MADCAM1 (mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1)

symbol:
MADCAM1
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.3
gene_family:
Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
MACAM1
alias name:
mucosal addressin cell adhesion mo…
entrez id:
8174
ensembl gene id:
ENSG00000099866
ucsc gene id:
uc002los.5
refseq accession:
NM_130760
hgnc_id:
HGNC:6765
approved reserved:
2000-02-11
19p13.3
基因染色体位置图

MADCAM1(Mucosal Vascular Addressin Cell Adhesion Molecule 1)是一种细胞表面黏附分子,属于免疫球蛋白超家族(IgSF)成员,主要表达于肠道、脾脏和淋巴结等黏膜相关淋巴组织(MALT)的高内皮微静脉(HEV)上。它的生物学功能是介导淋巴细胞归巢(homing),即引导淋巴细胞从血液迁移至特定组织,尤其是肠道黏膜。MADCAM1通过与淋巴细胞表面的整合素α4β7和L-选择素(CD62L)结合,促进淋巴细胞黏附并穿越血管内皮,进入肠道固有层或派氏结(Peyer's patches),从而参与黏膜免疫应答。该基因的表达受炎症因子(如TNF-α和IL-1β)调控,在炎症性肠病(IBD)如克罗恩病和溃疡性结肠炎中表达显著升高。突变或异常表达可能导致免疫细胞迁移紊乱,例如MADCAM1过表达会加剧肠道炎症,而降低表达则可能削弱黏膜免疫防御,增加感染风险。MADCAM1属于地址素(addressin)家族,该家族共性是通过特定配体-受体相互作用指导免疫细胞定向迁移。此外,MADCAM1还与HIV感染相关,因其靶向的α4β7整合素是HIV进入肠道黏膜的途径之一。针对MADCAM1的抗体(如vedolizumab)已用于IBD治疗,通过阻断α4β7-MADCAM1相互作用抑制炎症反应。

The protein encoded by this gene is an endothelial cell adhesion molecule that interacts preferentially with the leukocyte beta7 integrin LPAM-1 (alpha4beta7), L-selectin, and VLA-4 (alpha4beta1) on myeloid cells to direct leukocytes into mucosal and inflamed tissues. It is a member of the immunoglobulin family and is similar to ICAM1 and VCAM1. At least seven alternatively spliced transcripts encoding different protein isoforms have been found for this gene, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是内皮细胞粘附分子,与白细胞β7整联蛋白LPAM-1(α4β7同),L-选择素和髓系细胞VLA-4(alpha4beta1)优先相互作用,以直接的白细胞到粘膜和发炎的组织。它是免疫球蛋白家族的成员,并且是类似于ICAM1和VCAM1。已发现此基因至少七个编码不同蛋白同种型的可变剪接转录物,但一些变体的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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MADCAM1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs758502       rs758503       rs1063736       rs1140822       rs1140823       rs2008482       rs2302217       rs2392797       rs2392798       rs2392799       rs2392800       rs2392801       rs3745925       rs3999753       rs3999754       rs4919835       rs4919906      

MADCAM1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATCACCTCTGGAAACGCT
58
CAGAAGCCTCAGAGAAGCT
59
AATGGGTGGTATCCTGCAC
60
GTTGGGATCACTTCTCCCT
59
AAGTGATCCCAACAGGCTC
60
CGTTTCCAGAGGTGATAGGT
59
TATCACCTCTGGAAACGCT
58
CAGAAGCCTCAGAGAAGCT
59
AAATGGGTGGTATCCTGCA
59
TTGGGATCACTTCTCCCTG
59
AAGTGATCCCAACAGGCTC
60
TTTCCAGAGGTGATAGGTGG
59
TATCACCTCTGGAAACGCTG
60
AGAAGCCTCAGAGAAGCTG
59
TATCACCTCTGGAAACGCTG
60
AGAAGCCTCAGAGAAGCTG
59
TATCACCTCTGGAAACGCT
58
AGAAGCCTCAGAGAAGCTG
59
AAGTGATCCCAACAGGCTC
60
TTCCAGAGGTGATAGGTGG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
BTF3
MADCAM1
Repression
NFKB1
MADCAM1
Unknown
RELA
MADCAM1
Unknown

MADCAM1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MADCAM1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007155
A0A087WWC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087WWC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WXC9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087WXC9 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087X0U8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087X0U8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087X1F1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087X1F1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087X1M5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087X1M5 (UniProtKB)
IEA
GO:0002687
Q13477 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0006955
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0007160
Q13477 (UniProtKB)
IDA
GO:0007165
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0007229
Q13477 (UniProtKB)
IDA
GO:0007568
Q13477 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q13477 (UniProtKB)
IEA
GO:0030198
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0034113
Q13477 (UniProtKB)
IMP
GO:0043113
Q13477 (UniProtKB)
IDA
GO:0050776
Q13477 (UniProtKB)
TAS
GO:0050901
Q13477 (UniProtKB)
IDA
GO:0098640
Q13477 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
U3KQ59 (UniProtKB)
IEA

可能调控 MADCAM1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colitis 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Ovarian Cysts 0.12 1 0 CTD_human
Crohn Disease 0.08272435 2 0 LHGDN_RGD
Food Allergy 0.08 1 0 RGD
Gastritis 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Inflammation 0.00272435 1 0 LHGDN
Graft-vs-Host Disease 0.002367032 1 0 GAD
Mucosa-Associated Lymphoid Tissue Lymphoma 0.000814326 3 0 BeFree
Adhesion of intestine 0.000271442 1 0 BeFree
Ulcerative Colitis 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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