LYAR (Ly1 antibody reactive)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LYAR
locus group:
protein-coding gene
location:
4p16.3
gene_family:
Zinc fingers, C2HC-type|Zinc fingers - ungrouped
alias symbol:
ZC2HC2|ZLYAR
alias name:
cell growth-regulating nucleolar p…
entrez id:
55646
ensembl gene id:
ENSG00000145220
ucsc gene id:
uc003ght.4
refseq accession:
NM_017816
hgnc_id:
HGNC:26021
approved reserved:
2007-06-04

基因染色体位置

基因染色体位置

4p16.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LYAR（Ly1 antibody reactive）基因位于人类染色体4q31.3，编码一种核仁锌指蛋白，属于LYAR家族。该家族成员通常含有C2H2型锌指结构域，参与RNA结合和核仁功能调控。LYAR蛋白在核仁中富集，与核糖体生物发生相关，通过调控rRNA加工和核糖体亚基组装影响蛋白质合成。其主要作用位点包括核仁和染色质，参与细胞周期调控、干细胞自我更新和胚胎发育。LYAR在多种组织中表达，尤其在增殖活跃的细胞（如造血干细胞和癌细胞）中高表达。突变可能导致核仁功能异常，影响细胞增殖和分化，与发育缺陷和癌症发生相关。研究发现LYAR与急性髓系白血病（AML）和神经母细胞瘤等恶性肿瘤密切相关，其过表达促进癌细胞增殖、抑制凋亡，并可能通过激活MYC等致癌信号通路驱动肿瘤进展。降低LYAR表达会抑制癌细胞生长，但可能导致正常干细胞功能受损。LYAR还参与p53通路调控，其缺失可能增强p53介导的细胞凋亡。该基因家族（LYAR家族）的共性包括：含有保守的锌指结构域、核仁定位、参与RNA代谢和翻译调控，并在干细胞维持和肿瘤发生中起重要作用。研究表明LYAR与PLAG1等蛋白相互作用，共同调控靶基因转录。在胚胎发育中，LYAR对中胚层分化至关重要，敲除小鼠模型显示胚胎致死表型。此外，LYAR可能通过表观遗传调控（如组蛋白修饰）影响基因表达。其表达水平受MYCN等转录因子调控，在神经嵴发育和黑色素瘤中也有功能报道。针对LYAR的干预可能成为癌症治疗新策略，但需考虑其对正常干细胞的影响。

None

无

OMIM数据库中对LYAR基因的介绍     Wikipedia数据库中对LYAR基因的介绍

基因序列

基因序列

LYAR基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LYAR基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs920683       rs920684       rs920685       rs1048898       rs1048899       rs2117286       rs2272738       rs2272739       rs2272740       rs2272741       rs2272743       rs2280926       rs2280927       rs2916432       rs2916433       rs2916434       rs2916435      

基因表达

基因表达

LYAR基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTAGGATCAGAATAACTACTGCG
59
AGACAGCAAACATTGCACC
59
TTTGACAACGTTCCCAGGA
60
CCTTATTGACTGGTTCGCTG
59
AGCAATTCTGAAACAGGCC
59
TCACTGTGTAGTACTGAGCT
58
TTTGACAACGTTCCCAGGA
60
CCTTATTGACTGGTTCGCTG
59
GCACTCGGAAGTTGAAACAG
60
TCATCGTCTTCTGGTTCTCC
59
GCAATTCTGAAACAGGCCC
60
GTCACTGTGTAGTACTGAGCT
59
CTTAGGATCAGAATAACTACTGCG
59
GACAGCAAACATTGCACCA
60
GCACTCGGAAGTTGAAACAG
60
TCATCGTCTTCTGGTTCTCC
59
GCAATTCTGAAACAGGCCC
60
TCACTGTGTAGTACTGAGCT
58
GCACTCGGAAGTTGAAACAG
60
ATCGTCTTCTGGTTCTCCG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LYAR基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LYAR基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9NX58 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NX58 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NX58 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NX58 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NX58 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9NX58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9NX58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9NX58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9NX58 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q9NX58 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q9NX58 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q9NX58 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LYAR基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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