NCAM1 (neural cell adhesion molecule 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NCAM1
locus group:
protein-coding gene
location:
11q23.2
gene_family:
CD molecules|Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing
alias symbol:
NCAM|CD56
alias name:
None
entrez id:
4684
ensembl gene id:
ENSG00000149294
ucsc gene id:
uc058hjx.1
refseq accession:
NM_000615
hgnc_id:
HGNC:7656
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

11q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NCAM1（Neural Cell Adhesion Molecule 1，神经细胞粘附分子1）是一种重要的细胞表面糖蛋白，属于免疫球蛋白超家族（IgCAMs）的成员，主要参与细胞间粘附、神经发育和突触可塑性等过程。它通过同源或异源相互作用介导细胞间识别和信号传导，在神经系统的发育、轴突导向、神经元迁移以及突触形成中发挥关键作用。NCAM1的表达产物是一种跨膜蛋白，具有多个免疫球蛋白样结构域和纤连蛋白III型重复序列，可通过糖基化修饰（如PSA-NCAM）调节其功能。该基因的主要作用位点包括神经元细胞膜、生长锥和突触间隙。NCAM1的突变可能导致其粘附功能受损，与精神分裂症、双相情感障碍和自闭症谱系障碍等神经精神疾病相关，还可能影响肿瘤细胞的迁移和转移。当NCAM1过表达时，可能增强神经元之间的连接并促进神经再生，但某些癌症中过表达会促进侵袭性；而降低表达可能导致神经发育异常、学习记忆障碍或突触功能缺陷。NCAM1属于NCAM基因家族，该家族成员均含有免疫球蛋白样结构域，介导钙离子非依赖性的细胞粘附，并在神经系统和免疫系统中参与细胞识别、迁移和信号转导。其功能可通过可变剪接和翻译后修饰（如多聚唾液酸化）进一步调控，从而适应不同的生理或病理环境。

This gene encodes a cell adhesion protein which is a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded protein is involved in cell-to-cell interactions as well as cell-matrix interactions during development and differentiation. The encoded protein has been shown to be involved in development of the nervous system, and for cells involved in the expansion of T cells and dendritic cells which play an important role in immune surveillance. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2011]

这个基因编码的细胞粘着蛋白，其是免疫球蛋白超家族中的一员。所编码的蛋白质是发育和分化过程中参与细胞 - 细胞相互作用，以及细胞 - 基质相互作用。所编码的蛋白质已经显示参与神经系统的发展，为参与T细胞和树突细胞，其在免疫监视中起重要作用的扩张的细胞。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2011年6月提供]

OMIM数据库中对NCAM1基因的介绍     Wikipedia数据库中对NCAM1基因的介绍

基因序列

基因序列

NCAM1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NCAM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2301228       rs4533068       rs4547132       rs6589347       rs6589348       rs6589349       rs6589350       rs6589351       rs7105734       rs7111153       rs7937151       rs7938749       rs7942799       rs10789929       rs10891480       rs10891481       rs10891482      

基因表达

基因表达

NCAM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATGAGGTCTACGTGGTGG
58
GTAGGATGCAGAATTGCCTC
59
GCCTTCTCGAAAGATGAGTC
59
TGTTTCCCTCCATCATGGT
59
ACGTGAAGATCTTTCAGAAGC
59
CACAATCACGGCATCTTCC
59
CTTGTTCAAGCAGACACCC
59
GTTCATCAAACTGCACCTGG
60
TGTACCTTGAAGTGCAATATGC
59
CCCTCCCAAGTGTACACAG
60
GTATGATGCCAAGGAAGCC
59
TTCCATCCTCTCCCATCTG
58
TCAGACACTATCTGGTCAGG
58
AGCCTGATCTCTGGTTTCC
59
CCTTGAAGTGCAATATGCCC
60
CAGGTGATGTTCACCTGGT
60
GAACTGCAGGTAAGACCCT
59
ACCAATGACATTTCCTTGTAGC
59
TTGTCTCCACCAGATAAAGGG
60
CCTGCTTGATCAGGTTCAC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
IRF9
NCAM1
Activation
17431130
NFKB1
NCAM1
Activation
19091137
PAX2
NCAM1
Unknown
16406048; 19485921
PAX8
NCAM1
Activation
8071351
RELA
NCAM1
Activation
19091137
RUNX1
NCAM1
Activation
16892559
SOX4
NCAM1
Activation
20049565

基因本体信息

NCAM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NCAM1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007155
A0A087WTE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087WTE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WTE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WTE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WTF6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WTR3 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WTR3 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WTR3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WV75 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WV75 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WV75 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WV75 (UniProtKB)
IEA
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A0A087WVD0 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WVD0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WVD0 (UniProtKB)
IEA
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A0A087WVU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WVU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WVU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WWD4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WWD4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WWD4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WWD4 (UniProtKB)
IEA
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A0A087WWJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WWJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WWJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WWJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WX77 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WX77 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WX77 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WX77 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WZS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087WZS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087WZS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087X1V2 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A087X1V2 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A087X1V2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A0C4DGS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A0C4DGS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A0C4DGS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A0D9SF30 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0D9SF30 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A0D9SF30 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A0D9SF30 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A0D9SF98 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0D9SF98 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
A0A0D9SF98 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
A0A0D9SF98 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
H7BYX6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
H7BYX6 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
H7BYX6 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
H7BYX6 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0000165
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0001618
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0005088
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
P13591 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0009897
P13591 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
P13591 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
P13591 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
P13591 (UniProtKB)
IPI
GO:0043547
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0046718
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0048167
P13591 (UniProtKB)
IEA
GO:0060333
P13591 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P13591 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NCAM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
Spontaneous abortion 0.12 1 0 CTD_human
Heart failure 0.080542884 3 0 BeFree_RGD
Hypothyroidism 0.080271442 2 0 BeFree_RGD
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.015220608 37 0 BeFree_LHGDN
Lymphoma 0.011400559 42 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.01114898 23 0 BeFree_LHGDN
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.008715934 3 0 BeFree_LHGDN
Bipolar Disorder 0.008544182 5 0 BeFree_GAD_LHGDN
Schizophrenia 0.007620235 9 1 BeFree_LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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E-mail: product@genelibs.com

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