NANOGP8 (Nanog homeobox retrogene P8)

symbol:
NANOGP8
locus group:
protein-coding gene
location:
15q14
gene_family:
NKL subclass homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
388112
ensembl gene id:
ENSG00000255192
ucsc gene id:
uc032bzh.2
refseq accession:
NM_001355281
hgnc_id:
HGNC:23106
approved reserved:
2003-10-07
15q14
基因染色体位置图

NANOGP8是NANOG基因家族中的一个假基因,属于NANOG基因家族,该家族还包括功能基因NANOG。NANOG基因家族的主要共性是参与维持胚胎干细胞的多能性和自我更新能力,尤其在早期胚胎发育中起关键作用。NANOGP8最初被认为是非功能性的假基因,但近年研究发现它在某些情况下可能被转录并翻译成蛋白质,其表达产物与NANOG蛋白高度相似,可能在肿瘤发生中发挥作用。NANOGP8的主要作用位点是在细胞核内,可能通过调控下游靶基因的表达来影响细胞命运。突变对NANOGP8功能的影响尚不完全清楚,但因其与NANOG的相似性,可能干扰正常干细胞调控通路。NANOGP8与多种癌症的关系备受关注,特别是在前列腺癌、乳腺癌和结肠癌中,其异常表达可能与肿瘤干细胞特性的维持、转移和耐药性有关。当NANOGP8过表达时,可能促进肿瘤细胞的干性特征,增强其自我更新和分化潜能,导致肿瘤进展和转移;同时可能干扰正常NANOG的调控网络,影响胚胎发育或组织稳态。降低NANOGP8表达则可能抑制肿瘤干细胞的特性,减少肿瘤侵袭性。NANOGP8的表达调控机制复杂,可能涉及表观遗传修饰和转录因子调控。尽管其确切功能仍需进一步研究,但NANOGP8在癌症生物学中的潜在作用使其成为肿瘤治疗的一个有趣靶点。

This locus is a processed pseudogene of the transcription factor NANOG. NANOG plays a central role in regulating self-renewal in pluripotent stem cells and tumor cells. This pseudogene contains an intact open reading frame that could potentially encode a protein similar to NANOG. Although there is no evidence of transcription from this pseudogene, RT-PCR studies suggest that NANOGP8 may be expressed in some cancer cell lines. In vitro studies using a recombinant NANOGP8 protein have shown that the protein localizes to the nucleus and can promote cell proliferation, similar to NANOG. [provided by RefSeq, Sep 2009]

这个位点的转录因子NANOG的加工型假。 NANOG在调节中的多能干细胞和肿瘤细胞的自我更新中心作用。这个假基因包含一个完整的开放阅读框可能潜在编码类似于NANOG的蛋白质。虽然没有从这个假转录的证据,RT-PCR法研究表明NANOGP8可能在某些癌细胞系中表达。在使用重组NANOGP8蛋白体外研究已经表明,该蛋白定位于细胞核,并且可以促进细胞增殖,类似于NANOG。 [由RefSeq的,2009年09月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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NANOGP8基因的碱基突变:           仅显示部分snp

NANOGP8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCAAATGTCTTCTGCTGAG
57
CATGGAGGAAGGAAGAGGA
58
AATAGCAATGGTGTGACGC
59
TCCACATTGGAAGGTTCCC
60
GAAGAATAGCAATGGTGTGAC
57
CATTGGAAGGTTCCCAGTC
58
TGCAAATGTCTTCTGCTGAG
59
ATGGAGGAAGGAAGAGGAG
58
AGAATAGCAATGGTGTGACG
58
CACATTGGAAGGTTCCCAG
59
TTCAGAGACAGAAATACCTCAG
57
AGGTTCAGGATGTTGGAGAG
59
      尚未收录相关数据

NANOGP8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NANOGP8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
A0A0D9SG05 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A0D9SG05 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
A0A0D9SG05 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
J7H3Z5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
J7H3Z5 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
J7H3Z5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q6NSW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q6NSW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q6NSW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
Q6NSW7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 NANOGP8基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinogenesis 0.002442977 9 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.001900093 7 0 BeFree
Teratoma 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of liver 0.001628651 6 0 BeFree
Embryonal Carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Liver and Intrahepatic Biliary Tract Carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.001628651 6 0 BeFree
Liver carcinoma 0.001628651 6 0 BeFree
Seminoma 0.001357209 5 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.001085767 4 3 BeFree

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