NAIP (NLR family apoptosis inhibitory protein)

symbol:
NAIP
locus group:
protein-coding gene
location:
5q13.2
gene_family:
Baculoviral IAP repeat containing|NLR family
alias symbol:
NLRB1
alias name:
nucleotide-binding oligomerization…
entrez id:
4671
ensembl gene id:
ENSG00000249437
ucsc gene id:
uc003kar.2
refseq accession:
NM_004536
hgnc_id:
HGNC:7634
approved reserved:
1998-05-14
5q13.2
基因染色体位置图

NAIP(神经元凋亡抑制蛋白)属于IAP(凋亡抑制蛋白)基因家族,该家族成员通常含有BIR(杆状病毒IAP重复)结构域,能够抑制细胞凋亡。NAIP主要在神经系统中表达,其编码的蛋白质通过抑制caspase-3和caspase-7的活性来阻止细胞凋亡,从而保护神经元免受损伤。此外,NAIP还参与先天免疫反应,通过识别细菌鞭毛蛋白和其他病原体相关分子模式来激活炎症小体,进而促进IL-1β等促炎细胞因子的释放。NAIP的突变与多种疾病相关,例如脊髓性肌萎缩症(SMA),某些突变会导致NAIP功能丧失,增加运动神经元的凋亡,进而引发疾病。NAIP的过表达可能增强细胞对凋亡的抵抗,但也可能导致炎症反应过度激活,与某些自身免疫性疾病或慢性炎症相关。相反,NAIP表达降低可能使细胞更容易发生凋亡,增加神经退行性疾病的风险。在基因家族中,IAP成员通常共享BIR结构域,但NAIP还具有NOD样受体(NLR)结构域,使其在免疫调控中具有独特作用。NAIP的功能多样性使其在神经保护和免疫防御中扮演重要角色,其异常表达或突变可能对机体产生广泛影响。

This gene is part of a 500 kb inverted duplication on chromosome 5q13. This duplicated region contains at least four genes and repetitive elements which make it prone to rearrangements and deletions. The repetitiveness and complexity of the sequence have also caused difficulty in determining the organization of this genomic region. This copy of the gene is full length; additional copies with truncations and internal deletions are also present in this region of chromosome 5q13. It is thought that this gene is a modifier of spinal muscular atrophy caused by mutations in a neighboring gene, SMN1. The protein encoded by this gene contains regions of homology to two baculovirus inhibitor of apoptosis proteins, and it is able to suppress apoptosis induced by various signals. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因倒在5q13染色体复制一个500 KB的一部分。这种重复区域包含至少四个基因和重复元件,这使得它易于重排和缺失。序列的重复性和复杂性也确定该基因组区域的组织造成的困难。该基因的这个副本全长;以截断和内部缺失额外的副本也存在于5q13染色体的这个区域。据认为,这种基因是在邻近的基因,SMN1突变引起的脊髓性肌萎缩的改性剂。由该基因编码的蛋白质中包含同源的区域,以抑制细胞凋亡蛋白两种杆状病毒,并且还能够抑制细胞凋亡的各种信号诱导。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

NAIP基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
NAIP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs150290       rs150290       rs150290       rs150441       rs150441       rs150441       rs150442       rs150442       rs150442       rs150447       rs150447       rs150447       rs150448       rs150448       rs150448       rs184064       rs184064      

NAIP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTACACAGGTATAAAGGACATCG
59
ATGGGTCATCACCTTCCTG
59
CACATACTTTCCTTCCACTGG
59
CCGAAGAAATTCACATCTGAGG
60
CCACATACTTTCCTTCCACTG
59
CGAAGAAATTCACATCTGAGGT
59
GTCTTTACAGGTAAACAGGACAC
59
AAGGATCATCTCCTTCTTCCC
59
CAGCAGCTTCATTGTCTCC
59
CAAGACTCCGTCAATTTCCA
58
GTCACAAGACCAAATCTTTCC
58
TTTATATTGCCCTCCAGATCC
57
GTCTTTACAGGTAAACAGGACAC
59
AAGGATCATCTCCTTCTTCCC
59
GTCTTTACAGGTAAACAGGACAC
59
AAGGATCATCTCCTTCTTCCC
59
CACATACTTTCCTTCCACTGG
59
CCGAAGAAATTCACATCTGAGG
60
AAGAGGAGGCTAGACTTGC
59
CCATGAACTCAGCTGTAAAGAC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
TEAD1
NAIP
Unknown

NAIP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NAIP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
A0A0G2JNC7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
A0A0G2JQE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
A0A0G2JS53 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
B7ZLE8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
E7EQW0 (UniProtKB)
IEA
GO:0004842
Q13075 (UniProtKB)
IBA
GO:0004869
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q13075 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q13075 (UniProtKB)
IMP
GO:0005737
Q13075 (UniProtKB)
ISS
GO:0005737
Q13075 (UniProtKB)
IBA
GO:0006954
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
Q13075 (UniProtKB)
TAS
GO:0009966
Q13075 (UniProtKB)
IBA
GO:0016323
Q13075 (UniProtKB)
ISS
GO:0016567
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q13075 (UniProtKB)
ISS
GO:0043154
Q13075 (UniProtKB)
IDA
GO:0043200
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0043204
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0043524
Q13075 (UniProtKB)
TAS
GO:0045087
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0048678
Q13075 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q13075 (UniProtKB)
IDA

可能调控 NAIP基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HMN (Hereditary Motor Neuropathy) Proximal Type I 0.120814326 3 0 BeFree_ORPHANET
Muscular Atrophy, Spinal, Type II 0.12 0 0 ORPHANET
Juvenile Spinal Muscular Atrophy 0.12 0 0 ORPHANET
Brain Ischemia 0.08 1 0 RGD
Spinal Muscular Atrophy 0.033732194 68 0 BeFree_GAD_LHGDN
Spinal Muscular Atrophies of Childhood 0.005091382 2 0 GAD_LHGDN
Muscular Atrophy 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Fabry Disease 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Multiple Sclerosis 0.00272435 1 0 LHGDN

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。