MAGEC2 (MAGE family member C2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
MAGEC2
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq27.2
gene_family:
alias symbol:
CT10|MAGE-C2|HCA587
alias name:
cancer/testis antigen 10
entrez id:
51438
ensembl gene id:
ENSG00000046774
ucsc gene id:
uc004fbu.3
refseq accession:
NM_016249
hgnc_id:
HGNC:13574
approved reserved:
2000-09-26

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq27.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene is a member of the MAGEC gene family. It is not expressed in normal tissues, except for testis, and is expressed in tumors of various histological types. This gene and the other MAGEC genes are clustered on chromosome Xq26-q27. [provided by RefSeq, Oct 2009]

此基因是MAGEC基因家族的一个成员。它不是在正常组织中表达，除了睾丸，以及通过各种组织学类型的肿瘤中表达。这种基因和其他基因MAGEC都聚集在染色体Xq26-Q27。 [由RefSeq的，2009年10月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

MAGEC2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs781408694       rs781716511       rs781223822       rs781340786       rs781066820       rs780977364       rs780685020       rs780874472       rs780662067       rs780273500       rs780216013       rs780128435       rs780119567       rs779685385       rs779866993       rs779633618       rs779168413      

基因表达

基因表达

MAGEC2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGAACTGAGGGACCTCC
59
AGATCCAACAGGCCTTGAC
60
GGAAGAACTGAGGGACCTC
59
ATCCAACAGGCCTTGACTC
60
GAAGAACTGAGGGACCTCC
59
ATCCAACAGGCCTTGACTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

MAGEC2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MAGEC2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBF1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9UBF1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9UBF1 (UniProtKB)
IDA
GO:0031625
Q9UBF1 (UniProtKB)
IDA
GO:0044257
Q9UBF1 (UniProtKB)
IMP
GO:0051443
Q9UBF1 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 MAGEC2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.007262917 8 0 BeFree_GAD_LHGDN
Liver carcinoma 0.003810118 5 0 BeFree_LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Fibrinogen Adverse Event 0.002367032 1 1 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD
Cardiovascular Diseases 0.002367032 1 1 GAD
Malignant neoplasm of testis 0.002171535 8 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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