NEAT1 (nuclear paraspeckle assembly transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NEAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
11q13.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
TncRNA|MENepsilon/beta|LINC00084|VINC|TP53LC15
alias name:
trophoblast derived non-protein co…
entrez id:
283131
ensembl gene id:
ENSG00000245532
ucsc gene id:
uc010rog.3
refseq accession:
NR_028272
hgnc_id:
HGNC:30815
approved reserved:
2008-09-02

基因染色体位置

基因染色体位置

11q13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NEAT1（核富集转录本1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于核旁斑（paraspeckle）结构的关键组成部分。它主要存在于细胞核内，参与形成核旁斑这一亚核结构，该结构与基因表达的调控、RNA加工和储存密切相关。NEAT1有两种主要亚型，NEAT1_1和NEAT1_2，其中NEAT1_2是核旁斑形成的主要支架。NEAT1通过与多种蛋白质（如PSPC1、NONO和SFPQ）相互作用，调控基因的转录、剪接和稳定性。在功能上，NEAT1参与细胞应激反应、病毒感染防御、细胞周期调控以及维持基因组稳定性。突变或异常表达可能导致核旁斑结构破坏，影响RNA代谢和基因表达调控。NEAT1与多种疾病相关，包括癌症（如乳腺癌、肺癌和前列腺癌）、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）和病毒感染（如HIV和流感）。过表达NEAT1通常与肿瘤进展、转移和不良预后相关，可能通过促进细胞增殖、抑制凋亡或激活致癌信号通路（如Wnt/β-catenin）实现。而降低NEAT1表达可能抑制肿瘤生长，但同时也可能影响正常的应激反应和免疫防御。NEAT1属于核旁斑相关lncRNA家族，该家族成员通常参与核内结构的形成和基因表达调控。NEAT1的调控网络复杂，与多种microRNA（如miR-101和miR-506）和信号通路（如p53和NF-κB）相互作用，影响细胞命运和疾病进程。研究NEAT1有助于理解lncRNA在疾病中的作用，并为开发新的治疗靶点提供线索。

This gene produces a long non-coding RNA (lncRNA) transcribed from the multiple endocrine neoplasia locus. This lncRNA is retained in the nucleus where it forms the core structural component of the paraspeckle sub-organelles. It may act as a transcriptional regulator for numerous genes, including some genes involved in cancer progression. [provided by RefSeq, Mar 2015]

该基因产生从多发性内分泌腺瘤病基因转录的长链非编码RNA（lncRNA）。此lncRNA被保留在它形成paraspeckle子细胞器??的核心结构部件的核心。它可以用作许多基因，包括参与癌症进展某些基因转录调节。 [由RefSeq的，2015年3月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

NEAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs475967       rs478583       rs481335       rs508286       rs550894       rs673753       rs745343       rs1075692       rs1144924       rs1144925       rs1633464       rs1633465       rs1784098       rs1784103       rs3741383       rs3741384       rs3825071      

基因表达

基因表达

NEAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATGAGCGAAGTGAAATTGC
59
ATAGACGCAGCTCAGAACC
60
CCTGAATCTTAGCACTTTGGG
59
GTATTGAACTCCTGACCTCGT
60
TGGAACTGAACTTAGCTCG
57
GCCATGAGGAACACTAGAG
57
TGATCAGGAAGACCAAGGG
59
TTCAGTTCCACAAGACCAG
57
TCGTGCCTTTACTACATGTG
58
ATTCAATAGACGCAGCTCAG
58
AACTGAACTTAGCTCGACG
58
TTTAGCGCCAAACCTAGAG
58
AACTGAACTTAGCTCGACG
58
GCCATGAGGAACACTAGAG
57
ATGATCAGGAAGACCAAGGG
59
TCAGTTCCACAAGACCAGG
59
ATGAGCGAAGTGAAATTGCA
59
ATAGACGCAGCTCAGAACC
60
ACTGAACTTAGCTCGACGG
60
GTTTAGCGCCAAACCTAGAG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NEAT1
CXCL8
Repression
24507715
SFPQ
NEAT1
Unknown
24507715

基因本体信息

NEAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NEAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NEAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Juvenile arthritis 0.12 1 0 CTD_human
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphatic Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
hiv-infection/aids 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2