LSM8 (LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated)

symbol:
LSM8
locus group:
protein-coding gene
location:
7q31.31
gene_family:
alias symbol:
YJR022W
alias name:
None
entrez id:
51691
ensembl gene id:
ENSG00000128534
ucsc gene id:
uc002giz.4
refseq accession:
NM_016200
hgnc_id:
HGNC:20471
approved reserved:
2003-02-17
7q31.31
基因染色体位置图

LSM8基因属于LSM(Like-Sm)基因家族,该家族成员编码的蛋白质通常参与RNA代谢过程,如mRNA剪接、降解和调控。LSM8编码的蛋白是U6小核核糖核蛋白(U6 snRNP)复合体的核心组成部分,该复合体在pre-mRNA剪接中起关键作用,确保mRNA的正确加工和成熟。LSM8蛋白与其他LSM家族成员(如LSM2-7)形成环状结构,通过结合U6 snRNA稳定其构象,从而促进剪接体的组装和功能。LSM家族的共性在于它们均含有保守的Sm样结构域,能够与RNA结合并参与多种RNA相关过程。LSM8的功能异常可能导致剪接体功能障碍,进而影响基因表达调控。研究表明,LSM8突变可能与某些遗传性疾病或癌症相关,因为错误的剪接可能产生异常蛋白,破坏细胞稳态。若LSM8过表达,可能干扰剪接体平衡,导致非特异性RNA结合或剪接错误,影响其他基因的正常表达;而降低表达则可能削弱剪接效率,引发mRNA加工缺陷,甚至触发细胞凋亡。此外,LSM8的表达水平变化可能影响依赖剪接的基因网络,例如与细胞周期或DNA修复相关的基因,从而间接影响增殖或基因组稳定性。目前对LSM8的研究仍在深入,其在疾病中的具体机制及潜在治疗靶点价值有待进一步探索。

This gene encodes a member of the like-Sm family of proteins. The encoded protein consists of a closed barrel shape, made up of five anti-parallel beta strands and an alpha helix. This protein partners with six paralogs to form a heteroheptameric ring which transiently binds U6 small nuclear RNAs and is involved in the general maturation of RNA in the nucleus. [provided by RefSeq, Jan 2010]

该基因编码等钐蛋白家族的一个成员。所编码的蛋白质包括一个封闭的筒状,由五个反平行β链和α螺旋的。有六个旁系这种蛋白伙伴以形成瞬时结合U6小核RNA和参与RNA的核中一般成熟一个heteroheptameric环。 [由RefSeq的,2010年1月提供]

LSM8基因的碱基序列:[NCBI]
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LSM8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2041527       rs2896241       rs2896242       rs3757799       rs3757800       rs4727860       rs4727861       rs5886890       rs6466648       rs6945543       rs6965144       rs7780015       rs7785444       rs7798529       rs9641593       rs9655829       rs10237829      

LSM8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAATGATTGTGGGAACACTG
59
AGCTGAATACTCGTTCATGG
58
AGAATGATTGTGGGAACACTG
59
GCTGAATACTCGTTCATGGC
60
GAATGATTGTGGGAACACTG
57
AGCTGAATACTCGTTCATGG
58
      尚未收录相关数据

LSM8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LSM8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000398
O95777 (UniProtKB)
IBA
GO:0000398
O95777 (UniProtKB)
TAS
GO:0003723
O95777 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95777 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
O95777 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O95777 (UniProtKB)
TAS
GO:0005681
O95777 (UniProtKB)
IEA
GO:0017070
O95777 (UniProtKB)
NAS
GO:0044822
O95777 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O95777 (UniProtKB)
IDA
GO:0046540
O95777 (UniProtKB)
IBA

可能调控 LSM8基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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