NEO1在炎症反应中调节巨噬细胞活性，与自身免疫疾病存在潜在关联。总体而言，NEO1是一个多功能的调控分子，其表达失衡或突变会对发育、神经系统及癌症进展产生广泛影响。

This gene encodes a cell surface protein that is a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded protein consists of four N-terminal immunoglobulin-like domains, six fibronectin type III domains, a transmembrane domain and a C-terminal internal domain that shares homology with the tumor suppressor candidate gene DCC. This protein may be involved in cell growth and differentiation and in cell-cell adhesion. Defects in this gene are associated with cell proliferation in certain cancers. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2010]

这个基因编码的细胞表面蛋白，它是免疫球蛋白超家族中的一员。所编码的蛋白质由四个N-末端免疫球蛋白样结构域，六纤连蛋白III型结构域，跨膜结构域和与肿瘤抑制候选基因的DCC共享同源性的C-末端的内部结构域。这种蛋白可能参与细胞生长和分化，并在细胞 - 细胞粘连。在这个基因的缺陷都与某些癌症细胞增殖相关。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2010年2月提供]

OMIM数据库中对NEO1基因的介绍     Wikipedia数据库中对NEO1基因的介绍

基因序列

基因序列

NEO1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NEO1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1029       rs7547       rs472681       rs484544       rs489531       rs489873       rs497539       rs499098       rs513744       rs525587       rs533460       rs552692       rs562682       rs576813       rs718653       rs747872       rs747873      

基因表达

基因表达

NEO1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTGAAGGTTCTTCCAGATCC
58
CCAATGACTCTGACTAAGGG
57
AATGCCTAATGATCAAGCCTC
59
ATTGGAGGTTTGTAGTCGGA
59
CATGTCTACACTGGCTGGA
59
TATTTCGAACGGATTGCTGG
59
GGGTTCTATCAGTGCATTGC
59
TGGCAACATCATGTTCAAGG
59
AATTCAGAACACCTAAAGCCTC
59
TTGGAGGTTTGTAGTCGGA
58
ACCTGCATCAGATCCTCAC
59
TCTCAACACGTTCCCTAGC
59
CAAGATTCGCTACCGAAAGG
59
GATCAAGACCTTCAATCAGCTG
60
AACACAACCTGAGGTTCAG
58
GTAACAGTGATGGAGGTAGG
57
CACCCATTGAAGAGCTTCG
59
GTGATGGTTCAGAGCTTGC
59
ACCTGCATCAGATCCTCAC
59
TCTCAACACGTTCCCTAGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NEO1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NEO1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004872
Q59FP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
Q59FP8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q59FP8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q59FP8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
Q59FP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
Q59FP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0030513
Q59FP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0055072
Q59FP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004872
Q92859 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
Q92859 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q92859 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q92859 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q92859 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q92859 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q92859 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
Q92859 (UniProtKB)
IEA
GO:0030513
Q92859 (UniProtKB)
IEA
GO:0039706
Q92859 (UniProtKB)
IPI
GO:0055072
Q92859 (UniProtKB)
IGI
GO:0098797
Q92859 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NEO1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
ovarian neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Glioblastoma 0.000542884 2 0 BeFree
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree
Adult Acute Lymphocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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