MBD5 (methyl-CpG binding domain protein 5)

symbol:
MBD5
locus group:
protein-coding gene
location:
2q23.2
gene_family:
alias symbol:
FLJ11113|KIAA1461
alias name:
None
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55777
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ENSG00000204406
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uc002twm.5
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NM_001378120
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HGNC:20444
approved reserved:
2003-03-03
2q23.2
基因染色体位置图

MBD5(甲基化CpG结合结构域蛋白5)是一种表观遗传调控蛋白,属于甲基化CpG结合结构域(MBD)基因家族。该家族成员(如MBD1-6和MeCP2)的共同特点是含有保守的甲基化CpG结合结构域,能够识别并结合DNA甲基化位点,参与基因表达的调控。MBD5主要在大脑、心脏和骨骼肌中表达,通过与甲基化DNA结合并招募染色质重塑复合物(如NuRD复合物)来调节靶基因的转录活性,影响神经发育、突触可塑性和认知功能。MBD5的功能异常与多种神经发育疾病相关,例如2q23.1微缺失综合征(表现为智力障碍、自闭症谱系障碍和癫痫),该综合征中MBD5单倍剂量不足(表达降低)是主要致病因素。MBD5突变(如无义突变或移码突变)可能导致其丧失DNA结合能力或蛋白稳定性,进而破坏下游基因调控网络。过表达MBD5可能通过异常抑制靶基因(如神经元分化相关基因)干扰神经发育,而表达降低则可能导致甲基化敏感基因(如BDNF或GABRB3)的失调,影响突触功能。此外,MBD5与染色质修饰酶(如HDAC3)的相互作用表明其在表观遗传重编程中起关键作用。该基因的调控异常还可能影响邻近基因(如ACYP2)的表达,因其位于染色质拓扑关联域(TAD)边界区域。MBD家族成员的共性包括通过甲基化依赖或非依赖机制调控基因沉默、参与X染色体失活(如MeCP2)和维持基因组稳定性(如MBD4的DNA修复功能)。MBD5的独特之处在于其C端含有低复杂度区域,可能参与相分离或蛋白互作,但其具体机制仍需进一步研究。

This gene encodes a member of the methyl-CpG-binding domain (MBD) family. The MBD consists of about 70 residues and is the minimal region required for a methyl-CpG-binding protein binding specifically to methylated DNA. In addition to the MBD domain, this protein contains a PWWP domain (Pro-Trp-Trp-Pro motif), which consists of 100-150 amino acids and is found in numerous proteins that are involved in cell division, growth and differentiation. Mutations in this gene cause mental retardation autosomal dominant type 1. Haploinsufficiency of this gene is associated with a syndrome involving microcephaly, intellectual disabilities, severe speech impairment, and seizures. Alternatively spliced transcript variants have been found, but their full-length nature is not determined. [provided by RefSeq, Mar 2010]

该基因编码的甲基化CpG结合域(MBD)家族的一个成员。所述MBD由约70个残基并且为甲基化CpG结合蛋白特异性结合的甲基化DNA所需的最小区域。除了MBD域,该蛋白质包含一个PWWP域(临色氨酸色氨酸-Pro的基序),其由100-150个氨基酸,并在所涉及的细胞分裂,生长和分化众多蛋白质被发现。这种基因造成智障常染色体显性遗传型1.这种基因的单倍剂量不足的突变与包括小头畸形,智力残疾,严重的语言障碍和癫痫发作的综合征有关。可变剪接转录物变体已被发现,但它们的全长性质没有确定。 [由RefSeq的,2010年3月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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MBD5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4001       rs1227475       rs1227476       rs1227477       rs1227478       rs1227479       rs1597406       rs1823447       rs4972324       rs6430290       rs6430291       rs6430292       rs6750021       rs7569629       rs7580420       rs7580610       rs7602932      

MBD5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCTCACTACACCCAGGAG
59
TGATAATTGTCTTTCCTGCCC
58
ACATCTCACTACACCCAGG
58
AATGTACATCTTTCCTGCCC
58
ATAAGCACTAAAGGACCAAGG
58
GGTTCTATGGATTGATGAAGGA
58
GAGGAAGGGAAGGTACACC
59
GTTATCTGGAGATCTTCCTCCT
59
ATGTCTGGGACTGTACACC
59
TTATCTGGAGATCTTCCTCCTC
58
CTTTATTACCCTTTGTGTCATCCTC
60
CTGGTGTTTAACGATCCTTTCC
60
GCTTTATGTCAGTCCCAGTG
59
TTGCATGTTCCATCAGTAAGC
59
AGTGCTTTATGTCAGTCCCA
59
CATGTTCCATCAGTAAGCAGG
59
AAATGTCTGGGACTGTACAC
58
ATCTGGAGATCTTCCTCCTC
58
GAGGAAGGGAAGGTACACC
59
TTATCTGGAGATCTTCCTCCTC
58
      尚未收录相关数据

MBD5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MBD5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A0D9SG23 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A0D9SG23 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
E9PHH0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E9PHH0 (UniProtKB)
IEA
GO:0002230
Q9P267 (UniProtKB)
IMP
GO:0003682
Q9P267 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9P267 (UniProtKB)
IDA
GO:0007399
Q9P267 (UniProtKB)
IMP
GO:0010369
Q9P267 (UniProtKB)
IDA
GO:0040014
Q9P267 (UniProtKB)
ISS
GO:0042593
Q9P267 (UniProtKB)
ISS
GO:0044708
Q9P267 (UniProtKB)
IMP
GO:0060399
Q9P267 (UniProtKB)
ISS
GO:0070062
Q9P267 (UniProtKB)
IDA
GO:0098779
Q9P267 (UniProtKB)
IGI
GO:0098792
Q9P267 (UniProtKB)
IMP
GO:0003677
Q9P267 (UniProtKB)
IDA

可能调控 MBD5基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mental Retardation, Autosomal Dominant 1 0.44 0 2 CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET
Intellectual Disability 0.001085767 4 0 BeFree
Autism Spectrum Disorders 0.001085767 4 0 BeFree
Neurodevelopmental Disorders 0.001085767 4 0 BeFree
Atrial Septal Defects 0.000814326 3 0 BeFree
Seizures 0.000814326 3 0 BeFree
Autistic Disorder 0.000814326 3 0 BeFree
Epilepsy 0.000542884 2 0 BeFree
Dysmorphic features 0.000542884 2 0 BeFree
Developmental delay (disorder) 0.000542884 2 0 BeFree

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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