LRAT (lecithin retinol acyltransferase)

symbol:
LRAT
locus group:
protein-coding gene
location:
4q32.1
gene_family:
alias symbol:
LCA14
alias name:
phosphatidylcholine--retinol O-acy…
entrez id:
9227
ensembl gene id:
ENSG00000121207
ucsc gene id:
uc063akh.1
refseq accession:
NM_004744
hgnc_id:
HGNC:6685
approved reserved:
1999-02-16
4q32.1
基因染色体位置图

LRAT(卵磷脂-胆固醇酰基转移酶)是一种在胆固醇代谢中起关键作用的酶,属于酰基转移酶基因家族。该基因编码的蛋白质主要表达于肝脏和视网膜,负责将游离胆固醇转化为胆固醇酯,这是胆固醇储存和运输的主要形式。LRAT的生物学功能包括促进高密度脂蛋白(HDL)的成熟和胆固醇逆向转运,这对维持体内胆固醇平衡至关重要。LRAT还在视觉循环中发挥作用,通过将视黄醇转化为视黄酯,为视网膜感光细胞提供必需的维生素A衍生物。LRAT的主要作用位点是肝脏、视网膜和小肠。突变或功能异常可能导致家族性卵磷脂-胆固醇酰基转移酶缺乏症(LCAT缺乏症),这是一种罕见的遗传性疾病,特征为角膜混浊、贫血和肾脏疾病。此外,LRAT功能紊乱还与动脉粥样硬化、年龄相关性黄斑变性等疾病相关。如果LRAT过表达,可能会增加胆固醇酯的积累,导致动脉粥样硬化风险升高;而表达降低则可能损害胆固醇逆向转运和视觉功能,引起代谢紊乱和视力问题。LRAT属于酰基转移酶基因家族,该家族成员通常参与脂质代谢,具有转移酰基的共同功能特性。这个家族的酶在多种生物过程中发挥作用,包括能量储存、膜形成和信号传导。LRAT与其他家族成员共享保守的结构域,特别是催化活性所必需的氨基酸残基。

The protein encoded by this gene localizes to the endoplasmic reticulum, where it catalyzes the esterification of all-trans-retinol into all-trans-retinyl ester. This reaction is an important step in vitamin A metabolism in the visual system. Mutations in this gene have been associated with early-onset severe retinal dystrophy and Leber congenital amaurosis 14. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014]

由该基因编码的蛋白质定位于内质网,它催化全反式 - 视黄醇的酯化成全反式 - 视黄基酯。此反应是在视觉系统维生素A代谢的重要步骤。在这种基因突变与早发性严重视网膜营养不良和莱伯先天性黑朦14.选择性剪接的结果在多个转录变体相关联。 [由RefSeq的,2014年8月提供]

LRAT基因的碱基序列:[NCBI]
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LRAT基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs23272       rs172097       rs172098       rs188032       rs191849       rs191850       rs201820       rs201821       rs201822       rs201823       rs201824       rs201825       rs276161       rs276162       rs276163       rs276164       rs276165      

LRAT基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCCACAGGATGAAGAACC
58
TAAAGAGCGTGAAGTTGGAG
58
AAAGTTACCTACCAGACACTG
57
TCTTCTTTGGAGCATTCTTGTG
59
AGCACTAAGGGAGAACTTACTG
60
CTGTATTCTTCTACGTGATGTTCC
59
TATACAGACTGCCATGGCTC
59
GATAGTCAGTGTCTGGTAGGT
58
TTCCAGAGATTCCAGAGCTG
59
TTCTACGTGCCTTTGTCGT
60
TACTGCAGATATGGCACCC
59
AGAACACTTCTCTGATCACGA
59
TACTGCAGATATGGCACCC
59
AGAACACTTCTCTGATCACGA
59
GAAAGGATGTGGCAATGCA
59
ATTCTTCTACGTGCTGATGAC
58
TACTCAGGGATGAAGAACCC
59
TAAAGAGCGTGAAGTTGGAG
58
TATACAGACTGCCATGGCT
58
ATAGTCAGTGTCTGGTAGGT
57
      尚未收录相关数据

LRAT基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LRAT基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001523
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0001523
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0001972
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0005771
O95237 (UniProtKB)
ISS
GO:0005789
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0005791
O95237 (UniProtKB)
ISS
GO:0006776
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0006776
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0007601
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0016416
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0016416
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0016746
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0019841
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0032370
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0042572
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0042573
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0047173
O95237 (UniProtKB)
TAS
GO:0048471
O95237 (UniProtKB)
ISS
GO:0050896
O95237 (UniProtKB)
IEA
GO:0102279
O95237 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LRAT基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Leber Congenital Amaurosis 14 0.44 1 0 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Retinitis Pigmentosa 0.242367032 1 1 CLINVAR_GAD_ORPHANET
Leber Congenital Amaurosis 0.241628651 6 0 BeFree_CTD_human_ORPHANET
Optic Atrophy, Hereditary, Leber 0.12 2 0 CTD_human
Eye Diseases, Hereditary 0.12 1 0 CTD_human
Retinal Dystrophy, Early-Onset Severe, Lrat-Related 0.12 0 1 CLINVAR
RETINITIS PIGMENTOSA, JUVENILE, LRAT-RELATED 0.12 0 0 CLINVAR
Vitamin A Deficiency 0.12 1 0 CTD_human
Alzheimer's Disease 0.007101096 3 0 GAD
Blind Vision 0.00272435 1 0 LHGDN

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