LY6G6D (lymphocyte antigen 6 family member G6D)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LY6G6D
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.33
gene_family:
alias symbol:
MEGT1|Ly6-D|G6D|LY6-D|NG25
alias name:
None
entrez id:
58530
ensembl gene id:
ENSG00000244355
ucsc gene id:
uc011iqp.2
refseq accession:
NM_021246
hgnc_id:
HGNC:13935
approved reserved:
2002-04-05

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LY6G6D belongs to a cluster of leukocyte antigen-6 (LY6) genes located in the major histocompatibility complex (MHC) class III region on chromosome 6. Members of the LY6 superfamily typically contain 70 to 80 amino acids, including 8 to 10 cysteines. Most LY6 proteins are attached to the cell surface by a glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchor that is directly involved in signal transduction (Mallya et al., 2002 [PubMed 12079290]).[supplied by OMIM, Apr 2009]

LY6G6D属于位于主要组织相容性复合白细胞抗原-6（LY6）基因簇（MHC）类第三区域染色体6. LY6超家族成员通常包含70至80个氨基酸，其中包括8至10半胱氨酸。最LY6蛋白是由直接参与的信号转导一个糖基（GPI）锚附着于细胞表面（马尔雅等人，2002年[搜索PubMed 12079290]）。[由OMIM，2009年4月供给]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LY6G6D基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs405722       rs3131384       rs9461716       rs9461717       rs11752227       rs12524467       rs55652519       rs71552076       rs111494486       rs114629019       rs118062293       rs143753187       rs146655668       rs148990213       rs149309855       rs182503580       rs183594073      

基因表达

基因表达

LY6G6D基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAAGCTACCTGGAAACCG
60
TGTGATTTCAAGGAGCCCA
59
TCAAGCTACCTGGAAACCC
59
TTGATTGCAATGATGGGCT
58
ATCAAGCTACCTGGAAACCC
60
TGATTGCAATGATGGGCTG
59
TCAAGCTACCTGGAAACCG
60
GATTTCAAGGAGCCCAAAGG
59
TCAAGCTACCTGGAAACCC
59
TGATTGCAATGATGGGCTG
59
TCAAGCTACCTGGAAACCG
60
ATTTCAAGGAGCCCAAAGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LY6G6D基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LY6G6D基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
O95868 (UniProtKB)
IEA
GO:0030175
O95868 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
O95868 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LY6G6D基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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