MDC1 (mediator of DNA damage checkpoint 1)

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MDC1
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protein-coding gene
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6p21.33
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HGNC:21163
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2003-05-21
6p21.33
基因染色体位置图

MDC1(Mediator of DNA damage checkpoint protein 1)是一种关键的DNA损伤应答蛋白,主要功能是参与细胞对DNA双链断裂(DSBs)的修复和细胞周期检查点的激活。MDC1在DNA损伤反应(DDR)中起核心作用,它通过识别和结合磷酸化的组蛋白H2AX(γ-H2AX)来招募其他修复蛋白(如53BP1、BRCA1和RNF8)到损伤位点,形成修复焦点。MDC1的表达产物是一种支架蛋白,能够协调多种修复途径,包括非同源末端连接(NHEJ)和同源重组(HR)。MDC1的主要作用位点是细胞核,尤其在DNA损伤位点富集。MDC1的突变可能导致其功能丧失,进而削弱DNA损伤修复能力,增加基因组不稳定性,最终可能引发癌症或加速衰老。研究表明,MDC1的缺失或功能异常与多种癌症(如乳腺癌、卵巢癌和淋巴瘤)的发生发展密切相关。如果MDC1过表达,可能增强细胞对DNA损伤的修复能力,但过度激活检查点信号也可能导致细胞周期停滞或凋亡。相反,MDC1表达降低会削弱DNA修复效率,增加突变积累和染色体异常的风险。MDC1属于FHA(Forkhead-associated)结构域蛋白家族,该家族成员通常通过磷酸化依赖的蛋白-蛋白相互作用参与信号转导和DNA损伤应答。基因家族的共性包括含有FHA结构域,能够识别磷酸化的靶蛋白,并在细胞周期调控、DNA修复和应激反应中发挥重要作用。MDC1的功能和调控机制使其成为癌症治疗和放射敏感性研究的潜在靶点。

The protein encoded by this gene contains an N-terminal forkhead domain, two BRCA1 C-terminal (BRCT) motifs and a central domain with 13 repetitions of an approximately 41-amino acid sequence. The encoded protein is required to activate the intra-S phase and G2/M phase cell cycle checkpoints in response to DNA damage. This nuclear protein interacts with phosphorylated histone H2AX near sites of DNA double-strand breaks through its BRCT motifs, and facilitates recruitment of the ATM kinase and meiotic recombination 11 protein complex to DNA damage foci. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质含有N-末端叉头域,二BRCA1基因的C-末端(BRCT)基序和与大约41个氨基酸的序列的13次重复的中央结构域。所编码的蛋白质是必需的,以激活内S期和G2 / M期细胞周期关卡响应于DNA损伤。此核蛋白质通过其BRCT基序的DNA双链断裂的位点附近的磷酸化组蛋白H2AX相互作用,并有利于在ATM激酶和减数分裂重组11蛋白复合物对DNA损伤病灶的募集。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

MDC1基因的碱基序列:[NCBI]
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MDC1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2075015       rs2075015       rs2075015       rs2075015       rs2075015       rs2075015       rs2075015       rs2075015       rs2239885       rs2239885       rs2239885       rs2239885       rs2239885       rs2239885       rs2239885       rs2239885       rs2239886      

MDC1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAAGGCTTCCAGGATCAG
59
ATCTGGAGATTCCTGATCGC
60
CTCCGAGTTTAGATCATGGAG
58
TTCACTGGATTGCTCTGTC
58
TGGAGGATGAACCTACCCA
60
ATTCAGGAGGCCTGTTGTC
60
GCCCAACAGAATACCAAGC
59
CCTGTGAAGAGCACTTTGG
59
CTATGGTGATTCTGAAGATCTGG
58
GTTCATCCTCCATGCTCTG
58
GATTTCCCACTACACCTCG
57
AGGCGATGGTACATTAAGG
57
ACGGAGTTGACACTTTATCCA
60
GGGTGTCCTCCATGATCTG
60
CTTTAGTGGTGCCCATGGA
60
TACCACATTCTTCCCGAGG
59
GGACCAAGGACTCTGAAGAC
60
CTCCATGCTCTGGACTTCC
60
AGTCTCCCAGAAGACAGTG
58
GTCACGACATCCTCTTCCT
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
BRCA1
MDC1
Unknown
STAT3
MDC1
Unknown

MDC1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MDC1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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TAS
GO:0070975
Q14676 (UniProtKB)
IPI

可能调控 MDC1基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Cessation of life 0.00272435 1 0 LHGDN
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 0 GAD
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.002367032 1 0 GAD
Spontaneous abortion 0.002367032 1 0 GAD
Behcet Syndrome 0.002367032 1 1 GAD
Prostatic Neoplasms 0.002367032 1 0 GAD
Ataxia Telangiectasia 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

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