MIA-RAB4B (MIA-RAB4B readthrough (NMD candidate))

symbol:
MIA-RAB4B
locus group:
other
location:
19q13.2
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100529262
ensembl gene id:
ENSG00000268975
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refseq accession:
NR_037775
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HGNC:48352
approved reserved:
2013-05-10
19q13.2
基因染色体位置图

MIA-RAB4B是一个融合基因,由黑色素瘤抑制性活动基因(MIA)和RAB4B基因融合而成。MIA基因编码一种分泌型蛋白,主要在黑色素瘤细胞中表达,参与细胞外基质的粘附、迁移和侵袭过程,对肿瘤的转移有抑制作用。RAB4B属于RAB家族,是小GTP酶的一种,调控囊泡运输和膜转运,影响细胞内蛋白质的定位和信号传导。MIA-RAB4B融合可能导致功能异常,例如干扰正常的囊泡运输或细胞迁移机制,从而促进肿瘤的恶性进展。该融合基因的突变或异常表达可能破坏MIA和RAB4B的原有功能,导致细胞迁移和侵袭能力增强,与某些癌症(如黑色素瘤)的进展相关。如果MIA-RAB4B过表达,可能加剧肿瘤细胞的转移倾向,而降低表达可能抑制肿瘤的侵袭性。RAB4B属于RAB基因家族,该家族成员均参与调控细胞内运输和膜动力学,通过GTP/GDP循环调节囊泡的形成、移动和融合。RAB家族蛋白的异常通常与癌症、神经退行性疾病和免疫缺陷有关。MIA-RAB4B的研究有助于理解肿瘤转移机制,并为靶向治疗提供潜在方向。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring MIA (melanoma inhibitory activity) and RAB4B (RAB4B, member RAS oncogene family) genes on chromosome 19. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is therefore unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Feb 2011]

这一位点代表自然发生的通读和RAB4B邻近的MIA(黑色素瘤的抑制活性)的转录(RAB4B,成员RAS癌基因家族)19号染色体基因通读成绩单是无义介导的mRNA的候选衰变(NMD),并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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MIA-RAB4B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs139207628       rs181392555       rs183991480       rs188711567       rs527325296       rs534168363       rs542197853       rs556122895       rs560159521       rs578088933       rs7937       rs1048322       rs2233149       rs2233150       rs2233151       rs2233152       rs2233153      

MIA-RAB4B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTCCTGACCATTCACCGG
60
AGTAATCTCCCTGAACGCTG
60
GATTCCTGACCATTCACCG
58
GTAATCTCCCTGAACGCTG
58
ATTCCTGACCATTCACCGG
60
TAATCTCCCTGAACGCTGC
60
      尚未收录相关数据

MIA-RAB4B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MIA-RAB4B基因的本体(GO)信息:

可能调控 MIA-RAB4B基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mucocutaneous Lymph Node Syndrome 0.12 1 1 GWASCAT
Chronic Obstructive Airway Disease 0.12 1 1 GWASCAT

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