LPA (lipoprotein(a))

symbol:
LPA
locus group:
protein-coding gene
location:
6q25.3-q26
gene_family:
alias symbol:
Lp(a)
alias name:
apolipoprotein(a)
entrez id:
4018
ensembl gene id:
ENSG00000198670
ucsc gene id:
uc063sqy.1
refseq accession:
NM_005577
hgnc_id:
HGNC:6667
approved reserved:
2001-06-22
6q25.3-q26
基因染色体位置图

LPA基因编码脂蛋白(a) [Lipoprotein(a), Lp(a)] 的核心蛋白组分载脂蛋白(a) [Apolipoprotein(a), apo(a)]。Lp(a)是一种特殊的低密度脂蛋白样颗粒,由apo(a)通过二硫键与载脂蛋白B-100 (apoB-100)结合形成。LPA基因属于纤溶酶原基因家族,该家族成员具有类似的结构特征,特别是含有多个kringle结构域(一种三环状蛋白模体)。LPA基因通过kringle IV类型2 (KIV-2)的重复次数多态性决定apo(a)的异构体大小,这是导致个体间Lp(a)水平差异的主要因素。Lp(a)在动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)和主动脉瓣狭窄中起重要作用,其致病机制可能涉及促动脉粥样硬化、促血栓形成和促炎作用。Lp(a)水平主要由遗传因素决定,几乎不受饮食或生活方式影响。LPA基因功能丧失突变可导致极低或检测不到的Lp(a)水平,而不会引起明显健康问题;反之,某些突变或KIV-2重复次数较少会导致Lp(a)水平升高,显著增加心血管疾病风险。Lp(a)水平高于50 mg/dL (或125 nmol/L)被认为是心血管疾病的独立危险因素。LPA过表达会导致Lp(a)水平升高,促进动脉粥样硬化斑块形成、增加血栓风险并可能加速主动脉瓣钙化;而LPA表达降低或缺失则可能具有心血管保护作用。目前正在开发针对LPA的RNA干扰疗法(如pelacarsen)和反义寡核苷酸疗法(如olpasiran)以特异性降低Lp(a)水平。LPA基因多态性在不同种族中存在显著差异,非裔人群通常具有较高的Lp(a)水平但心血管风险增加不明显,这可能与更多KIV-2重复次数产生的较小致动脉粥样硬化性apo(a)异构体有关。

The protein encoded by this gene is a serine proteinase that inhibits the activity of tissue-type plasminogen activator I. The encoded protein constitutes a substantial portion of lipoprotein(a) and is proteolytically cleaved, resulting in fragments that attach to atherosclerotic lesions and promote thrombogenesis. Elevated plasma levels of this protein are linked to atherosclerosis. Depending on the individual, the encoded protein contains 2-43 copies of kringle-type domains. The allele represented here contains 15 copies of the kringle-type repeats and corresponds to that found in the reference genome sequence. [provided by RefSeq, Dec 2009]

由该基因编码的蛋白质是一个丝氨酸蛋白酶抑制组织型纤溶酶原激活物I的活性的编码的蛋白质构成脂蛋白(a)的主要部分,并且蛋白水解切割,产生附加到动脉粥样硬化的片段病变和促进血栓形成。这种蛋白质的升高的血浆水平与动脉粥样硬化。取决于个体,编码的蛋白质含有三环式结构域的2-43份。这里表示的等位基因包含三环式重复15份,并对应于,在参照基因组序列中发现。 [由RefSeq的,2009年12月提供]

LPA基因的碱基序列:[NCBI]
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LPA基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2834       rs783148       rs783149       rs934266       rs1321195       rs1321196       rs1367209       rs1367210       rs1367211       rs1406889       rs1569933       rs1623955       rs1652507       rs1740428       rs1800589       rs1800769       rs1801693      

LPA基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCTTCTGAACAAGCACCA
59
GTGCCTTGATAACTCTGTCC
58
ATACTACCCAAATGCTGGCT
59
TCCCTCGTATAACAATAAGGAGC
60
TCCTTCTGAACAAGCACCA
59
GTGCCTTGATAACTCTGTCC
58
CCTTCTGAACAAGCACCAC
59
TATGCCTCGATAACTCCGTC
59
TTCTGAACAAGCACCAACTG
59
TATGTGCCTTGATAACTCTGTC
58
TTCTGAACAAGCACCAACTG
59
TATGTGCCTTGATAACTCTGTC
58
TCCTTCTGAAGAAGCACCA
59
GTGCCTCGATAACTCTGTC
58
ATACTACCCAAATGCTGGCT
59
TCCCTCGTATAACAATAAGGAGC
60
TCCTTCTGAACAAGCACCA
59
ATGCCTCGATAACTCCGTC
59
CTCCTTCTGAACAAGCACC
59
TGCCTTGATAACTCTGTCCA
59
      尚未收录相关数据

LPA基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LPA基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001968
P08519 (UniProtKB)
IPI
GO:0004252
P08519 (UniProtKB)
IDA
GO:0004866
P08519 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P08519 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08519 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08519 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P08519 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
P08519 (UniProtKB)
TAS
GO:0006508
P08519 (UniProtKB)
IEA
GO:0006629
P08519 (UniProtKB)
NAS
GO:0006869
P08519 (UniProtKB)
IEA
GO:0008015
P08519 (UniProtKB)
TAS
GO:0008201
P08519 (UniProtKB)
NAS
GO:0010951
P08519 (UniProtKB)
IEA
GO:0034185
P08519 (UniProtKB)
IPI
GO:0034358
P08519 (UniProtKB)
IDA
GO:0042157
P08519 (UniProtKB)
TAS

可能调控 LPA基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Coronary heart disease 0.271865777 52 5 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT_LHGDN
Coronary Artery Disease 0.149865994 39 3 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Cerebrovascular accident 0.13570741 14 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Cardiovascular Diseases 0.133625632 18 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Atherosclerosis 0.132691755 31 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Hypercholesterolemia 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Thromboembolism 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Venous Thrombosis 0.12 1 0 CTD_human
Lp(A) Deficiency, Congenital 0.12 0 1 CLINVAR
Aortic valve calcification 0.12 1 1 GWASCAT

联系方式

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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