NEDD8-MDP1 (NEDD8-MDP1 readthrough)

symbol:
NEDD8-MDP1
locus group:
other
location:
14q12
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None
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ENSG00000255526
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uc059ace.1
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NM_001199823.1
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HGNC:39551
approved reserved:
2011-02-21
14q12
基因染色体位置图

NEDD8-MDP1(NEDD8-MDP1 readthrough)是一个特殊的融合基因,由NEDD8(Neural precursor cell expressed developmentally down-regulated protein 8)和MDP1(Mitochondrial DNA polymerase 1)两个基因的转录本通过通读(readthrough)机制形成。NEDD8是一种类泛素蛋白,主要参与蛋白质的翻译后修饰,通过neddylation过程调控蛋白质的稳定性和功能,尤其是对Cullin-RING泛素连接酶(CRLs)的激活至关重要,从而影响细胞周期、信号转导和DNA损伤修复等过程。MDP1则编码线粒体DNA聚合酶1,负责线粒体DNA的复制和修复,对维持线粒体功能和能量代谢具有重要作用。NEDD8-MDP1融合基因可能同时具备两种基因的功能特点,但其具体生物学功能尚未完全明确。研究表明,NEDD8的异常表达或突变可能影响CRLs的活性,导致蛋白质稳态失衡,进而与癌症、神经退行性疾病等病理过程相关。MDP1的缺陷则可能导致线粒体功能障碍,与代谢性疾病和衰老有关。如果NEDD8-MDP1过表达,可能会干扰正常的neddylation过程或线粒体DNA复制,从而影响细胞增殖或能量代谢;而降低表达则可能导致CRLs活性不足或线粒体功能缺陷。NEDD8属于泛素样蛋白(UBL)家族,该家族成员均通过类似泛素的修饰机制参与蛋白质调控,而MDP1属于DNA聚合酶家族,负责核酸合成。目前关于NEDD8-MDP1融合基因的研究较少,其具体病理机制和临床意义仍需进一步探索。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring NEDD8 (neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8) and MDP1 (magnesium-dependent phosphatase 1) genes on chromosome 14. The read-through transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with the products of each individual gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

此轨迹表示天然存在的相邻NEDD8之间并通读转录(神经前体细胞表达的,发育下调的8)MDP1(镁依赖性磷酸酶1)基因位于染色体14的通读转录编码融合蛋白通常,与每个单独的基因的产物的序列同一性。 [由RefSeq的,2010年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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NEDD8-MDP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2875       rs1997996       rs2295317       rs2295318       rs2295319       rs2295320       rs3215610       rs10136993       rs11428547       rs11629429       rs17101962       rs74037008       rs79864431       rs112292340       rs113112914       rs113171145       rs113913060      

NEDD8-MDP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGATTGACATTGAACCTACAGAC
60
AGAGTGTAATATCTGCTTGCCA
60
GTGTGGAGGAGAAAGAGGG
59
GCTGTCTTCTCATCATTCATCTG
60
GATTGACATTGAACCTACAGAC
57
GTTCCATCAATCTGCTTGC
57
CCTACAGACAAGGTGGAGC
59
ACTGTAGATGAGCCTCTGC
58
AAAGTGAAGGGTACCTGCT
59
CATAGTCTAGCCCTTGGGAG
59
ACCTACAGACAAGGTGGAG
58
TGTAGATGAGCCTCTGCTG
58
GTGTGGAGGAGAAAGAGGG
59
CTGTCTTCTCATCATTCATCTGC
60
AAAGTGAAGGGTACCTGCT
59
CATAGTCTAGCCCTTGGGA
58
GAGATTGACATTGAACCTACAGAC
60
GAGTGTAATATCTGCTTGCCAC
60
CGTGTGGAGGAGAAAGAGG
60
CTCGTACAGTTCCATCAATCTG
59
      尚未收录相关数据

NEDD8-MDP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NEDD8-MDP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016311
E9PL57 (UniProtKB)
IEA
GO:0016791
E9PL57 (UniProtKB)
IEA

可能调控 NEDD8-MDP1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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