LUCAT1 (lung cancer associated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LUCAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
5q14.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
SCAL1|SCAT5
alias name:
smoke and cancer associated lncRNA…
entrez id:
100505994
ensembl gene id:
ENSG00000248323
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_103548
hgnc_id:
HGNC:48498
approved reserved:
2013-05-18

基因染色体位置

基因染色体位置

5q14.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LUCAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1912726       rs4639266       rs4916857       rs4916858       rs5869540       rs6865066       rs6876796       rs6877420       rs6882178       rs7704529       rs7721772       rs7727632       rs7732832       rs9293563       rs9293564       rs9293565       rs10036206      

基因表达

基因表达

LUCAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAACCCATCAGAAGATGTCAG
58
TGCCTCTGTTTATCCATCTC
57
ACAATGGTATTTCTGACTTGGC
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60
ACAATGGTATTTCTGACTTGGC
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60
CAATGGTATTTCTGACTTGGC
58
GAGCGAAACTCTGTAGCTC
58
AACCCATCAGAAGATGTCAG
57
TGCCTCTGTTTATCCATCTC
57
CAATGGTATTTCTGACTTGGC
58
GAGCGAAACTCTGTAGCTC
58
CAATGGTATTTCTGACTTGGCT
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60
CATCAGAAGATGTCAGAAGATAAGG
59
GTTGCCTCTGTTTATCCATCTC
59
CAATGGTATTTCTGACTTGGCT
59
AGCGAAACTCTGTAGCTCAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LUCAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LUCAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LUCAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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