LOXL3 (lysyl oxidase like 3)

symbol:
LOXL3
locus group:
protein-coding gene
location:
2p13.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
84695
ensembl gene id:
ENSG00000115318
ucsc gene id:
uc002smp.3
refseq accession:
NM_032603
hgnc_id:
HGNC:13869
approved reserved:
2001-06-27
2p13.1
基因染色体位置图

LOXL3(赖氨酰氧化酶样3,Lysyl Oxidase Like 3)属于赖氨酰氧化酶(LOX)基因家族,该家族包括LOX、LOXL1、LOXL2、LOXL3和LOXL4。这些基因编码的酶主要参与细胞外基质(ECM,Extracellular Matrix)的修饰,通过催化胶原蛋白和弹性蛋白的交联(Cross-linking)来维持组织的结构和稳定性。LOXL3与其他家族成员类似,含有铜离子结合位点和保守的赖氨酰氧化酶活性域,但其表达模式和功能存在特异性。LOXL3在胚胎发育、组织修复和纤维化过程中发挥重要作用,尤其在骨骼、心脏和神经系统的发育中表现突出。LOXL3的表达产物是一种分泌型酶,通过氧化脱氨反应(Oxidative Deamination)将胶原蛋白和弹性蛋白中的赖氨酸残基转化为活性醛基,促进分子间交联,从而增强基质的机械强度和稳定性。LOXL3的突变可能导致多种疾病,例如某些类型的埃勒斯-当洛斯综合征(Ehlers-Danlos Syndrome,一种结缔组织疾病)和脊柱侧凸(Scoliosis),因其突变会破坏胶原交联,导致组织脆弱或畸形。此外,LOXL3在癌症中的作用复杂,可能通过调节肿瘤微环境(Tumor Microenvironment)影响转移或侵袭。LOXL3过表达可能加剧纤维化疾病(如肝纤维化或肺纤维化),因其过度交联会导致组织硬化;而表达降低则可能引发育缺陷或伤口愈合障碍。LOXL3还与其他基因相互作用,例如调控TGF-β(转化生长因子-β)信号通路,该通路参与细胞增殖和分化。在基因家族中,LOXL成员均依赖铜离子和维生素B6作为辅因子,但各成员的组织分布和底物偏好不同。LOXL3的特异性功能仍在研究中,但其在发育和疾病中的独特作用日益受到关注。专业术语解释:细胞外基质(ECM)是细胞周围的支撑结构;交联指分子间形成共价连接以增强稳定性;氧化脱氨是移除氨基并生成醛基的化学反应;TGF-β通路是调控细胞生长的重要信号网络。

This gene encodes a member of the lysyl oxidase gene family. The prototypic member of the family is essential to the biogenesis of connective tissue, encoding an extracellular copper-dependent amine oxidase that catalyses the first step in the formation of crosslinks in collagens and elastin. A highly conserved amino acid sequence at the C-terminus end appears to be sufficient for amine oxidase activity, suggesting that each family member may retain this function. The N-terminus is poorly conserved and may impart additional roles in developmental regulation, senescence, tumor suppression, cell growth control, and chemotaxis to each member of the family. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been reported but their full-length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的赖氨酰氧化酶基因家族的一个成员。该家族的原型成员是结缔组织的生物合成必需的,编码胞外铜 - 依赖性胺氧化酶催化,在胶原和弹性蛋白的形成交联的第一个步骤。在C末端端部的高度保守的氨基酸序列显示为足以胺氧化酶的活性,这表明每个家庭成员可以保留该功能。 N末端是保守性差,可能传授发育调控,衰老,抑制肿瘤细胞的生长控制和趋化其他角色家庭的每个成员。可选地,该基因的剪接转录变异体已被报道,但其全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

LOXL3基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
LOXL3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2241028       rs368172016       rs370775486       rs374529449       rs538765870       rs542851656       rs553926019       rs561190922       rs748897152       rs755545814       rs757726930       rs763186469       rs768473330       rs771907224       rs774309646       rs776713533       rs777594437      

LOXL3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTGTGACTGAATGTGCCT
59
GTGATGCTCTACCTCAATGAC
59
GTGTCAGGAGGATGTCTCC
59
GTAGAGATCCCAGCAACCC
60
GTGTCAGGAGGATGTCTCC
59
GTAGAGATCCCAGCAACCC
60
CTCGAGAAGCTCTGAGTGG
60
TTCACTCAGGTGGATAGCAC
60
GTGTCAGGAGGATGTCTCC
59
GTAGAGATCCCAGCAACCC
60
AGTGTGACTGAATGTGCCT
59
GTGATGCTCTACCTCAATGAC
59
AGAGTGACTTTACCAACAATGC
59
GAAGGCATCACCAATGTGG
59
GTGTCAGGAGGATGTCTCC
59
GTAGAGATCCCAGCAACCC
60
CTACCGGCATGACATTGAC
58
GGTTGATGACAACCTGGAG
58
GTGTCAGGAGGATGTCTCC
59
GTAGAGATCCCAGCAACCC
60
      尚未收录相关数据

LOXL3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LOXL3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005044
B8ZZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005507
B8ZZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
B8ZZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
B8ZZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016641
B8ZZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
B8ZZT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005044
B9A025 (UniProtKB)
IEA
GO:0005507
B9A025 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
B9A025 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
B9A025 (UniProtKB)
IEA
GO:0016641
B9A025 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
B9A025 (UniProtKB)
IEA
GO:0005044
C9J5M1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
C9J5M1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
C9J5M1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005044
E7END4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005507
E7END4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
E7END4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
E7END4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016641
E7END4 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
E7END4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005044
H7C248 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
H7C248 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
H7C248 (UniProtKB)
IEA
GO:0001837
P58215 (UniProtKB)
IDA
GO:0004720
P58215 (UniProtKB)
NAS
GO:0005044
P58215 (UniProtKB)
IEA
GO:0005507
P58215 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
P58215 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P58215 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P58215 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
P58215 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
P58215 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
P58215 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
P58215 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
P58215 (UniProtKB)
IDA
GO:0055114
P58215 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LOXL3基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Intracranial Aneurysm 0.000271442 1 0 BeFree
Vascular lesions 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Stickler syndrome (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。