LY6G6D (lymphocyte antigen 6 family member G6D)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LY6G6D
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.33
gene_family:
alias symbol:
MEGT1|Ly6-D|G6D|LY6-D|NG25
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None
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58530
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ENSG00000244355
ucsc gene id:
uc011iqp.2
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NM_021246
hgnc_id:
HGNC:13935
approved reserved:
2002-04-05

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LY6G6D（淋巴细胞抗原6复合物基因G6D）属于LY6基因家族，该家族编码一类通过糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定在细胞膜上的小分子蛋白，其成员通常参与免疫调节、细胞信号传导和细胞间相互作用。LY6G6D的生物学功能尚未完全明确，但基于家族共性推测可能参与免疫细胞（如T细胞、B细胞或自然杀伤细胞）的激活或分化调控。其表达产物具有典型的LY6结构域，包含保守的半胱氨酸残基形成二硫键，维持蛋白稳定性。主要作用位点可能在细胞膜表面，通过与配体或受体相互作用影响免疫微环境。目前研究发现LY6G6D在多种癌症（如结直肠癌、胃癌）中异常高表达，可能与肿瘤免疫逃逸相关，其过表达可能抑制抗肿瘤免疫反应，具体机制可能涉及干扰免疫检查点通路（如PD-1/PD-L1）。降低表达时可能增强免疫系统对癌细胞的识别能力。该基因突变的研究较少，但家族其他成员（如LY6E）的突变可能影响病毒感染防御功能。LY6基因家族的共性包括：编码80-150个氨基酸的小分子蛋白，具有高度保守的LY6/uPAR结构域，通过GPI锚定于细胞膜，多与炎症、感染或肿瘤微环境调控相关。需要注意的是，LY6G6D曾用名G6D或C6orf23，部分数据库仍沿用旧称。目前针对该基因的研究仍处于早期阶段，其精确功能及临床意义需进一步验证。

LY6G6D belongs to a cluster of leukocyte antigen-6 (LY6) genes located in the major histocompatibility complex (MHC) class III region on chromosome 6. Members of the LY6 superfamily typically contain 70 to 80 amino acids, including 8 to 10 cysteines. Most LY6 proteins are attached to the cell surface by a glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchor that is directly involved in signal transduction (Mallya et al., 2002 [PubMed 12079290]).[supplied by OMIM, Apr 2009]

LY6G6D属于位于主要组织相容性复合白细胞抗原-6（LY6）基因簇（MHC）类第三区域染色体6. LY6超家族成员通常包含70至80个氨基酸，其中包括8至10半胱氨酸。最LY6蛋白是由直接参与的信号转导一个糖基（GPI）锚附着于细胞表面（马尔雅等人，2002年[搜索PubMed 12079290]）。[由OMIM，2009年4月供给]

OMIM数据库中对LY6G6D基因的介绍     Wikipedia数据库中对LY6G6D基因的介绍

基因序列

基因序列

LY6G6D基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LY6G6D基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs405722       rs3131384       rs9461716       rs9461717       rs11752227       rs12524467       rs55652519       rs71552076       rs111494486       rs114629019       rs118062293       rs143753187       rs146655668       rs148990213       rs149309855       rs182503580       rs183594073      

基因表达

基因表达

LY6G6D基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAAGCTACCTGGAAACCG
60
TGTGATTTCAAGGAGCCCA
59
TCAAGCTACCTGGAAACCC
59
TTGATTGCAATGATGGGCT
58
ATCAAGCTACCTGGAAACCC
60
TGATTGCAATGATGGGCTG
59
TCAAGCTACCTGGAAACCG
60
GATTTCAAGGAGCCCAAAGG
59
TCAAGCTACCTGGAAACCC
59
TGATTGCAATGATGGGCTG
59
TCAAGCTACCTGGAAACCG
60
ATTTCAAGGAGCCCAAAGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LY6G6D基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LY6G6D基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
O95868 (UniProtKB)
IEA
GO:0030175
O95868 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
O95868 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LY6G6D基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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