LY6K (lymphocyte antigen 6 family member K)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LY6K
locus group:
protein-coding gene
location:
8q24.3
gene_family:
alias symbol:
HSJ001348|FLJ35226|CT97
alias name:
cancer/testis antigen 97
entrez id:
54742
ensembl gene id:
ENSG00000160886
ucsc gene id:
uc011ljv.3
refseq accession:
NM_017527
hgnc_id:
HGNC:24225
approved reserved:
2004-11-11

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LY6K基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2164308       rs2244152       rs2244163       rs2294011       rs2294012       rs2572899       rs2585153       rs2585154       rs2953489       rs28719133       rs34979640       rs35386446       rs62511301       rs71514094       rs76268228       rs78926635       rs78958228      

基因表达

基因表达

LY6K基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGACGAGGGTGACAATAGAG
59
GCCCTGAAGATCTCCTCAC
59
AGACAACGAGATCCAGAGG
59
GACACCACACTCTATTGTCAC
59
CCATACTGCGTTATAGCGG
58
CTGTCCATATGCACTGGGA
59
AAACACTTTCGAGTGCCAG
59
GCCCTGAAGATCTCCTCAC
60
GGACGAGGGTGACAATAGAG
59
CTCTGTCCATTTGCACCTC
58
AGACAACGAGATCCAGAGG
59
GACACCACACTCTATTGTCAC
59
AGACAACGAGATCCAGAGG
59
GACACCACACTCTATTGTCAC
59
CATACTGCGTTATAGCGGC
59
CTGTCCATATGCACTGGGA
59
GAGACAACGAGATCCAGAG
57
ACACCACACTCTATTGTCAC
58
GAGACAACGAGATCCAGAG
57
ACACCACACTCTATTGTCAC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LY6K基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LY6K基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q17RY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q17RY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q17RY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
Q17RY6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LY6K基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Esophageal Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.000542884 2 0 BeFree
Esophageal carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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