MSANTD3-TMEFF1 (MSANTD3-TMEFF1 readthrough)

symbol:
MSANTD3-TMEFF1
locus group:
other
location:
9q31.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100526694
ensembl gene id:
ENSG00000251349
ucsc gene id:
uc064uvb.1
refseq accession:
NM_001198812.1
hgnc_id:
HGNC:38838
approved reserved:
2011-02-21
9q31.1
基因染色体位置图

MSANTD3-TMEFF1是一个融合基因,由MSANTD3(Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 3)和TMEFF1(Transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1)两个基因的部分序列融合而成。这种融合通常由染色体易位或重排导致,可能产生异常的嵌合蛋白。TMEFF1本身编码一种跨膜蛋白,包含表皮生长因子(EGF)样结构域和卵泡抑素样结构域,参与细胞信号传导和细胞间相互作用,尤其在神经系统和前列腺组织中表达较高。MSANTD3则含有DNA结合结构域,可能参与转录调控。融合后的MSANTD3-TMEFF1可能获得新的功能或异常激活信号通路,例如干扰正常的EGF信号传导或细胞黏附过程。目前关于该融合基因的直接研究较少,但TMEFF1的异常表达与前列腺癌、胶质瘤等肿瘤发生相关,提示MSANTD3-TMEFF1可能通过类似机制促进肿瘤发展。若该基因过表达,可能增强促增殖或抗凋亡信号,导致细胞生长失控;而表达降低可能影响正常组织发育或修复功能。TMEFF1属于TMEFF基因家族,该家族成员(如TMEFF2)均具有EGF样和卵泡抑素样结构域,参与调节细胞分化、增殖和肿瘤抑制。MSANTD3则属于含有Myb/SANT结构域的蛋白家族,这类蛋白多参与染色质修饰和基因表达调控。由于融合基因的特性取决于断裂位点和融合方式,具体影响需进一步研究确认,但其潜在致癌性值得关注,尤其在相关肿瘤的分子诊断中可能具有临床意义。

This locus represents naturally occurring read-through transcription from the neighboring MSANTD3 (Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 3) and TMEFF1 (transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1) genes. The read-through transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with the products of each individual gene. [provided by RefSeq, Aug 2013]

此轨迹表示自然从相邻MSANTD3(的Myb / SANT样DNA结合含有3结构域)和TMEFF1(跨膜蛋白EGF样和两个卵泡抑素样结构域1)的基因发生的通读转录。的通读转录物编码共享与每个基因的产物的序列同一性的融合蛋白。 [由RefSeq的,2013年8月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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MSANTD3-TMEFF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1226590       rs1226591       rs1226592       rs2780959       rs2780960       rs2800282       rs2800283       rs2800284       rs2800285       rs7859754       rs13295029       rs16919204       rs16919211       rs41274967       rs41274969       rs73495724       rs73657327      

MSANTD3-TMEFF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGGAGAAGGAGAAGAGGA
57
CAGCTTTATATTTGCAGGGTC
57
GGATCTGGAGAAGGAGAAGAG
59
TTTATATTTGCAGGGTCCACAC
59
ATCTGGAGAAGGAGAAGAGG
58
GCTTTATATTTGCAGGGTCCA
59
      尚未收录相关数据

MSANTD3-TMEFF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MSANTD3-TMEFF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0A6YYJ0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 MSANTD3-TMEFF1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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