NCAN (neurocan)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NCAN
locus group:
protein-coding gene
location:
19p12
gene_family:
Endogenous ligands|Hyalectan proteoglycans|V-set domain containing
alias symbol:
None
alias name:
neurocan proteoglycan
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1463
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NM_004386
hgnc_id:
HGNC:2465
approved reserved:
1997-12-23

基因染色体位置

基因染色体位置

19p12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NCAN（Neurocan）是一种细胞外基质蛋白，属于凝集素蛋白聚糖（lectican）家族，也称为软骨素硫酸蛋白聚糖（CSPG）家族。该家族成员包括NCAN、BCAN（Brevican）、ACAN（Aggrecan）和VCAN（Versican），它们的共同特点是含有N端透明质酸结合结构域、中央的硫酸软骨素结合区以及C端凝集素样结构域，这些结构使其能够与细胞外基质中的其他分子（如透明质酸和tenascin）相互作用，参与细胞黏附、迁移和信号传导。NCAN主要在神经系统中表达，尤其在发育中的大脑中高度富集，对神经元的迁移、轴突导向和突触可塑性具有重要作用。它通过调节细胞与基质的相互作用影响神经回路的形成，并在成年后参与维持中枢神经系统的稳定性。NCAN的突变或表达异常与多种神经系统疾病相关。例如，全基因组关联研究发现NCAN基因的某些单核苷酸多态性（SNP）与双相情感障碍（躁郁症）风险显著相关，可能通过影响前额叶皮层和海马的神经可塑性导致情绪调节异常。此外，NCAN过表达可能抑制轴突再生，这在脊髓损伤后不利于神经修复；而降低表达则可能破坏神经元网络的正常发育，导致认知功能障碍。在胶质母细胞瘤等脑肿瘤中，NCAN的高表达与肿瘤侵袭性增强相关，可能因其促进细胞迁移能力。动物模型研究表明，敲除NCAN的小鼠会出现海马依赖性学习记忆缺陷，但突触传递基本正常，提示其更可能影响神经网络的结构整合而非基础电活动。该基因的调控异常还可能通过改变Wnt/β-catenin或ERK/MAPK等信号通路间接影响其他基因的表达。总体而言，NCAN作为神经基质的关键组分，其精确表达水平对神经系统发育和功能至关重要，其异常既可能直接导致结构缺陷，也可能通过信号网络级联效应引发广泛影响。

Neurocan is a chondroitin sulfate proteoglycan thought to be involved in the modulation of cell adhesion and migration.[supplied by OMIM, Jul 2002]

Neurocan是被认为参与细胞粘附和迁移的调制一硫酸软骨素蛋白聚糖[由OMIM，2002年7月供给]

OMIM数据库中对NCAN基因的介绍     Wikipedia数据库中对NCAN基因的介绍

基因序列

基因序列

NCAN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NCAN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1064388       rs1064389       rs1064390       rs1064391       rs1064392       rs1064393       rs1064394       rs1064395       rs1859055       rs2188883       rs2228600       rs2228601       rs2228602       rs2228603       rs2229851       rs2238672       rs2238673      

基因表达

基因表达

NCAN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCTACAGGCTGCCTTTGAG
60
GGGTGATAGGATACCGAACAG
60
AAGATGCCGAGAAGGACTG
60
GCCCAAAGCTATTAATGAAGCT
60
GCTTCATTAATAGCTTTGGGCA
60
GAAGAAATTGTCCGGCTGG
59
GTGAGATTGACATTGATGACTG
58
CAGACAAAGCCATTGACCT
58
AAGATGCCGAGAAGGACTG
60
GCCCAAAGCTATTAATGAAGCT
60
TGAGATTGACATTGATGACTGC
59
CAGACAAAGCCATTGACCTC
59
TCTACAGGCTGCCTTTGAG
59
GGGTGATAGGATACCGAACAG
60
AGCTTCATTAATAGCTTTGGGC
60
TCCGTCCACTGGAAATCTC
59
AGCTTCATTAATAGCTTTGGGC
60
TCCGTCCACTGGAAATCTC
59
AGCTTCATTAATAGCTTTGGGC
60
TCCGTCCACTGGAAATCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NCAN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NCAN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001501
O14594 (UniProtKB)
IBA
GO:0005201
O14594 (UniProtKB)
IBA
GO:0005509
O14594 (UniProtKB)
IEA
GO:0005540
O14594 (UniProtKB)
IBA
GO:0005576
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
O14594 (UniProtKB)
IBA
GO:0005796
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
O14594 (UniProtKB)
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IBA
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O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0030203
O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
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O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0030208
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0030246
O14594 (UniProtKB)
IEA
GO:0043202
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0043202
O14594 (UniProtKB)
TAS
GO:0043202
O14594 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NCAN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Bipolar Disorder 0.124267125 7 1 BeFree_GAD_GWASCAT
Bladder Neoplasm 0.12 1 0 CTD_human
Non-alcoholic Fatty Liver Disease 0.001357209 5 0 BeFree
Schizophrenia 0.001085767 4 1 BeFree
Attention deficit hyperactivity disorder 0.000542884 2 0 BeFree
Steatohepatitis 0.000542884 2 5 BeFree
Alcoholic Liver Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Manic 0.000271442 1 0 BeFree
Adrenoleukodystrophy 0.000271442 1 1 BeFree
Fatty Liver 0.000271442 1 5 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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