NEGR1 (neuronal growth regulator 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NEGR1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p31.1
gene_family:
I-set domain containing
alias symbol:
KILON|MGC46680|Ntra|IGLON4
alias name:
a kindred of IgLON|neurotractin|Ig…
entrez id:
257194
ensembl gene id:
ENSG00000172260
ucsc gene id:
uc001dfw.4
refseq accession:
NM_173808
hgnc_id:
HGNC:17302
approved reserved:
2003-09-09

基因染色体位置

基因染色体位置

1p31.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NEGR1（Neuronal Growth Regulator 1，神经元生长调节因子1）是一种与神经发育和突触可塑性相关的基因，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）中的一员。该基因家族的特点是编码含有免疫球蛋白样结构域的蛋白，这些蛋白通常参与细胞间识别、黏附和信号传导。NEGR1主要在脑组织中表达，尤其是海马、皮层和下丘脑等区域，其编码的蛋白是一种膜结合糖蛋白，通过与其他细胞表面分子相互作用来调节神经元生长、突触形成以及神经网络连接。研究表明NEGR1在神经元的迁移、轴突导向和突触可塑性中发挥重要作用，这些功能对学习、记忆和情绪调节至关重要。NEGR1的突变或表达异常与多种神经精神疾病相关，例如抑郁症、精神分裂症和肥胖症。全基因组关联分析（GWAS）发现NEGR1的某些单核苷酸多态性（SNP）与肥胖风险显著相关，可能通过影响下丘脑的食欲调节通路发挥作用。当NEGR1过表达时，可能促进神经元过度生长或异常连接，导致神经网络功能紊乱；而表达降低则可能损害突触可塑性，影响认知功能。在动物模型中，NEGR1敲除小鼠表现出社交行为异常和代谢紊乱。该基因与同家族成员如OPCML（Opioid Binding Protein/Cell Adhesion Molecule Like）和NCAM（Neural Cell Adhesion Molecule）具有相似的结构和功能，均通过细胞黏附机制参与神经系统发育。目前对NEGR1的研究仍在深入，其在能量代谢调控和神经精神疾病中的具体机制尚需进一步阐明。

None

无

OMIM数据库中对NEGR1基因的介绍     Wikipedia数据库中对NEGR1基因的介绍

基因序列

基因序列

NEGR1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NEGR1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3101338       rs3101339       rs3101341       rs3128341       rs6661230       rs11209943       rs34361149       rs66495454       rs67850471       rs67992963       rs72942952       rs76129735       rs76659454       rs78296138       rs78798036       rs79299311       rs114612999      

基因表达

基因表达

NEGR1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCTAACTGTGCAAGTTCCTC
58
TAAGAGTGACGTTGGTTCCT
59
CATGGTAAGCTCCAAGTACAG
59
GTCAACACAAGGTACCAGC
59
AATCTCCATCAGTCTCTGCA
59
CCTGGTCCCTTGTAATTCC
58
ATCTCCATCAGTCTCTGCA
58
CCTGGTCCCTTGTAATTCCA
59
ATGGTAAGCTCCAAGTACAG
57
TGTCAACACAAGGTACCAG
57
CATCTAACTGTGCAAGTTCCTC
59
AAGAGTGACGTTGGTTCCT
59
ATCTCCATCAGTCTCTGCA
58
CCTGGTCCCTTGTAATTCC
58
CATGGTAAGCTCCAAGTACAG
59
TCAACACAAGGTACCAGCA
59
CATCTAACTGTGCAAGTTCCT
58
AAGAGTGACGTTGGTTCCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NEGR1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NEGR1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007626
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007631
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IEA
GO:0010976
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q7Z3B1 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NEGR1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.154571602 25 10 BeFree_CTD_human_GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.007372538 4 7 BeFree_GAD
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Asthma 0.002367032 1 0 GAD
Obesity, Morbid 0.000542884 2 2 BeFree
OVERLAP CONNECTIVE TISSUE DISEASE 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Diseases 0.000271442 1 1 BeFree
Eating Disorders 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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