LRRC8A (leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit A)

symbol:
LRRC8A
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.11
gene_family:
alias symbol:
KIAA1437|FLJ10337|SWELL1
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None
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56262
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ENSG00000136802
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uc004bwl.5
refseq accession:
NM_019594
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HGNC:19027
approved reserved:
2003-09-26
9q34.11
基因染色体位置图

LRRC8A(Leucine-Rich Repeat-Containing 8A)是LRRC8基因家族的重要成员,该家族包括LRRC8A、LRRC8B、LRRC8C、LRRC8D和LRRC8E五个基因。这些基因编码的蛋白质均含有富含亮氨酸的重复序列(LRR),并共同形成体积调节性阴离子通道(VRAC),在细胞体积调节、渗透压平衡和物质转运中发挥核心作用。LRRC8A是VRAC通道的必要组分,缺乏它则无法形成功能性通道。该通道主要位于细胞膜上,可通透氯离子、有机溶质及某些抗癌药物,参与细胞凋亡、迁移和免疫调节等过程。LRRC8A的突变可能导致通道功能异常,与多种疾病相关,如淋巴水肿、神经退行性疾病和癌症。例如,某些突变会削弱通道活性,影响细胞体积调节,导致细胞在低渗环境中破裂;而另一些突变可能增强通道功能,与肿瘤细胞耐药性相关。LRRC8A过表达可能增强VRAC通道活性,促进抗癌药物外排(如顺铂),导致化疗耐药;还可能通过影响离子平衡加剧缺血性脑损伤。相反,LRRC8A表达降低会削弱VRAC功能,使细胞难以应对渗透压变化,可能诱发听力损失(因内耳毛细胞损伤)或加重神经系统疾病。该基因还与T细胞活化相关,其表达异常可能影响免疫应答。LRRC8家族成员的共性是形成异源六聚体通道,各亚基组合决定通道特性——例如含LRRC8D的通道对化疗药物更敏感。LRRC8A作为必需亚基,其研究为癌症治疗、免疫疾病和神经保护提供了潜在靶点。

This gene encodes a protein belonging to the leucine-rich repeat family of proteins, which are involved in diverse biological processes, including cell adhesion, cellular trafficking, and hormone-receptor interactions. This family member is a putative four-pass transmembrane protein that plays a role in B cell development. Defects in this gene cause autosomal dominant non-Bruton type agammaglobulinemia, an immunodeficiency disease resulting from defects in B cell maturation. Multiple alternatively spliced transcript variants, which encode the same protein, have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码属于富含亮氨酸重复蛋白家族,其参与多种生物过程,包括细胞粘着,细胞运输,和激素 - 受体相互作用的蛋白质。该家族成员是播放在B细胞发育中起作用的推定四跨膜蛋白。在该基因引起的常染色体显性的缺陷的非布鲁顿型丙种球蛋白血症,从在B细胞成熟缺陷导致的免疫缺陷病。多个可变剪接转录物变体,其编码相同的蛋白质,已经鉴定了此基因。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

LRRC8A基因的碱基序列:[NCBI]
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LRRC8A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1923619       rs2417133       rs4836632       rs7020013       rs7046797       rs7860709       rs10988141       rs12005839       rs12683091       rs56372316       rs71497425       rs71499425       rs71499426       rs72436646       rs72758878       rs73669984       rs76182016      

LRRC8A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTAGATGCTCACCAGAGG
58
CTTAAACACCAAATCCACCC
57
TCCAGAACCTAGCCATCAC
59
TGTGTTGAACAGGTCCTCC
60
ATTAGCCATCAGGTGAGGC
60
GTGTTGAACAGGTCCTCCT
59
TCCAGAACCTAGCCATCAC
59
GTGTTGAACAGGTCCTCCT
59
GCATATGGAGTAGATGCTCAC
59
CCAAATCCACCCATCATCTC
58
GATTAGCCATCAGGTGAGG
57
TGTTGAACAGGTCCTCCTC
59
TCAGTCCAGGTGTCTTTGTC
60
GGATCAGCAGGAGTTACCC
60
ATTAGCCATCAGGTGAGGC
60
TGTTGAACAGGTCCTCCTC
59
TCCAGAACCTAGCCATCAC
59
TGTTGAACAGGTCCTCCTC
59
      尚未收录相关数据

LRRC8A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LRRC8A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002329
Q8IWT6 (UniProtKB)
ISS
GO:0005225
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0005515
Q8IWT6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IWT6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IWT6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IWT6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q8IWT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q8IWT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0006820
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0006820
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0006884
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0006884
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0006970
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0006970
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0009986
Q8IWT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q8IWT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0034702
Q8IWT6 (UniProtKB)
IDA
GO:0044070
Q8IWT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0098656
Q8IWT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005253
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP
GO:0005253
Q8IWT6 (UniProtKB)
IMP

可能调控 LRRC8A基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Agammaglobulinemia 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
AGAMMAGLOBULINEMIA 5, AUTOSOMAL DOMINANT 0.12 0 0 CLINVAR
Humoral immune defect 0.000271442 1 0 BeFree

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